Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 332

 
Base Pair (332 : 367)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.87 0.92 1.79 0.92 0.99 -0.34 -0.49 0.05 0.81 82
B 0 0 0 0.00 0.78 0.87 1.64 0.87 0.87 -0.92 -0.74 0.21 0.21 72
C 0 0 0 0.00 0.50 0.79 1.29 0.79 0.94 -0.32 -0.34 0.09 0.66 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.67 0.94 1.60 0.94 0.96 1.25 1.19 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (333 : 366)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.94 0.97 1.91 0.97 1.00 -0.36 -0.46 0.06 0.79 82
B 0 0 0 0.00 0.64 0.73 1.37 0.73 0.73 -0.92 -0.77 0.21 0.21 72
C 0 0 0 0.00 0.48 0.80 1.28 0.80 0.96 -0.41 -0.39 0.09 0.67 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.59 0.80 1.39 0.80 1.00 0.48 0.74 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (334 : 365)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.95 0.99 1.94 0.99 0.99 -0.14 -0.16 0.05 0.79 82
B 0 0 0 0.00 0.55 0.67 1.21 0.67 0.73 -0.83 -0.80 0.21 0.21 72
C 0 0 0 0.00 0.64 0.82 1.45 0.84 0.96 -0.44 -0.58 0.08 0.68 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.61 0.73 1.35 0.73 0.89 -0.07 0.27 0.02 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (335 : 364)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.87 0.95 1.82 0.95 0.97 -0.26 -0.30 0.04 0.78 82
B 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.67 0.73 -0.81 -0.80 0.21 0.21 72
C 0 0 0 0.00 0.87 0.92 1.79 0.92 0.96 -0.54 -0.67 0.08 0.66 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.70 0.80 1.50 0.80 0.96 0.10 0.22 0.00 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (336 : 363)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.91 0.95 1.86 0.95 0.98 -0.50 -0.60 0.02 0.71 82
B 0 0 0 0.00 0.54 0.62 1.16 0.62 0.69 -0.93 -0.82 0.19 0.22 72
C 0 0 0 0.00 0.87 0.92 1.79 0.92 0.94 -0.69 -0.81 0.08 0.66 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.74 0.80 1.54 0.80 0.80 0.05 0.07 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (337 : 362)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.88 0.93 1.81 0.93 0.96 -0.50 -0.52 0.02 0.68 82
B 0 0 0 0.00 0.33 0.47 0.80 0.47 0.60 -0.94 -0.74 0.19 0.21 72
C 0 0 0 0.00 0.82 0.91 1.73 0.91 0.97 -0.58 -0.76 0.10 0.59 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.55 0.67 1.22 0.67 0.76 0.23 0.17 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (338 : 361)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.81 0.88 1.69 0.88 0.92 -0.83 -0.86 0.04 0.60 82
B 0 0 0 0.00 0.25 0.54 0.79 0.54 0.54 -0.72 -0.64 0.18 0.18 72
C 0 0 0 0.00 0.83 0.96 1.79 0.96 0.98 -0.47 -0.41 0.05 0.55 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.61 0.70 1.31 0.70 0.76 0.04 0.01 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
 
Base Pair (343 : 356)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.50 0.75 1.25 0.75 0.75 -0.26 -0.23 0.00 0.05 82
B 0 0 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.10 0.30 -0.60 -0.55 0.00 0.14 72
C 0 0 0 0.00 0.37 0.67 1.04 0.67 0.91 -0.47 -0.63 0.01 0.61 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.50 0.89 1.39 0.89 0.98 1.32 1.14 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 41
 
Base Pair (344 : 355)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 1.00 -0.22 -0.18 0.00 0.05 82
B 0 0 0 0.00 0.29 0.50 0.79 0.30 0.30 -0.58 -0.63 0.00 0.14 72
C 0 0 0 0.00 0.66 0.92 1.58 0.92 0.95 -0.38 -0.38 0.01 0.62 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.80 0.87 1.67 0.87 0.98 0.18 0.13 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (345 : 354)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.75 0.75 -0.26 -0.26 0.00 0.05 82
B 0 0 0 0.00 0.25 0.40 0.65 0.30 0.60 -0.64 -0.64 0.00 0.14 72
C 0 0 0 0.00 0.78 0.86 1.64 0.86 0.91 -0.79 -0.85 0.01 0.61 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.80 0.87 1.67 0.87 0.93 -0.11 -0.04 0.00 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (346 : 353)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.50 0.75 1.25 0.75 0.75 -0.26 -0.23 0.00 0.05 82
B 0 0 0 0.00 0.14 0.00 0.14 0.20 0.20 -0.51 -0.61 0.00 0.14 72
C 0 0 0 0.00 0.56 0.83 1.40 0.83 0.89 -0.59 -0.63 0.01 0.61 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.68 -0.65 0.02 0.17 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41

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