23S rRNA Tentative Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2081

 
Base Pair (2081 : 2239) Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 46 9 3 0.11 0.06 0.00 0.06 0.27 0.92 0.46 0.31 0.19 0.61 1045
3 17 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 1.00 1.05 1.98 0.00 0.69 630
B 14 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 1.00 1.03 2.00 0.00 0.74 326
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 41
C 2 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 1.00 1.81 1.90 0.01 0.96 103
E 3 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.99 1.59 1.94 0.00 0.58 262
M 27 8 3 0.17 0.13 0.00 0.13 0.16 0.49 0.38 -0.82 0.65 0.32 312
 
Base Pair (2082 : 2237) (Tertiary)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 28 27 6 0.22 0.38 0.86 1.24 0.13 0.15 0.90 -0.06 0.18 0.61 1045
3 0 8 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.03 1.95 1.54 0.00 0.69 630
B 0 6 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.91 1.60 0.01 0.74 326
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 1.84 0.00 1.00 41
C 2 4 0 0.00 0.71 0.94 1.65 0.15 0.15 1.39 1.23 0.00 0.97 103
E 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.07 0.07 1.93 1.50 0.00 0.58 262
M 26 15 6 0.29 0.37 0.55 0.92 0.52 0.63 0.10 -0.83 0.63 0.32 312
 
Base Pair (2083 : 2236)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 65 66 29 0.44 0.32 0.63 0.95 0.31 0.77 -0.06 0.29 0.03 0.74 1045
3 17 19 6 0.33 0.29 0.81 1.10 0.19 0.92 1.13 1.09 0.00 0.69 630
B 14 11 4 0.32 0.22 0.76 0.98 0.19 0.89 1.12 1.24 0.00 0.74 326
A 0 2 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 1.00 1.84 1.29 0.00 1.00 41
C 15 9 4 0.33 0.17 0.00 0.17 0.10 0.32 0.13 1.01 0.00 0.97 103
E 3 6 2 0.44 0.53 0.90 1.43 0.17 0.96 1.26 1.08 0.00 0.58 262
M 33 38 19 0.54 0.48 0.62 1.10 0.62 0.70 -0.45 -0.31 0.06 0.74 312

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