| Base Pair (107 : 214) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | 84.1* | 11.0* | -- | 2.4 | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | 82 |
| B | -- | -- | 76.8* | 11.6* | -- | -- | 2.9 | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | 7.2 | -- | -- | 69 |
| C | -- | -- | 99.3* | 0.3* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 303 |
| Z | -- | -- | 99.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | -- | -- | 23.9* | 76.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | -- | 6.7* | 43.3* | -- | -- | 33.3 | 3.3 | -- | -- | 3.3 | -- | -- | -- | 3.3 | -- | -- | 6.7 | 30 |
| Base Pair (108 : 213) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 57.3* | 20.7* | 13.4* | 3.7* | -- | 2.4 | 1.2 | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | 85.5* | 10.1* | -- | 1.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | 69 |
| C | 93.7* | 5.3* | -- | 0.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.7 | 302 |
| Z | 0.8* | 99.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | -- | 95.7* | -- | 2.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 43.3* | 13.3* | 26.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 10.0 | -- | -- | -- | 6.7 | 30 |
| Base Pair (109 : 212) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 15.9* | 68.3* | 1.2* | 4.9* | -- | 7.3 | -- | -- | -- | -- | 2.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | 10.1* | 88.4* | 1.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | -- | 99.0 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 302 |
| Z | 4.8* | 0.8* | -- | 94.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 88.2* | -- | 11.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 54.3* | -- | -- | 43.5* | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 6.7* | 36.7* | -- | 3.3* | -- | 10.0 | -- | -- | -- | -- | 6.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 36.7 | 30 |
| Base Pair (110 : 211) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 28.0* | -- | 13.4* | 52.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 4.9 | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | 15.9* | 1.4* | 66.7* | 10.1* | -- | 1.4 | -- | 1.4 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | 69 |
| C | 89.7* | 4.6* | 2.3* | 0.3* | 2.3 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 302 |
| Z | 96.0* | -- | 0.8* | 1.6* | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 88.2* | -- | -- | 11.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 80.4* | -- | 2.2 | 4.3 | 8.7 | -- | 4.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 26.7* | -- | 26.7* | -- | -- | 6.7 | -- | -- | -- | 3.3 | -- | -- | -- | 23.3 | -- | -- | 13.3 | 30 |
| Base Pair (111 : 209) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 13.4* | -- | 20.7* | 52.4* | 4.9 | 1.2 | -- | 2.4 | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 3.7 | -- | -- | 82 |
| B | 81.2* | -- | 5.8* | 5.8* | 4.3 | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 95.4* | 0.3 | 0.7 | 0.3* | 1.3 | 1.3* | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 303 |
| Z | 25.0 | 0.8* | -- | -- | -- | -- | -- | 74.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 80.0* | -- | 3.3* | 3.3* | -- | -- | -- | 3.3 | -- | -- | -- | 3.3 | -- | -- | -- | -- | 6.7 | 30 |
| Base Pair (112 : 208) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 31.7 | -- | -- | 23.2 | 43.9* | -- | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | 11.6 | -- | -- | 8.7 | 79.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 7.3 | -- | -- | 0.7 | 92.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 302 |
| Z | 3.2 | -- | -- | 0.8 | 96.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | 47.1* | 5.9* | -- | -- | 47.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 10.9 | -- | -- | 10.9 | 78.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 60.0* | 3.3* | -- | 16.7* | 10.0 | 3.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 6.7 | 30 |
| Base Pair (113 : 207) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 69.5 | -- | -- | 2.4 | -- | -- | 25.6 | -- | -- | -- | 1.2 | 82 |
| B | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 73.9 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | 23.2 | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 56.1 | -- | -- | -- | -- | -- | 42.9 | -- | -- | -- | 1.0 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 45.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 52.2 | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 3.3 | -- | 3.3 | -- | -- | -- | 56.7* | -- | -- | -- | 3.3* | -- | 16.7 | -- | -- | -- | 16.7 | 30 |
| Base Pair (114 : 206) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | 8.5 | -- | -- | 81.7* | -- | 3.7 | -- | -- | 1.2* | 1.2 | -- | -- | -- | 3.7 | 82 |
