23S rRNA Tentative Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2789


 
Base Pair (2789 : 2894)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 18 15 6 0.36 0.27 0.88 1.15 0.87 0.91 -0.49 -0.16 0.23 0.25 1045
3 14 6 2 0.20 0.26 0.89 1.15 0.89 0.91 -0.21 -0.05 0.06 0.33 630
B 6 6 2 0.33 0.24 0.92 1.16 0.92 0.93 1.53 1.39 0.00 0.61 326
A 8 0 0 0.00 0.57 0.70 1.27 0.40 0.50 0.06 -0.81 0.71 0.24 41
C 4 4 3 0.75 0.42 0.86 1.28 0.82 0.90 1.16 1.13 0.00 0.49 103
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.09 -0.70 0.26 0.00 262
M 0 5 1 0.40 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 -0.07 -0.53 0.63 0.00 312
 
Base Pair (2790 : 2893)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 21 27 5 0.21 0.51 0.70 1.20 0.29 0.31 -0.80 -0.68 0.27 0.23 1045
3 16 20 2 0.11 0.52 0.72 1.24 0.31 0.33 -0.62 -0.67 0.12 0.32 630
B 11 18 1 0.07 0.56 0.75 1.31 0.31 0.33 0.34 0.30 0.04 0.59 326
A 5 1 1 0.33 0.17 0.00 0.17 0.25 0.38 -0.64 -0.61 0.27 0.19 41
C 5 5 3 0.60 0.40 0.55 0.95 0.20 0.20 -0.44 0.21 0.10 0.39 103
E 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.09 -0.83 0.29 0.00 262
M 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.06 -0.79 0.63 0.00 312


Last generated: Sat Oct 16 11:41:29 1999