16S rRNA Lousy Base Pair Statistics for Helical Element 888


 
Base Pair (888 : 912)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 120 36 7 0.09 0.11 0.00 0.11 0.66 0.79 0.89 1.19 0.00 0.80 8513
3 45 13 4 0.14 0.18 0.00 0.18 0.78 0.94 1.33 1.18 0.00 0.77 7180
B 28 9 3 0.16 0.34 0.95 1.29 0.93 0.94 1.53 1.80 0.00 0.74 5859
A 6 1 0 0.00 0.02 0.00 0.02 0.56 1.00 1.02 1.93 0.00 0.81 264
C 10 3 1 0.15 0.04 0.00 0.04 0.73 0.75 0.97 1.77 0.00 0.90 182
E 11 3 1 0.14 0.00 0.00 0.00 0.15 0.95 1.11 1.97 0.00 0.94 1054
M 65 20 2 0.05 0.16 0.00 0.16 0.08 0.09 0.37 1.41 0.01 0.98 1160
 
Base Pair (889 : 911)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 6 26 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.95 0.95 1.95 1.70 0.00 0.80 8513
3 2 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.95 1.97 0.00 0.77 7180
B 1 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.96 1.96 0.00 0.74 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.96 2.00 0.00 0.81 264
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.93 2.00 0.00 0.89 182
E 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.98 2.00 0.00 0.94 1054
M 4 23 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.73 0.73 1.92 1.12 0.00 0.98 1160
 
Base Pair (890 : 910)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 58 38 4 0.08 0.01 0.00 0.01 0.82 0.82 1.27 1.83 0.00 0.81 8513
3 17 7 1 0.08 0.00 0.00 0.00 0.96 0.96 1.78 1.88 0.00 0.77 7180
B 16 5 1 0.09 0.01 0.00 0.01 0.97 0.97 1.77 1.97 0.00 0.74 5859
A 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.93 2.00 0.00 0.82 264
C 3 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.98 1.81 1.77 0.00 0.90 182
E 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.95 1.98 1.62 0.00 0.94 1054
M 38 29 3 0.09 0.09 0.00 0.09 0.12 0.13 1.05 1.67 0.00 0.99 1160
 
Base Pair (891 : 909)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 9 5 1 0.14 0.04 0.00 0.04 1.00 1.00 1.95 1.96 0.00 0.81 8513
3 6 5 1 0.18 0.03 0.00 0.03 0.99 1.00 1.94 1.96 0.00 0.77 7180
B 5 4 1 0.22 0.05 0.00 0.05 1.00 1.00 1.95 1.95 0.00 0.74 5859
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.82 264
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.90 182
E 1 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.99 1.98 0.00 0.94 1054
M 3 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.94 1.99 0.00 0.99 1160


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