| Base Pair (332 : 367) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 35.8* | 3.7* | 13.6* | 22.2* | 2.5 | 2.5 | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 18.5 | 81 |
| B | 1.7* | 5.2* | 5.2* | 10.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.4 | 74.1 | 58 |
| C | 0.3* | 13.0* | 40.3* | 1.0* | 1.0 | 8.9 | 0.7 | -- | 2.4 | -- | -- | -- | 1.0 | 0.3 | -- | -- | 31.1 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | 80.4* | 8.7* | 4.3* | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 4.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (333 : 366) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 7.4* | 8.6* | 40.7* | 21.0* | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 19.8 | 81 |
| B | 1.7* | 3.4* | 6.9* | 6.9* | -- | -- | 1.7 | -- | 1.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.4 | 74.1 | 58 |
| C | 2.7 | 42.3* | 8.9* | 1.4 | 4.1* | 6.8 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.7 | -- | -- | 0.3 | 1.7 | 30.7 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 8.7* | 52.2* | 15.2* | 4.3* | -- | 19.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (334 : 365) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 4.9* | 3.7* | 16.0* | 54.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | 19.8 | 81 |
| B | 1.7* | 3.4* | 5.2* | 6.9* | -- | 1.7 | 5.2 | 1.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 74.1 | 58 |
| C | 3.4 | 34.4* | 18.4* | 2.7 | 4.4* | 4.1 | -- | -- | 0.7 | -- | 0.3 | 0.7 | 0.7 | -- | 0.3 | -- | 29.9 | 294 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 8.7* | 30.4* | 23.9* | 8.7* | 4.3 | 10.9 | 2.2 | -- | 4.3 | -- | -- | -- | 4.3 | -- | -- | -- | 2.2 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (335 : 364) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 3.7* | 7.4* | 13.6* | 50.6* | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 1.2 | -- | -- | 21.0 | 81 |
| B | -- | 5.2* | 3.4* | 8.6* | 1.7 | -- | 1.7 | 1.7 | -- | -- | 1.7 | -- | -- | -- | 1.7 | -- | 74.1 | 58 |
| C | 6.1* | 28.3* | 4.1* | 24.9* | 1.0 | 1.7 | -- | 0.7 | 0.7 | 0.7 | -- | -- | 0.7 | -- | -- | -- | 31.1 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 20.0* | 33.3* | 13.3* | 13.3* | -- | 15.6 | -- | -- | -- | 2.2 | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (336 : 363) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 11.1* | 1.2* | 32.1* | 23.5* | 1.2 | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 28.4 | 81 |
| B | 5.2* | 5.2* | 3.4* | 3.4* | -- | 1.7 | -- | 3.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.7 | 3.4 | 72.4 | 58 |
| C | 14.3* | 23.1* | 7.5* | 18.0* | 1.0 | 0.3 | 0.3 | -- | 1.4 | 0.3 | 0.7 | -- | 0.3 | 0.3 | 0.7 | 0.3 | 31.3 | 294 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 15.2* | 19.6* | 26.1* | 19.6* | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | 6.5 | 2.2 | -- | -- | 8.7 | -- | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (337 : 362) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 11.1* | -- | 24.7* | 28.4* | 2.5 | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 30.9 | 81 |
| B | 3.4* | -- | 3.4* | 5.2* | 3.4 | -- | 3.4 | -- | 1.7 | 1.7 | -- | 3.4 | -- | -- | -- | -- | 74.1 | 58 |
| C | 13.0* | 0.3* | 13.3* | 29.0* | 1.7 | 2.4 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | -- | 0.7 | 0.3 | -- | -- | 38.6 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 28.3* | 4.3* | 15.2* | 19.6* | 4.3 | 4.3 | 2.2 | 6.5 | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | 2.2 | 10.9 | -- | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (338 : 361) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 12.3* | 4.9* | 14.8* | 21.0* | 2.5 | -- | 2.5 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 39.5 | 81 |
| B | -- | -- | 3.4* | 8.6* | -- | -- | 1.7 | 1.7 | -- | 1.7 | -- | 1.7 | -- | -- | 1.7 | 1.7 | 77.6 | 58 |
| C | 43.3* | 1.0* | 5.8* | 4.8* | 1.0 | -- | 0.3 | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 42.7 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 17.4* | 15.2* | 21.7* | 15.2* | 2.2 | 4.3 | -- | -- | 4.3 | -- | 4.3 | -- | 6.5 | 2.2 | -- | 6.5 | -- | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (343 : 356) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 2.4* | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.1 | 82 |
| B | -- | -- | -- | 1.7 | 1.7 | 1.7 | -- | 1.7* | 1.7 | -- | 1.7 | -- | -- | -- | -- | 6.8* | 83.1 | 59 |
| C | 29.9* | 1.3* | 1.3* | 9.0* | 14.0 | 0.7 | -- | 1.0 | 1.7 | 1.0 | -- | -- | 0.7 | -- | 0.3 | 1.0 | 38.2 | 301 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 78.3* | 4.3* | -- | 6.5* | 8.7 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 30 |
| Base Pair (344 : 355) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | 3.7 | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.1 | 82 |
| B | -- | -- | 1.7 | 3.4* | -- | -- | 1.7 | -- | 1.7 | -- | -- | 3.4 | -- | -- | 5.1* | -- | 83.1 | 59 |
| C | 47.8* | 2.0* | 4.3* | 3.3* | 1.3 | 0.3 | 0.7 | 0.3 | 0.3 | 0.3 | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | 1.0 | 37.5 | 301 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 34.8* | 23.9* | 8.7* | 19.6* | 8.7 | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (345 : 354) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | 2.4* | 1.2* | -- | -- | -- | -- | 1.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 95.1 | 82 |
| B | 1.7* | -- | 1.7 | 1.7 | 1.7 | 3.4* | 1.7* | 1.7 | -- | 1.7 | -- | -- | 1.7 | -- | -- | -- | 83.1 | 59 |
| C | 22.0* | 17.3* | 12.3* | 1.3* | 2.0 | 1.0 | 0.7 | 0.3 | 0.3 | 0.7 | -- | 0.3 | 2.3 | 0.7 | -- | 0.3 | 38.3 | 300 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 17.4* | 32.6* | 8.7* | 26.1* | -- | 6.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 4.3 | -- | 2.2 | -- | 2.2 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (346 : 353) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | 1.2* | 2.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | 95.1 | 82 |
| B | -- | -- | -- | 3.4 | -- | -- | 5.1* | 1.7 | 1.7 | 1.7 | -- | 1.7* | -- | -- | -- | 1.7 | 83.1 | 59 |
| C | 38.2* | 5.6* | 3.0* | 4.7* | 3.3 | 0.3 | 2.0 | 2.0 | -- | 1.3 | 0.3 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.7 | 38.2 | 301 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 4.3* | 6.5* | 4.3* | 2.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.6 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
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