16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 827


 
Base Pair (827 : 873) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 90 16 1 0.02 0.01 0.00 0.01 0.92 0.92 1.22 1.09 0.07 0.74 8513
3 37 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.93 1.59 1.97 0.00 0.83 7180
B 18 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.96 0.96 1.73 1.99 0.00 0.81 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.88 264
C 3 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 0.98 1.87 2.00 0.00 0.91 182
E 19 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.80 0.80 1.07 1.90 0.00 0.96 1054
M 50 15 1 0.03 0.06 0.00 0.06 0.41 0.41 -0.08 -0.69 0.50 0.12 1160
 
Base Pair (828 : 872) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 183 64 4 0.03 0.03 0.00 0.03 0.11 0.11 0.45 1.37 0.01 0.79 8513
3 70 11 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.10 0.10 0.81 1.81 0.00 0.82 7180
B 47 5 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.12 1.00 1.95 0.00 0.79 5859
A 5 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.15 0.15 1.02 2.00 0.00 0.87 264
C 9 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.03 1.12 1.89 0.02 0.88 182
E 18 6 0 0.00 0.04 0.00 0.04 0.02 0.03 0.65 1.35 0.00 0.95 1054
M 104 51 4 0.05 0.13 0.00 0.13 0.17 0.20 -0.63 -0.15 0.09 0.61 1160


Last generated: Tue Oct 12 14:20:58 1999