| Base Pair (262 : 312) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 9.8* | -- | -- | 90.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | 91.3* | -- | 2.9* | 5.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 41.9* | 46.5* | 1.7* | 7.9* | 0.7 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.7 | 303 |
| Z | 99.2* | -- | -- | 0.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 22.2* | -- | 2.2* | 75.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 |
| U | 9.7* | 58.1* | -- | 19.4* | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.7 | 31 |
| Base Pair (264 : 311) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 98.3 | -- | -- | -- | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.7 | 302 |
| Z | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 94.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | 17 |
| E | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 |
| U | 90.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.7 | 31 |
| Base Pair (265 : 310) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | 98.8 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | 1.4* | -- | -- | 91.3* | 5.8 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 0.3* | 0.3* | -- | 96.7* | 1.3 | -- | -- | 0.7 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | 98.4 | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | -- | -- | 94.1 | -- | -- | -- | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | -- | 93.2* | 6.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 44 |
| U | -- | 9.7* | -- | 67.7* | 6.5 | -- | -- | 6.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.7 | 31 |
| Base Pair (266 : 309) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | 98.8* | 1.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | -- | 91.3* | 5.8* | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 5.6* | 92.1* | 0.3* | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.7 | 303 |
| Z | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | 88.2* | -- | 11.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | -- | -- | -- | 26.7 | 71.1* | 2.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 |
| U | -- | 38.7* | 38.7* | 3.2 | 6.5* | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.7 | 31 |
| Base Pair (267 : 308) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82 |
| B | -- | 5.8* | 88.4* | 1.4* | -- | 2.9 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | -- | 1.7* | 97.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 303 |
| Z | -- | 1.6* | 91.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 7.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 44 |
| U | -- | 45.2* | 45.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.7 | 31 |
| Base Pair (268 : 307) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | 89.0 | 6.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 3.7 | 82 |
| B | 5.8* | -- | 4.3* | 78.3* | -- | -- | -- | -- | 5.8 | 1.4 | -- | 2.9 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | 69 |
| C | 27.1* | 12.2* | 4.3* | 54.1* | -- | 0.7 | -- | 0.3 | 1.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 303 |
| Z | 3.2* | 92.7* | 1.6* | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 76.5* | -- | -- | 23.5* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 44 |
| U | 9.7* | 3.2* | -- | 77.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 9.7 | 31 |
| Base Pair (280 : 298) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 2.4* | 1.2* | 13.4* | 70.7* | 7.3 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 1.2 | 1.2 | 82 |
| B | 5.8* | 7.2* | 23.2* | 49.3* | 4.3 | -- | -- | -- | 1.4 | -- | -- | -- | -- | 2.9 | -- | 5.8 | -- | 69 |
| C | 90.1* | 1.3* | 2.6* | 1.3* | 3.0 | 0.3 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.0 | 302 |
| Z | 4.0 | -- | -- | 31.5 | 62.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | 0.8 | -- | 124 |
| D | 11.8 | -- | -- | -- | 82.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.9 | -- | 17 |
| E | 56.5* | -- | -- | 2.2* | 41.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | 19.4 | -- | -- | 3.2 | 64.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 12.9 | 31 |
| Base Pair (281 : 297) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | 12.2* | 48.8* | 30.5* | 1.2 | 3.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 1.2 | -- | 1.2 | 82 |
| B | 5.8* | 18.8* | 40.6* | 18.8* | 2.9 | 1.4 | 2.9 | -- | -- | 4.3 | 1.4 | -- | -- | -- | 1.4 | 1.4 | -- | 69 |
| C | 0.7 | 35.0 | 5.0 | 1.7 | 2.6* | 54.1* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.7 | -- | -- | 0.3 | 303 |
