23S rRNA Tentative Base Pair Frequencies for Helical Element 2789


 
Base Pair (2789 : 2894)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.7 53.6* 2.0* -- 1.0* 1.2 0.2 -- 0.5 2.7 -- 0.2 0.5 0.5 -- 1.2 35.5 403
3 1.0* 57.4* 1.6* -- 0.3 1.0 -- -- 0.6 2.6 -- 0.3 0.3 0.6 -- 1.6 32.6 310
B -- 88.1* 2.0 -- -- 1.5 -- -- -- 4.0 -- -- -- 0.5 -- 2.5* 1.5 202
A 7.7* -- 2.6* -- 2.6 -- -- -- 5.1* -- -- 2.6* 2.6 2.6 -- -- 74.4 39
C -- 76.0* 6.0* -- 4.0* 4.0 2.0 -- -- 6.0 -- -- 2.0 -- -- -- -- 50
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 68
M -- -- -- -- 2.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 97.7 43
 
Base Pair (2790 : 2893)     Collective Score
Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
T 0.5* 0.5 15.2* 0.7 -- 1.2 3.2 -- 22.6* 2.7 0.5 2.7* 0.7 0.7 2.2 5.4 41.0 407
3 0.6* 0.6 17.8* 0.3 -- 1.6 4.1 -- 25.8* 0.6 0.6 1.3* 1.0 0.3 1.9 6.7 36.6 314
B 1.0* -- 27.7* 0.5 -- 2.0 6.4 -- 40.1* -- 1.0 2.0* 0.5 0.5 2.5 10.4 5.4 202
A -- 5.1 -- -- -- 2.6 -- -- -- 5.1* -- -- 5.1 -- 2.6* -- 79.5 39
C -- -- 12.0 4.0 -- -- -- -- 20.0* 18.0* -- 14.0 -- 4.0 6.0* 2.0 20.0 50
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 72
M -- -- -- -- -- -- -- -- 2.3 -- -- -- -- -- -- -- 97.7 43


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