16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 1126

 
Base Pair (1126 : 1146)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 13 24 4 0.22 0.05 0.00 0.05 0.97 0.97 0.41 0.37 0.01 0.57 8513
3 6 13 0 0.00 0.03 0.00 0.03 0.97 0.97 0.86 0.83 0.01 0.65 7180
B 6 11 0 0.00 0.03 0.00 0.03 0.97 0.97 1.85 1.77 0.01 0.76 5859
A 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 1.00 2.00 1.59 0.02 0.72 264
C 2 9 2 0.36 0.21 0.85 1.06 0.85 0.86 1.17 0.57 0.03 0.81 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.03 0.00 0.00 1054
M 5 2 2 0.57 0.00 0.00 0.00 0.69 0.69 -0.26 -0.16 0.03 0.03 1160
 
Base Pair (1127 : 1145)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 71 130 24 0.24 0.12 0.00 0.12 0.44 0.47 0.10 -0.68 0.01 0.57 8513
3 60 114 21 0.24 0.12 0.00 0.12 0.45 0.47 0.49 -0.43 0.01 0.65 7180
B 58 111 21 0.25 0.13 0.00 0.13 0.44 0.46 1.41 0.26 0.01 0.76 5859
A 2 3 0 0.00 0.09 0.00 0.09 0.53 0.76 1.33 0.48 0.02 0.73 264
C 7 15 2 0.18 0.25 0.66 0.91 0.22 0.33 0.45 -0.26 0.00 0.79 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.03 0.00 0.00 1054
M 4 1 1 0.40 0.47 0.76 1.23 0.65 0.65 -0.28 -0.19 0.03 0.03 1160
 
 
Base Pair (1135 : 1139)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 99 93 17 0.18 0.05 0.00 0.05 0.03 0.62 -0.02 -0.41 0.05 0.52 8513
3 82 79 12 0.15 0.05 0.00 0.05 0.02 0.62 0.39 -0.14 0.05 0.59 7180
B 72 77 12 0.16 0.04 0.00 0.04 0.02 0.62 1.26 0.54 0.04 0.72 5859
A 10 2 0 0.00 0.05 0.00 0.05 0.00 0.03 0.74 -0.62 0.60 0.15 264
C 13 14 5 0.37 0.34 0.58 0.93 0.23 0.61 -0.27 -0.48 0.07 0.63 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 4 0 0 0.00 0.20 0.00 0.20 0.12 0.25 -0.24 -0.05 0.04 0.01 1160

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