| Z | -- | 21.0* | 78.2* | -- | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | 58.8* | 5.9 | -- | 11.8* | 5.9 | 17.6* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | -- | 28.3 | 2.2 | -- | -- | 26.1* | -- | -- | -- | -- | 28.3* | -- | -- | -- | 13.0 | -- | 2.2 | 46 |
| U | 25.8* | 16.1* | -- | 3.2* | 22.6 | 3.2 | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | 12.9 | 3.2 | -- | -- | 9.7 | 31 |
| Base Pair (282 : 296) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | 68.3* | 17.1* | 1.2* | -- | 6.1 | -- | -- | -- | 4.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.4 | 82 |
| B | 8.7* | 37.7* | 37.7* | 10.1* | -- | 4.3 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 69 |
| C | 9.9* | 17.5* | 24.8* | 4.3* | 9.2 | 12.5 | -- | -- | 0.3 | 0.3 | -- | -- | 1.7 | -- | -- | -- | 19.5 | 303 |
| Z | -- | 23.4* | 65.3* | -- | -- | 11.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 124 |
| D | -- | -- | 17.6 | 11.8* | 5.9 | 64.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 6.7* | 28.9 | 6.7 | -- | 4.4 | 44.4* | -- | -- | 6.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 45 |
| U | 9.7* | 45.2* | 12.9* | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | 6.5 | -- | -- | -- | 12.9 | -- | 9.7 | 31 |
| Base Pair (283 : 295) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 1.2* | 14.6* | 43.9* | 20.7* | 4.9 | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 2.4 | 4.9 | 6.1 | 82 |
| B | 1.4* | 15.9* | 37.7* | 37.7* | 2.9 | -- | -- | -- | -- | 2.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 69 |
| C | 16.2* | 19.1* | 19.8* | 12.2* | 1.0 | 6.3 | -- | 0.3 | 0.3 | 1.7 | 0.7 | -- | 1.0 | 0.3 | 0.3 | 1.0 | 19.8 | 303 |
| Z | -- | 93.5* | 0.8* | -- | -- | 0.8 | -- | -- | -- | 1.6 | -- | -- | -- | -- | 0.8 | 0.8 | 1.6 | 124 |
| D | 11.8* | -- | 5.9* | 52.9* | 29.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 32.6* | 8.7 | -- | 10.9 | 10.9 | 2.2 | -- | -- | 13.0* | 4.3* | -- | -- | 2.2 | 10.9 | -- | 2.2* | 2.2 | 46 |
| U | 29.0* | 22.6* | 6.5* | 12.9* | 6.5 | 3.2 | -- | -- | -- | -- | 3.2 | -- | -- | 3.2 | -- | -- | 12.9 | 31 |
| Base Pair (284 : 294) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 6.1* | 12.2* | 30.5* | 29.3* | 6.1 | 2.4 | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 11.0 | 82 |
| B | 7.2* | 5.8* | 46.4* | 29.0* | -- | 1.4 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.9 | 5.8 | 69 |
| C | 18.8* | 14.9* | 17.8* | 12.9* | 2.0 | 2.0 | 2.3 | 1.0 | 1.0 | 0.7 | -- | 0.3 | 0.7 | 1.0 | 0.3 | 1.3 | 23.1 | 303 |
| Z | -- | -- | 94.4* | 1.6* | -- | 0.8 | 0.8 | -- | -- | 0.8 | 0.8* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.8 | 124 |
| D | 35.3* | 11.8* | 47.1* | -- | 5.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 17.4 | 8.7* | 10.9* | 17.4 | 19.6* | 2.2 | -- | 2.2* | -- | -- | 2.2 | 2.2 | -- | -- | 6.5 | 4.3 | 6.5 | 46 |
| U | 22.6* | 19.4* | 3.2 | 3.2 | 3.2 | 3.2 | 3.2* | 3.2 | -- | 3.2 | -- | -- | 9.7 | 3.2 | -- | -- | 22.6 | 31 |
| Base Pair (285 : 293) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 4.9* | 2.4* | 20.7* | 46.3* | -- | -- | 2.4 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 1.2 | 20.7 | 82 |
| B | 1.4* | 8.7* | 31.9* | 30.4* | 5.8 | 1.4 | 1.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.4 | 17.4 | 69 |
| C | 21.5* | 12.5* | 16.5* | 6.9* | 2.3 | 2.0 | 0.3 | 0.3 | 0.3 | 0.3 | -- | 0.3 | 1.0 | 0.7 | 1.0 | 0.3 | 33.7 | 303 |
| Z | -- | -- | -- | 5.6 | -- | 0.8 | 1.6 | 0.8 | 79.8* | -- | -- | 0.8* | -- | -- | -- | -- | 10.5 | 124 |
| D | -- | 64.7* | 29.4* | 5.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 17 |
| E | 13.0* | 21.7* | 13.0* | 2.2* | 2.2 | 13.0 | 6.5 | -- | -- | 2.2 | 2.2 | 4.3 | 2.2 | 4.3 | 4.3 | 2.2 | 6.5 | 46 |
| U | 9.7* | 6.5* | 9.7* | 9.7* | 6.5 | 3.2 | -- | -- | 3.2 | -- | -- | -- | -- | 3.2 | 9.7 | -- | 38.7 | 31 |
| Base Pair (286 : 292) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 3.7* | 3.7* | 22.0* | 12.2* | 2.4 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 2.4 | 52.4 | 82 |
| B | 1.4* | 2.9* | 26.1* | 26.1* | 1.4 | 1.4 | -- | 1.4 | 2.9 | -- | -- | 1.4 | -- | 1.4 | -- | 2.9 | 30.4 | 69 |
| C | 6.3* | 10.6* | 17.8* | 9.9* | -- | 5.6 | 0.3 | 1.0 | 0.3 | -- | 0.3 | 0.7 | 0.3 | -- | 1.0 | 0.3 | 45.5 | 303 |
| Z | 0.8 | -- | -- | 4.0 | -- | -- | -- | 79.8 | 3.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 12.1 | 124 |
| D | -- | -- | 5.9* | 29.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 64.7 | 17 |
| E | -- | 23.9* | 21.7* | 4.3* | 2.2 | 6.5 | -- | -- | -- | 15.2 | 2.2 | 6.5 | -- | -- | 2.2 | 4.3 | 10.9 | 46 |
| U | 6.5* | 22.6* | 9.7* | 3.2* | -- | 6.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.2 | 3.2 | -- | 45.2 | 31 |
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