23S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 2288


 
Base Pair (2288 : 2344)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.2 -- 0.1* 64.7* 0.1 -- 0.1 -- -- -- 0.2* 0.2 -- -- -- 3.5 30.7 848
3 -- -- -- 93.6* -- -- -- -- -- -- 0.5* 0.5 -- -- -- 5.5 -- 437
B -- -- -- 92.1 -- -- -- -- -- -- -- 0.4 -- -- -- 7.5 -- 241
A -- -- -- 92.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 7.3 -- 41
C -- -- -- 95.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 4.9 -- 102
E -- -- -- 96.1* -- -- -- -- -- -- 1.3* 0.6 -- -- -- 1.9 -- 154
M 0.6* -- 0.3* 13.9* 0.3 -- 0.3 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.3 84.1 309
 
Base Pair (2289 : 2343)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 10.5 -- 0.1* 1.9 56.6* -- -- 0.2* -- -- -- -- -- -- -- -- 30.7 848
3 17.4 -- -- 0.7 81.5* -- -- 0.5* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 437
B 17.4 -- -- 0.4 82.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 241
A 75.6 -- -- -- 24.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 41
C -- -- -- 2.0 98.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 102
E 1.9 -- -- 1.3 95.5* -- -- 1.3* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 154
M 4.2 -- 0.3* 3.6 7.8* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 84.1 309


Last generated: Sat Oct 16 11:41:28 1999