16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 409

 
Base Pair (409 : 423)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 90 28 4 0.07 0.03 0.00 0.03 0.10 0.62 -0.39 0.20 0.03 0.58 8513
3 73 6 3 0.08 0.02 0.00 0.02 0.10 0.64 -0.21 0.51 0.04 0.66 7180
B 73 6 3 0.08 0.02 0.00 0.02 0.10 0.64 0.64 1.34 0.05 0.81 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 264
C 4 6 1 0.20 0.08 0.00 0.08 0.01 0.04 1.79 1.41 0.00 0.88 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 13 16 0 0.00 0.38 0.59 0.96 0.09 0.46 -0.54 -0.59 0.01 0.07 1160
 
Base Pair (410 : 422)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 13 117 2 0.03 0.01 0.00 0.01 0.68 0.79 0.50 -0.30 0.00 0.61 8513
3 5 86 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.69 0.79 0.82 -0.08 0.00 0.69 7180
B 5 86 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.69 0.79 1.93 0.79 0.00 0.85 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 264
C 1 14 1 0.13 0.01 0.00 0.01 0.36 0.94 1.83 0.56 0.00 0.88 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 7 17 1 0.08 0.37 0.55 0.92 0.55 0.68 -0.49 -0.53 0.01 0.06 1160
 
Base Pair (411 : 421)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 20 71 2 0.04 0.08 0.00 0.08 0.86 0.86 0.49 0.01 0.00 0.60 8513
3 9 38 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.89 0.83 0.33 0.00 0.68 7180
B 9 38 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.88 0.89 1.94 1.32 0.00 0.83 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 264
C 5 12 1 0.12 0.36 0.54 0.91 0.43 0.44 0.87 0.46 0.00 0.90 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 6 21 1 0.07 0.21 0.46 0.67 0.37 0.37 -0.39 -0.56 0.01 0.06 1160
 
Base Pair (412 : 420)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 142 96 6 0.05 0.05 0.00 0.05 0.39 0.41 -0.34 0.15 0.00 0.61 8513
3 120 60 3 0.03 0.04 0.00 0.04 0.39 0.41 -0.16 0.43 0.00 0.69 7180
B 120 60 3 0.03 0.04 0.00 0.04 0.39 0.41 0.70 1.45 0.00 0.84 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 264
C 13 22 2 0.11 0.42 0.59 1.01 0.28 0.31 0.63 0.65 0.00 0.90 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 9 14 1 0.09 0.10 0.00 0.10 0.66 0.71 -0.39 -0.53 0.02 0.07 1160
 
Base Pair (413 : 419)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 15 103 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.80 0.99 0.52 -0.04 0.02 0.59 8513
3 3 86 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.99 0.83 0.19 0.02 0.67 7180
B 3 86 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.81 0.99 1.95 1.00 0.03 0.82 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 264
C 6 10 0 0.00 0.07 0.00 0.07 0.83 0.94 1.54 1.33 0.00 0.90 182
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1054
M 6 7 0 0.00 0.29 0.58 0.88 0.39 0.80 -0.40 -0.42 0.01 0.06 1160

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