16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 1264

 
Base Pair (1264 : 1279)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 208 36 7 0.06 0.09 0.00 0.09 0.21 0.24 -0.43 0.31 0.01 0.58 8513
3 185 30 5 0.05 0.10 0.00 0.10 0.20 0.23 -0.15 0.72 0.01 0.66 7180
B 177 29 5 0.05 0.10 0.00 0.10 0.20 0.24 0.51 1.67 0.01 0.77 5859
A 8 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.11 1.52 1.90 0.00 0.78 264
C 17 6 2 0.17 0.09 0.00 0.09 0.32 0.35 0.61 1.38 0.00 0.91 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 6 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 0.56 -0.38 -0.19 0.03 0.05 1160
 
Base Pair (1265 : 1278)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 220 264 34 0.14 0.14 0.00 0.14 0.29 0.37 -0.54 -0.82 0.01 0.58 8513
3 196 243 27 0.12 0.12 0.00 0.12 0.30 0.38 -0.28 -0.61 0.01 0.66 7180
B 189 228 26 0.12 0.12 0.00 0.12 0.30 0.39 0.36 0.06 0.01 0.77 5859
A 7 15 1 0.09 0.10 0.00 0.10 0.13 0.14 1.32 0.44 0.00 0.78 264
C 13 16 3 0.21 0.10 0.00 0.10 0.12 0.14 0.73 0.60 0.00 0.91 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 11 5 4 0.50 0.25 0.55 0.80 0.12 0.35 -0.33 -0.35 0.00 0.07 1160
 
Base Pair (1266 : 1277)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 149 35 2 0.02 0.04 0.00 0.04 0.95 0.96 0.28 0.28 0.12 0.59 8513
3 8 25 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.96 0.87 0.68 0.01 0.66 7180
B 5 16 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.99 1.79 1.70 0.00 0.78 5859
A 0 9 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 0.31 2.00 0.88 0.00 0.78 264
C 5 3 0 0.00 0.45 0.93 1.38 0.93 0.93 1.31 1.34 0.01 0.91 182
E 3 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.18 0.00 0.04 0.00 1054
M 136 7 2 0.03 0.21 0.85 1.06 0.83 0.88 -0.27 -0.32 0.84 0.06 1160
 
Base Pair (1267 : 1276)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 323 18 2 0.01 0.01 0.00 0.01 0.63 0.94 -0.16 0.42 0.12 0.59 8513
3 139 7 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.64 0.94 -0.02 0.85 0.00 0.66 7180
B 138 7 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.98 0.87 1.74 0.00 0.78 5859
A 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.96 2.00 0.00 0.78 264
C 21 5 0 0.00 0.08 0.00 0.08 0.73 0.94 0.93 1.38 0.02 0.90 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.08 0.00 0.01 0.00 1054
M 163 6 2 0.02 0.29 0.84 1.13 0.08 0.85 -0.04 -0.31 0.87 0.06 1160

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