| B | -- | -- | 1.4 | 4.3 | -- | -- | 89.9 | -- | 2.9 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | -- | -- | -- | 12.2 | -- | -- | 60.4* | 2.6 | 24.4 | -- | -- | -- | -- | 0.3* | -- | -- | -- | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | 0.8* | -- | 95.2* | 3.2 | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | -- | -- | 11.8 | -- | -- | 76.5 | 5.9 | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 65.2 | -- | 30.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4.3 | 46 |
| U | -- | -- | -- | 9.7 | -- | -- | 9.7* | 9.7 | 9.7 | -- | -- | 25.8* | -- | -- | 3.2* | 3.2 | 29.0 | 31 |
| Base Pair (117 : 204) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 13.4* | 17.1* | 42.7* | 12.2* | 7.3 | 6.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 82 |
| B | 2.9* | 14.5* | 49.3* | 17.4* | 1.4 | 8.7 | -- | -- | -- | 4.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 69 |
| C | 8.3 | 41.7* | 24.5* | 10.3 | 11.9* | 2.6 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 302 |
| Z | 0.8* | 96.0* | 0.8* | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 17.6 | 11.8* | 23.5* | 17.6 | 29.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 41.3 | 8.7* | -- | 4.3 | 45.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 22.6* | 16.1 | 3.2 | 6.5* | 9.7 | 29.0* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 12.9 | 31 |
| Base Pair (118 : 203) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 2.4* | 68.3* | 18.3* | 4.9* | -- | 3.7 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 82 |
| B | 10.1* | 71.0* | 11.6* | 4.3* | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 69 |
| C | 9.6* | 88.7* | 0.3* | 0.3* | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 302 |
| Z | 0.8* | 97.6* | 0.8* | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 5.9* | 11.8* | 41.2* | 41.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 34.8* | 50.0* | 2.2* | 2.2* | 6.5 | 4.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 29.0* | 12.9* | 22.6* | 6.5* | 3.2 | 9.7 | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 12.9 | 31 |
| Base Pair (119 : 202) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 7.3* | 42.7* | 23.2* | 7.3* | 3.7 | 2.4 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 4.9 | 4.9 | 2.4 | 82 |
| B | 2.9* | 46.4* | 36.2* | 2.9* | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 1.4 | 5.8 | 69 |
| C | -- | 91.4* | 4.6* | -- | 2.6* | 1.0 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 303 |
| Z | -- | 73.4* | 4.8 | -- | -- | 4.0 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | 14.5* | 2.4 | 124 |
| D | -- | 17.6* | 11.8* | 41.2* | 11.8 | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 11.8 | 17 |
| E | 2.2* | 78.3* | 4.3* | 4.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | 8.7 | 46 |
| U | 3.2* | 25.8* | 35.5* | 6.5* | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | 3.2 | -- | 3.2 | 16.1 | 31 |
| Base Pair (120 : 201) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 69 |
| C | -- | -- | 1.7 | -- | -- | 2.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.0 | 93.1 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (121 : 200) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 69 |
| C | -- | 2.6* | -- | 0.3 | -- | 0.7 | 0.3* | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 0.3 | -- | -- | -- | 95.4 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (126 : 196) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2* | -- | 1.2 | -- | 2.4* | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 93.9 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 97.1 | 69 |
| C | 3.0 | 6.3* | 10.2 | 1.0 | 5.0 | 0.7 | 3.3 | 0.3* | 0.3 | 2.3 | -- | -- | 56.1* | 4.0 | -- | 5.3* | 2.3 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
| Base Pair (127 : 195) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | 1.2* | 1.2* | -- | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.1 | 82 |
| B | -- | 1.4 | 7.2* | 4.3 | 7.2* | 1.4 | 5.8 | -- | 1.4* | 2.9 | 2.9* | 1.4 | 1.4 | 1.4 | -- | 4.3 | 56.5 | 69 |
| C | 0.3* | 76.8* | 10.9* | 2.6* | 0.3 | 2.0 | -- | -- | -- | 0.7 | 0.3 | 0.3 | 0.3 | 2.0 | -- | 0.3 | 3.0 | 302 |
| Z | -- | 0.8 | -- | -- | -- | 12.1* | -- | -- | 1.6 | -- | -- | -- | 0.8* | 1.6 | -- | -- | 83.1 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 6.5 | 28.3* | 4.3* | 6.5 | 23.9* | 6.5 | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 19.6 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
| Base Pair (128 : 194) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.7 | -- | 95.1 | 82 |
| B | -- | -- | -- | 7.2 | -- | 1.4 | 2.9* | -- | 2.9 | -- | -- | 2.9 | -- | 1.4* | 4.3 | 10.1* | 66.7 | 69 |
