16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 564


 
Base Pair (564 : 886)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 193 46 9 0.08 0.05 0.00 0.05 0.49 0.93 0.70 1.38 0.00 0.77 8513
3 64 9 4 0.11 0.06 0.00 0.06 0.52 0.98 0.95 1.74 0.00 0.79 7180
B 50 8 4 0.14 0.10 0.00 0.10 0.62 0.99 1.01 1.69 0.00 0.76 5859
A 10 1 0 0.00 0.04 0.00 0.04 0.21 0.99 1.26 1.93 0.00 0.81 264
C 7 2 1 0.22 0.19 0.00 0.19 0.18 0.96 1.29 1.60 0.00 0.89 182
E 4 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.98 1.34 1.98 0.00 0.94 1054
M 113 35 4 0.05 0.12 0.00 0.12 0.34 0.50 -0.08 1.07 0.04 0.70 1160
 
Base Pair (565 : 885)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 84 26 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.03 0.93 1.38 1.85 0.00 0.76 8513
3 2 4 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.97 1.95 0.00 0.77 7180
B 1 4 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.97 1.94 0.00 0.74 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.96 2.00 0.00 0.81 264
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 1.00 1.83 2.00 0.01 0.87 182
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.99 1.99 0.00 0.94 1054
M 81 22 0 0.00 0.08 0.00 0.08 0.26 0.47 -0.09 1.49 0.04 0.70 1160
 
Base Pair (566 : 884)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 24 84 6 0.11 0.28 0.80 1.08 0.01 0.74 1.39 0.80 0.00 0.78 8513
3 1 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 1.97 1.32 0.00 0.78 7180
B 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.96 1.98 0.00 0.75 5859
A 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.96 2.00 0.00 0.80 264
C 3 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 1.00 1.84 2.00 0.00 0.89 182
E 0 4 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.99 1.93 0.00 0.95 1054
M 20 78 6 0.12 0.15 0.00 0.15 0.09 0.14 1.04 0.52 0.01 0.73 1160
 

 
Base Pair (570 : 880)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 37 49 10 0.23 0.59 0.89 1.49 0.75 0.76 1.03 1.26 0.00 0.78 8513
3 17 15 3 0.19 0.66 0.91 1.57 0.73 0.74 1.02 1.27 0.00 0.78 7180
B 11 9 1 0.10 0.00 0.00 0.00 0.93 0.94 1.64 1.88 0.00 0.75 5859
A 4 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.33 1.82 0.00 0.82 264
C 3 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.94 1.68 1.90 0.00 0.89 182
E 2 4 2 0.67 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 1.91 0.00 0.95 1054
M 17 32 7 0.29 0.14 0.00 0.14 0.82 0.90 1.26 1.26 0.00 0.76 1160


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