Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 262

 
Base Pair (262 : 312) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.54 1.54 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.49 1.49 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.98 0.99 1.96 0.99 0.99 0.56 0.48 0.01 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.93 1.93 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.09 1.00 0.00 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.90 0.96 1.86 0.96 0.96 0.21 0.26 0.00 0.68 41
 
 
Base Pair (264 : 311) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 1.00 1.97 1.87 0.01 0.98 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.94 2.00 1.68 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.35 1.35 0.00 0.68 41
 
Base Pair (265 : 310) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.99 2.00 1.90 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.93 0.99 1.62 1.78 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.22 0.98 1.20 0.98 0.99 1.78 1.89 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.98 1.00 1.88 2.00 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.94 2.00 1.68 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.64 1.65 0.00 0.96 46
U 0 0 0 0.00 0.43 0.86 1.29 0.86 0.93 0.58 0.58 0.00 0.68 41
 
Base Pair (266 : 309) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.90 1.90 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.67 0.97 1.64 0.97 1.00 1.57 1.68 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.82 0.99 1.80 0.99 0.99 1.60 1.54 0.01 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.48 1.48 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.08 0.00 0.08 0.27 1.00 1.02 1.85 0.00 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.88 0.93 1.80 0.89 1.00 0.01 0.10 0.00 0.68 41
 
Base Pair (267 : 308) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.62 0.96 1.58 0.96 0.99 1.52 1.47 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.71 0.99 1.71 0.99 0.99 1.86 1.82 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.18 0.00 0.18 0.93 0.93 1.57 1.88 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.96 46
U 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.44 0.44 0.00 0.68 41
 
Base Pair (268 : 307) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.99 1.28 2.00 0.04 0.96 82
B 0 0 0 0.00 0.47 0.88 1.35 0.88 0.88 1.12 1.06 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.95 0.98 1.93 0.98 0.98 0.44 0.41 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.51 1.51 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.21 1.21 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.96 46
U 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.71 0.71 0.00 0.68 41
 
 
Base Pair (280 : 298)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.61 0.89 1.50 0.89 0.96 0.77 1.00 0.01 0.99 82
B 0 0 0 0.00 0.71 0.86 1.57 0.86 0.90 0.33 0.47 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.59 0.96 1.56 0.96 1.00 1.49 1.45 0.01 0.98 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.35 0.98 0.98 1.76 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.12 0.94 1.68 1.48 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.05 0.00 0.05 0.59 1.00 1.85 1.01 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.26 1.00 1.15 0.52 0.02 0.66 41
 
Base Pair (281 : 297)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.85 0.93 1.78 0.93 0.98 0.54 0.37 0.01 0.99 82
B 0 0 0 0.00 0.73 0.84 1.57 0.84 0.88 0.20 0.23 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.06 0.00 0.06 0.42 0.99 0.70 1.38 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.96 0.99 1.96 0.99 0.99 1.19 1.26 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.71 0.88 1.60 0.76 1.00 0.55 0.62 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.38 0.56 0.93 0.31 0.58 0.89 0.71 0.02 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.30 0.50 0.80 0.50 0.79 0.29 -0.41 0.00 0.68 41
 
Base Pair (282 : 296)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.62 0.89 1.51 0.89 0.95 1.01 0.94 0.01 0.98 82
B 0 0 0 0.00 0.91 0.94 1.85 0.94 0.99 0.28 0.30 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.57 0.70 1.27 0.70 0.97 -0.50 -0.60 0.00 0.80 305
Z 0 0 0 0.00 0.67 0.89 1.56 0.89 1.00 1.22 1.07 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.33 0.76 1.10 0.29 1.00 1.17 0.71 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.12 0.00 0.12 0.43 0.93 0.23 0.86 0.00 0.96 46
U 0 0 0 0.00 0.50 0.75 1.25 0.75 0.79 0.14 0.07 0.00 0.68 41
 
Base Pair (283 : 295)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.73 0.86 1.59 0.86 0.91 0.01 0.04 0.01 0.94 82
B 0 0 0 0.00 0.90 0.94 1.85 0.94 0.97 0.17 0.32 0.00 0.94 72
C 0 0 0 0.00 0.79 0.84 1.63 0.84 0.93 -0.68 -0.67 0.01 0.80 305
Z 0 0 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.96 0.97 1.64 1.57 0.01 0.98 125
D 0 0 0 0.00 0.38 0.71 1.08 0.71 1.00 0.75 1.17 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.30 0.53 0.83 0.53 0.67 0.30 0.03 0.00 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.72 0.81 1.54 0.81 0.93 -0.38 -0.40 0.00 0.66 41
 
Base Pair (284 : 294)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.81 0.88 1.69 0.88 0.97 -0.32 -0.28 0.01 0.89 82
B 0 0 0 0.00 0.88 0.94 1.82 0.94 0.95 0.11 0.06 0.00 0.90 72
C 0 0 0 0.00 0.78 0.84 1.62 0.84 0.89 -0.76 -0.77 0.00 0.76 305
Z 0 0 0 0.00 0.50 0.98 1.48 0.97 0.98 1.63 1.66 0.00 0.98 125
D 0 0 0 0.00 0.89 0.94 1.83 0.94 1.00 0.60 0.35 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.29 0.44 0.74 0.58 0.81 -0.25 0.04 0.04 0.94 46
U 0 0 0 0.00 0.41 0.58 1.00 0.62 0.71 -0.53 -0.66 0.00 0.58 41
 
Base Pair (285 : 293)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.85 0.94 1.79 0.94 0.94 -0.22 -0.23 0.00 0.79 82
B 0 0 0 0.00 0.80 0.88 1.68 0.88 0.96 -0.38 -0.27 0.01 0.79 72
C 0 0 0 0.00 0.80 0.87 1.67 0.87 0.93 -0.84 -0.86 0.02 0.66 305
Z 0 0 0 0.00 0.08 0.00 0.08 0.06 0.07 1.71 0.80 0.08 0.89 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.83 0.83 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.39 0.54 0.93 0.54 0.70 -0.22 -0.22 0.00 0.94 46
U 0 0 0 0.00 0.50 0.58 1.08 0.58 0.74 -0.88 -0.90 0.02 0.46 41
 
Base Pair (286 : 292)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.76 0.87 1.63 0.87 0.92 -0.85 -0.81 0.02 0.48 82
B 0 0 0 0.00 0.70 0.81 1.51 0.81 0.85 -0.44 -0.55 0.04 0.67 72
C 0 0 0 0.00 0.73 0.82 1.55 0.82 0.92 -0.90 -0.96 0.02 0.54 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.05 1.78 0.80 0.10 0.87 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.46 -0.46 0.00 0.32 19
E 0 0 0 0.00 0.40 0.56 0.96 0.56 0.66 0.08 -0.17 0.02 0.89 46
U 0 0 0 0.00 0.60 0.76 1.37 0.76 0.88 -0.85 -0.76 0.00 0.41 41

Last generated: Mon Sep 20 12:28:08 1999