16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 1179

 
Base Pair (1179 : 1212)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 129 166 24 0.16 0.14 0.00 0.14 0.73 0.73 1.25 0.91 0.00 0.82 8513
3 8 24 1 0.06 0.13 0.00 0.13 0.79 0.79 1.78 1.12 0.00 0.80 7180
B 2 14 1 0.12 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.99 1.93 0.00 0.78 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.94 1.95 0.00 0.74 264
C 1 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.97 1.87 1.83 0.00 0.91 182
E 6 10 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 1.27 1.33 0.00 0.96 1054
M 120 140 23 0.18 0.25 0.42 0.67 0.36 0.38 0.02 0.40 0.03 0.96 1160
 
Base Pair (1180 : 1211)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 83 93 12 0.14 0.29 0.86 1.16 0.81 0.82 1.19 1.04 0.01 0.82 8513
3 17 21 2 0.10 0.03 0.00 0.03 0.93 0.94 1.87 1.55 0.00 0.80 7180
B 4 10 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.96 1.92 0.00 0.78 5859
A 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.04 1.80 1.78 0.00 0.74 264
C 3 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.99 1.81 1.88 0.01 0.91 182
E 13 9 2 0.18 0.03 0.00 0.03 0.82 0.86 1.61 1.24 0.01 0.95 1054
M 63 72 10 0.15 0.16 0.00 0.16 0.10 0.11 0.12 0.10 0.11 0.88 1160
 
Base Pair (1181 : 1210)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 26 74 2 0.04 0.04 0.00 0.04 0.77 0.97 0.91 1.21 0.11 0.71 8513
3 11 43 0 0.00 0.04 0.00 0.04 0.79 0.99 1.87 1.16 0.01 0.79 7180
B 1 40 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 1.00 1.98 1.58 0.01 0.77 5859
A 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 1.95 1.96 0.00 0.73 264
C 1 3 1 0.50 0.00 0.00 0.00 0.90 0.97 1.74 1.59 0.00 0.91 182
E 9 3 0 0.00 0.18 0.00 0.18 0.06 0.97 1.55 1.74 0.00 0.95 1054
M 14 28 1 0.05 0.32 0.51 0.82 0.26 0.27 -0.58 1.52 0.85 0.14 1160
 
Base Pair (1182 : 1209)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 33 41 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.82 0.83 0.32 1.19 0.12 0.71 8513
3 22 8 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 0.84 1.07 1.83 0.00 0.80 7180
B 3 8 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.98 1.00 1.98 1.80 0.00 0.78 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.97 0.97 1.77 2.00 0.00 0.75 264
C 3 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.96 1.72 1.95 0.00 0.92 182
E 19 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.07 0.12 1.96 0.01 0.94 1054
M 8 32 0 0.00 0.21 0.52 0.72 0.47 0.50 -0.39 1.09 0.91 0.08 1160
 
 
Base Pair (1187 : 1203)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 39 43 5 0.12 0.21 0.74 0.95 0.72 0.90 1.12 0.64 0.00 0.82 8513
3 6 26 0 0.00 0.02 0.00 0.02 0.80 0.96 1.93 1.10 0.00 0.80 7180
B 1 15 0 0.00 0.02 0.00 0.02 0.99 1.00 1.98 1.88 0.00 0.77 5859
A 0 4 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 1.00 2.00 1.05 0.00 0.75 264
C 0 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 1.00 2.00 1.65 0.00 0.92 182
E 5 7 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.81 1.80 1.27 0.00 0.96 1054
M 33 14 5 0.21 0.11 0.00 0.11 0.30 0.56 0.12 1.31 0.01 0.98 1160
 
Base Pair (1188 : 1202)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 50 46 5 0.10 0.41 0.79 1.20 0.65 0.65 1.09 0.67 0.02 0.81 8513
3 15 27 1 0.05 0.75 0.94 1.70 0.77 0.77 1.05 1.17 0.03 0.79 7180
B 6 26 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.94 0.95 1.97 1.69 0.00 0.79 5859
A 2 0 0 0.00 0.04 0.00 0.04 0.00 0.01 1.40 1.92 0.00 0.75 264
C 0 7 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.46 0.46 2.00 0.92 0.00 0.92 182
E 7 1 1 0.25 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.70 1.99 0.17 0.80 1054
M 35 12 4 0.17 0.04 0.00 0.04 0.08 0.08 1.49 1.43 0.00 0.98 1160
 
Base Pair (1189 : 1201)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 166 70 14 0.12 0.25 0.56 0.81 0.41 0.41 0.49 0.68 0.00 0.84 8513
3 87 38 7 0.11 0.31 0.63 0.94 0.46 0.46 1.01 0.71 0.00 0.81 7180
B 82 29 4 0.07 0.01 0.00 0.01 0.58 0.58 1.23 1.24 0.00 0.80 5859
A 0 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 1.95 1.25 0.00 0.66 264
C 8 3 1 0.18 0.12 0.00 0.12 0.83 0.84 1.13 1.53 0.00 0.92 182
E 5 6 3 0.55 0.34 0.96 1.30 0.00 0.00 1.77 1.65 0.00 0.96 1054
M 71 29 6 0.12 0.32 0.78 1.10 0.07 0.08 0.77 1.13 0.00 0.99 1160
 
Base Pair (1190 : 1200)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 116 12 2 0.03 0.00 0.00 0.00 0.68 0.69 0.73 1.94 0.00 0.84 8513
3 23 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.80 1.11 1.96 0.00 0.82 7180
B 3 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.89 1.97 0.00 0.79 5859
A 6 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.18 0.18 0.19 2.00 0.00 0.75 264
C 6 1 1 0.29 0.07 0.00 0.07 0.91 0.91 1.48 1.95 0.00 0.92 182
E 14 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 0.04 1.45 1.99 0.00 0.96 1054
M 87 9 1 0.02 0.01 0.00 0.01 0.08 0.08 0.27 1.85 0.00 0.99 1160
 
Base Pair (1191 : 1199)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 10 12 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.95 1.91 0.00 0.85 8513
3 2 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.97 1.97 0.00 0.82 7180
B 1 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.99 1.98 0.00 0.80 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.95 2.00 0.00 0.75 264
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.95 2.00 0.00 0.92 182
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.98 1.98 0.00 0.96 1054
M 7 10 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.95 1.86 1.71 0.00 0.99 1160
 
Base Pair (1192 : 1198)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 71 51 8 0.13 0.01 0.00 0.01 0.56 0.71 1.00 1.18 0.00 0.84 8513
3 32 38 3 0.09 0.00 0.00 0.00 0.54 0.71 1.21 1.11 0.00 0.82 7180
B 24 35 2 0.07 0.00 0.00 0.00 0.62 0.64 1.78 1.04 0.00 0.79 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.75 264
C 8 3 1 0.18 0.16 0.00 0.16 0.90 0.95 1.40 1.81 0.00 0.92 182
E 8 3 1 0.18 0.00 0.00 0.00 0.05 0.96 1.45 1.88 0.00 0.96 1054
M 31 10 4 0.19 0.05 0.00 0.05 0.61 0.65 0.73 1.74 0.00 0.99 1160

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