16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 243


 
Base Pair (243 : 283)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 15 39 3 0.11 0.00 0.00 0.00 0.57 0.57 1.85 0.94 0.00 0.84 8513
3 5 31 1 0.06 0.00 0.00 0.00 0.61 0.62 1.96 1.02 0.00 0.87 7180
B 4 24 1 0.07 0.00 0.00 0.00 0.74 0.74 1.96 1.16 0.00 0.85 5859
A 0 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.55 0.55 2.00 1.01 0.00 0.84 264
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.94 1.95 0.00 0.93 182
E 1 4 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 1.96 1.94 0.00 0.97 1054
M 10 8 2 0.22 0.18 0.00 0.18 0.08 0.08 1.19 1.06 0.02 0.66 1160
 
Base Pair (244 : 282)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 7 9 2 0.25 0.23 0.00 0.23 1.00 1.00 1.88 1.91 0.00 0.84 8513
3 3 5 1 0.25 0.05 0.00 0.05 1.00 1.00 1.98 1.98 0.00 0.87 7180
B 3 3 1 0.33 0.06 0.00 0.06 1.00 1.00 1.97 1.98 0.00 0.85 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.84 264
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.88 2.00 0.01 0.92 182
E 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.99 1.98 0.00 0.97 1054
M 4 4 1 0.25 0.50 0.99 1.49 0.99 0.99 1.33 1.49 0.02 0.66 1160
 
Base Pair (245 : 281)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 46 127 5 0.06 0.24 0.66 0.90 0.31 0.86 0.93 1.18 0.00 0.84 8513
3 29 47 4 0.10 0.22 0.69 0.90 0.29 0.89 1.03 1.34 0.00 0.87 7180
B 24 10 2 0.12 0.01 0.00 0.01 0.26 1.00 1.17 1.90 0.00 0.85 5859
A 2 13 0 0.00 0.26 0.46 0.72 0.46 0.66 1.01 0.41 0.00 0.83 264
C 1 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.98 1.95 1.68 0.00 0.93 182
E 3 24 2 0.15 0.01 0.00 0.01 0.41 0.42 1.94 0.56 0.00 0.97 1054
M 16 74 1 0.02 0.03 0.00 0.03 0.56 0.64 0.91 0.32 0.02 0.66 1160


Last generated: Tue Oct 12 14:20:58 1999