16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 293


 
Base Pair (293 : 307)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 82 156 11 0.09 0.09 0.00 0.09 0.37 0.82 0.27 -0.00 0.00 0.77 8513
3 69 139 8 0.08 0.09 0.00 0.09 0.38 0.81 0.82 0.52 0.00 0.88 7180
B 59 122 8 0.09 0.06 0.00 0.06 0.44 0.81 1.04 0.58 0.00 0.86 5859
A 3 4 0 0.00 0.15 0.00 0.15 0.54 0.98 1.00 1.44 0.00 0.86 264
C 7 9 0 0.00 0.05 0.00 0.05 0.12 0.89 1.51 1.15 0.00 0.91 182
E 7 13 0 0.00 0.34 0.82 1.17 0.07 0.81 0.98 1.41 0.00 0.97 1054
M 6 8 3 0.43 0.33 0.74 1.07 0.30 0.91 -0.41 -0.38 0.00 0.08 1160
 
Base Pair (294 : 306)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 91 87 11 0.12 0.05 0.00 0.05 0.44 0.48 -0.16 0.77 0.00 0.77 8513
3 85 75 9 0.11 0.05 0.00 0.05 0.43 0.47 0.35 1.39 0.00 0.88 7180
B 58 65 6 0.10 0.08 0.00 0.08 0.51 0.55 0.65 1.32 0.00 0.87 5859
A 11 5 2 0.25 0.06 0.00 0.06 0.54 0.56 0.74 1.66 0.00 0.87 264
C 1 3 0 0.00 0.10 0.00 0.10 0.94 0.98 1.87 1.68 0.00 0.92 182
E 16 5 1 0.09 0.02 0.00 0.02 0.03 0.03 0.64 1.77 0.00 0.97 1054
M 5 9 2 0.29 0.08 0.00 0.08 0.45 0.47 -0.42 -0.36 0.00 0.08 1160
 
Base Pair (295 : 305)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 82 47 3 0.05 0.02 0.00 0.02 0.72 0.78 0.20 1.09 0.00 0.76 8513
3 65 37 2 0.04 0.01 0.00 0.01 0.72 0.77 0.76 1.75 0.00 0.86 7180
B 48 26 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.89 0.96 1.51 1.80 0.00 0.85 5859
A 10 7 2 0.23 0.19 0.00 0.19 0.06 0.11 0.75 1.34 0.00 0.88 264
C 9 3 0 0.00 0.03 0.00 0.03 0.66 0.98 1.09 1.78 0.00 0.92 182
E 7 4 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 1.12 1.70 0.02 0.95 1054
M 8 7 1 0.13 0.29 0.78 1.07 0.78 0.83 -0.40 -0.38 0.00 0.08 1160


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