Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 107

 
Base Pair (107 : 214)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.69 0.95 1.64 0.95 0.98 1.41 1.30 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.50 0.88 1.38 0.88 0.88 1.30 1.12 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.50 1.00 1.50 1.00 1.00 1.94 1.97 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.93 2.00 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.21 1.21 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.13 0.00 0.13 0.54 0.89 0.65 0.45 0.02 0.68 41
 
Base Pair (108 : 213)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.89 0.95 1.84 0.95 0.98 0.40 0.48 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.80 0.97 1.77 0.97 0.97 1.27 1.42 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.67 1.60 0.01 0.98 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.93 1.93 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.50 0.98 1.48 0.98 0.98 1.85 1.74 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.80 0.89 1.69 0.89 0.89 0.23 0.04 0.02 0.68 41
 
Base Pair (109 : 212)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.69 0.90 1.60 0.90 0.98 0.71 0.96 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.42 1.42 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 1.97 1.94 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.65 1.65 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.48 1.48 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.95 0.98 1.93 0.98 0.98 1.00 0.88 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.38 0.74 1.11 0.74 0.89 -0.54 0.28 0.19 0.46 41
 
Base Pair (110 : 211)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.87 0.94 1.81 0.94 0.94 0.36 0.63 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.83 0.94 1.77 0.94 0.96 0.74 0.61 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.73 0.97 1.71 0.97 1.00 1.51 1.36 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.60 0.98 1.58 0.98 0.98 1.77 1.76 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.48 1.48 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.22 0.85 1.07 0.87 0.96 1.43 1.11 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.44 0.62 1.06 0.62 0.69 0.15 -0.07 0.02 0.63 41
 
 
Base Pair (111 : 209)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.72 0.87 1.58 0.87 0.93 0.50 0.54 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.62 0.93 1.54 0.93 0.99 1.21 1.06 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.38 0.97 1.36 0.97 1.00 1.77 1.66 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.03 0.00 0.03 0.26 0.26 1.12 1.93 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.50 0.93 1.43 0.93 0.93 0.76 0.81 0.02 0.68 41
 
Base Pair (112 : 208)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.02 0.00 0.02 0.55 0.99 1.20 1.09 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 1.00 1.57 1.48 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 1.00 1.94 1.62 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.04 1.00 1.93 1.79 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.11 0.00 0.11 0.53 1.00 1.00 1.68 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.22 1.00 1.50 1.50 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.60 0.86 1.46 0.86 1.00 0.49 0.27 0.02 0.68 41
 
Base Pair (113 : 207) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.82 2.00 0.01 0.99 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 1.12 1.89 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 2.00 0.01 0.98 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.79 0.99 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 2.00 2.00 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.02 0.87 2.00 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.12 0.00 0.12 0.08 0.08 0.21 0.58 0.07 0.61 41
 
Base Pair (114 : 206) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.08 0.00 0.08 0.09 0.09 1.69 1.11 0.01 0.96 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.06 1.78 1.55 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.01 0.00 0.01 0.12 0.12 1.97 0.55 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.00 0.01 1.93 1.66 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.12 2.00 0.86 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.65 0.91 0.02 0.96 46
U 0 0 0 0.00 0.29 0.55 0.83 0.14 0.14 -0.05 -0.66 0.10 0.54 41
 
 
Base Pair (117 : 204)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.76 0.86 1.62 0.86 1.00 0.12 0.04 0.00 0.99 82
B 0 0 0 0.00 0.71 0.85 1.56 0.85 0.96 0.44 0.31 0.01 0.94 72
C 0 0 0 0.00 0.63 0.78 1.41 0.85 1.00 0.13 0.20 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.40 0.98 1.38 0.98 0.98 1.81 1.70 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.50 0.65 1.15 0.71 1.00 0.19 0.19 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.16 0.00 0.16 0.54 1.00 1.32 0.67 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.56 1.00 -0.37 -0.23 0.00 0.66 41
 
Base Pair (118 : 203)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.84 0.95 1.79 0.95 0.99 0.67 0.78 0.00 0.99 82
B 0 0 0 0.00 0.95 0.99 1.93 0.99 1.00 0.69 0.65 0.01 0.94 72
C 0 0 0 0.00 0.91 0.99 1.90 0.99 0.99 1.43 1.43 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.67 0.99 1.66 0.99 1.00 1.81 1.87 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.34 0.34 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.78 0.89 1.67 0.89 1.00 0.60 0.56 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.72 0.81 1.54 0.81 0.96 -0.37 -0.46 0.00 0.66 41
 
Base Pair (119 : 202)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.69 0.82 1.51 0.82 0.89 0.14 0.01 0.00 0.98 82
B 0 0 0 0.00 0.88 0.94 1.82 0.94 0.95 0.41 0.21 0.03 0.90 72
C 0 0 0 0.00 0.85 0.99 1.83 0.96 1.00 1.48 1.56 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.60 0.90 1.50 0.80 0.84 1.09 0.91 0.02 0.97 125
D 0 0 0 0.00 0.62 0.80 1.42 0.80 1.00 -0.37 0.06 0.00 0.79 19
E 0 0 0 0.00 0.83 0.98 1.81 0.98 0.98 0.75 0.67 0.00 0.91 46
U 0 0 0 0.00 0.73 0.85 1.58 0.85 0.88 -0.38 -0.38 0.00 0.63 41
 
