23S rRNA Tentative Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 858


 
Base Pair (858 : 919)     Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 8 9 3 0.35 0.06 0.00 0.06 0.08 0.98 0.51 0.26 0.01 0.61 1045
3 6 6 2 0.33 0.05 0.00 0.05 0.09 0.99 1.77 1.42 0.00 0.78 630
B 2 1 1 0.67 0.67 1.00 1.66 0.00 1.00 1.89 1.93 0.00 0.75 326
A 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 1.00 2.00 1.59 0.00 0.90 41
C 1 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 1.00 1.92 2.00 0.00 0.97 103
E 4 4 1 0.25 0.17 0.00 0.17 0.05 0.97 1.62 1.49 0.00 0.80 262
M 1 3 1 0.50 0.14 0.00 0.14 0.09 0.94 -0.40 -0.44 0.04 0.15 312
 
Base Pair (859 : 918) (Tertiary)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 3 3 0 0.00 0.07 0.00 0.07 0.00 0.01 0.61 0.54 0.01 0.61 1045
3 1 2 0 0.00 0.12 0.00 0.12 0.00 0.01 1.95 1.84 0.00 0.78 630
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 2.00 0.00 0.75 326
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 2.00 0.00 0.90 41
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.90 2.00 0.01 0.96 103
E 1 2 0 0.00 0.12 0.00 0.12 0.00 0.02 1.90 1.68 0.00 0.80 262
M 2 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 -0.41 -0.37 0.03 0.15 312
 
Base Pair (860 : 917) (Tertiary)   Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel PNuc Seq
T 1 2 1 0.67 0.20 0.00 0.20 0.99 0.99 0.62 0.59 0.01 0.61 1045
3 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.98 1.95 0.00 0.78 630
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.75 326
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.90 41
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.90 2.00 0.01 0.96 103
E 0 1 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.95 1.90 0.00 0.80 262
M 1 1 1 1.00 0.25 0.94 1.19 0.94 0.94 -0.41 -0.38 0.04 0.15 312


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