23S rRNA Tentative Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2288


 
Base Pair (2288 : 2344)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 15 4 2 0.21 0.08 0.00 0.08 0.94 0.94 0.22 0.43 0.01 0.56 1045
3 9 1 1 0.20 0.07 0.00 0.07 0.94 0.94 1.62 1.96 0.00 0.69 630
B 7 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.92 1.58 2.00 0.00 0.74 326
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.93 0.93 1.62 2.00 0.00 1.00 41
C 4 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.95 0.95 1.72 2.00 0.00 0.99 103
E 2 1 1 0.67 0.33 0.97 1.31 0.96 0.96 1.73 1.90 0.00 0.59 262
M 2 3 1 0.40 0.50 0.94 1.44 0.94 0.96 -0.41 -0.45 0.02 0.16 312
 
Base Pair (2289 : 2343)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 8 15 3 0.26 0.03 0.00 0.03 0.18 1.00 0.35 0.05 0.00 0.56 1045
3 3 11 1 0.14 0.03 0.00 0.03 0.18 1.00 1.91 1.32 0.00 0.69 630
B 1 6 1 0.29 0.00 0.00 0.00 0.18 1.00 1.96 1.33 0.00 0.74 326
A 0 3 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.76 1.00 2.00 1.20 0.00 1.00 41
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 1.00 1.86 2.00 0.00 0.99 103
E 2 2 0 0.00 0.29 0.97 1.25 0.03 0.99 1.83 1.79 0.00 0.59 262
M 4 4 2 0.50 0.04 0.00 0.04 0.51 1.00 -0.46 -0.51 0.02 0.16 312


Last generated: Sat Oct 16 11:41:29 1999