Base Pair (120 : 201)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.07 0.00 0.01 0.00 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.08 -0.76 0.21 0.00 72
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.24 0.57 1.11 -0.35 0.90 0.07 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (121 : 200)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.14 0.00 0.02 0.00 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.08 -0.76 0.24 0.00 72
C 0 0 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.64 0.79 -0.85 -0.40 0.58 0.05 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.17 0.04 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
 
Base Pair (126 : 196) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.33 0.60 0.93 0.00 0.00 -0.44 -0.30 0.04 0.06 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.34 -0.77 0.33 0.03 72
C 0 0 0 0.00 0.29 0.70 0.98 0.21 0.27 0.58 0.69 0.00 0.97 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.49 0.00 0.17 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.11 -0.67 0.28 0.02 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.35 -0.14 0.05 0.02 41
 
Base Pair (127 : 195)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.50 1.00 -0.37 -0.26 0.04 0.05 82
B 0 0 0 0.00 0.32 0.43 0.75 0.30 0.50 -0.92 -0.86 0.17 0.42 72
C 0 0 0 0.00 0.69 0.94 1.62 0.94 0.96 1.03 0.97 0.02 0.96 305
Z 0 0 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.05 0.76 -0.53 -0.36 0.00 0.17 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.54 0.70 1.24 0.57 0.95 -0.51 -0.47 0.00 0.80 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.35 -0.14 0.05 0.02 41
 
Base Pair (128 : 194)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.25 -0.35 -0.22 0.04 0.05 82
B 0 0 0 0.00 0.19 0.00 0.19 0.22 0.26 -0.69 -0.77 0.26 0.32 72
C 0 0 0 0.00 0.91 0.94 1.85 0.94 0.97 0.25 0.16 0.01 0.98 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.05 -0.36 -0.36 0.00 0.17 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.71 0.81 1.52 0.81 0.95 -0.59 -0.64 0.00 0.80 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.35 -0.14 0.05 0.02 41
 
Base Pair (129 : 193)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.00 0.33 -0.41 -0.19 0.05 0.04 82
B 0 0 0 0.00 0.33 0.47 0.80 0.27 0.33 -0.73 -0.65 0.38 0.21 72
C 0 0 0 0.00 0.95 0.97 1.92 0.97 0.99 0.12 0.10 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.36 0.00 0.17 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.64 0.73 1.37 0.73 0.92 -0.60 -0.70 0.00 0.80 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.26 -0.14 0.05 0.02 41
 
 
Base Pair (131 : 192)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.30 -0.12 0.04 0.02 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.25 0.25 -0.83 -0.20 0.53 0.06 72
C 0 0 0 0.00 0.88 0.92 1.80 0.92 0.95 0.06 0.02 0.00 0.98 305
Z 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.67 0.67 -0.56 -0.27 0.12 0.05 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.27 0.39 0.66 0.28 0.39 -0.87 -0.81 0.35 0.39 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.28 0.00 0.05 0.00 41
 
Base Pair (132 : 191)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.22 -0.12 0.02 0.02 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.80 -0.08 0.54 0.01 72
C 0 0 0 0.00 0.90 0.93 1.84 0.93 0.96 0.03 -0.02 0.01 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.33 0.60 0.93 0.60 0.60 -0.27 -0.22 0.01 0.04 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.57 0.70 1.27 0.20 0.30 -0.73 -0.79 0.48 0.22 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.14 0.00 0.05 0.00 41
 
Base Pair (133 : 190)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.26 -0.12 0.02 0.02 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.94 0.00 0.58 0.00 72
C 0 0 0 0.00 0.90 0.94 1.84 0.94 0.99 0.36 0.36 0.00 0.98 305
Z 0 0 0 0.00 0.50 0.75 1.25 0.75 0.75 -0.22 -0.19 0.01 0.03 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.25 0.50 0.75 0.33 0.50 -0.46 -0.90 0.30 0.13 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.14 0.00 0.02 0.00 41
 
Base Pair (134 : 189)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.19 -0.12 0.01 0.02 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.71 0.00 0.56 0.00 72
C 0 0 0 0.00 0.89 0.94 1.84 0.94 0.96 0.28 0.38 0.01 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 1.00 -0.17 -0.10 0.02 0.02 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.32 -0.77 0.24 0.06 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.14 0.00 0.02 0.00 41
 
 
Base Pair (135 : 187) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.19 -0.12 0.01 0.02 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.96 0.00 0.56 0.00 72
C 0 0 0 0.00 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 1.05 1.09 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.10 0.00 0.02 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.67 0.67 -0.28 -0.44 0.04 0.06 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.14 0.00 0.02 0.00 41
 
 
Base Pair (136 : 182)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.12 0.00 0.02 0.00 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.89 -0.25 0.44 0.03 72
C 0 0 0 0.00 0.71 0.99 1.71 0.99 1.00 1.79 1.77 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.10 0.00 0.02 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.22 -0.22 0.00 0.04 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (137 : 181)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.12 0.00 0.02 0.00 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 -0.95 -0.08 0.44 0.01 72
C 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.97 1.97 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.10 0.00 0.02 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 -0.17 -0.22 0.00 0.04 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (138 : 180)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.12 0.00 0.02 0.00 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 -0.88 -0.08 0.36 0.01 72
C 0 0 0 0.00 0.90 0.99 1.89 0.99 1.00 1.59 1.58 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.09 0.00 0.02 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.50 -0.17 -0.22 0.00 0.04 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41

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