| C | 4.6* | 37.1* | 32.8* | 19.2* | -- | 2.3 | -- | -- | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 2.0 | 0.7 | 0.7 | 302 |
| Z | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 15.3 | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | 83.1 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 28.3* | 15.2* | 10.9* | 10.9* | 8.7 | 2.2 | -- | 2.2 | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 19.6 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
| Base Pair (129 : 193) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.3 | 82 |
| B | 1.4 | -- | -- | 4.3 | 1.4* | -- | 4.3* | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | 4.3* | 4.3 | 78.3 | 69 |
| C | 12.9* | 26.5* | 41.1* | 16.2* | 2.0 | 0.3 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | 302 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 17.4* | 19.6* | 17.4* | 4.3* | 10.9 | 4.3 | 2.2 | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 19.6 | 46 |
| U | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 31 |
| Base Pair (131 : 192) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | 2.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.6 | 82 |
| B | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4.3 | 94.2 | 69 |
| C | 8.3* | 23.8* | 34.3* | 24.8* | 1.7 | 0.7 | -- | 2.0 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | -- | 2.3 | 0.3 | 1.3 | 303 |
| Z | 0.8* | 0.8* | 1.6* | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | 95.2 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | 4.3 | 2.2 | 4.3 | -- | 4.3 | -- | -- | 4.3* | 2.2 | 4.3* | -- | -- | 2.2 | 4.3 | 6.5* | 60.9 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (132 : 191) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | 2.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.6 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | 98.6 | 69 |
| C | 26.1* | 16.2* | 18.8* | 31.7* | 0.3 | 2.6 | -- | 0.7 | -- | -- | 0.3 | 0.7 | 0.3 | 0.7 | 0.7 | 0.3 | 0.7 | 303 |
| Z | -- | 0.8* | 0.8 | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.6* | 96.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 2.2 | -- | 2.2 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 6.5* | -- | 2.2* | -- | 4.3* | -- | -- | 2.2* | 78.3 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 30 |
| Base Pair (133 : 190) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.4 | -- | -- | -- | 97.6 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 69 |
| C | 35.5* | 7.3* | 6.6* | 44.2* | 4.0 | 0.7 | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.7 | 301 |
| Z | -- | -- | 0.8* | 1.6* | -- | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 96.8 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | 4.3* | -- | -- | 2.2* | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 2.2 | -- | -- | -- | 2.2 | 87.0 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (134 : 189) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.4 | 97.6 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 69 |
| C | 15.8* | 47.9* | 3.6* | 26.4* | 1.0 | 0.7 | 0.3 | 0.7 | 2.6 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.7 | 303 |
| Z | -- | -- | 0.8 | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.4 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 2.2* | 2.2* | 2.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 93.5 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (135 : 187) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.4 | 97.6 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 69 |
| C | 1.3* | 17.8* | 78.2* | 1.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 0.3 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | -- | 4.3* | -- | -- | -- | -- | 2.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 93.5 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (136 : 182) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.9 | 97.1 | 69 |
| C | -- | 0.7* | 1.0* | 97.0* | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.7 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 2.2* | 2.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.7 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (137 : 181) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
| C | -- | 99.7* | -- | 0.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 95.7 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (138 : 180) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 82 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.6 | 69 |
| C | 0.7* | 93.1* | 4.6* | 0.7* | -- | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 95.7 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
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