| Base Pair (369 : 402) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 2.5* | 3.7* | 2.5* | 4.9* | 4.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 81.5 | 81 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 5.2 | 94.8 | 58 |
| C | 6.6 | 2.8 | 4.2* | 8.7 | 17.4* | 0.3 | 0.3 | 0.3 | 10.1* | -- | -- | 0.3 | 0.7 | 1.4 | -- | 0.3 | 46.5 | 288 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 42.2* | -- | -- | 11.1* | 37.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.9 | 45 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (370 : 401) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 3.7 | 2.5* | 6.2* | -- | 6.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 81.5 | 81 |
| B | -- | -- | 3.4* | 1.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 94.8 | 58 |
| C | 19.9* | 14.4* | 4.1* | 9.3* | 3.8 | 1.0 | -- | 0.3 | 1.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 46.0 | 291 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 51.1* | 17.8* | -- | 17.8* | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 8.9 | 45 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (371 : 400) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 1.2* | 3.7* | 4.9* | 4.9* | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.5 | 81.5 | 81 |
| B | -- | -- | 1.7 | -- | -- | -- | 3.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 94.8 | 58 |
| C | 7.2 | 17.2* | 6.9* | 2.4 | 15.5* | 2.4 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | 0.7 | 46.6 | 290 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 32.6* | 28.3* | 2.2* | 19.6* | 4.3 | -- | -- | 2.2 | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.7 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (372 : 399) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | 1.2* | 8.6* | 3.7* | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 84.0 | 81 |
| B | -- | -- | 1.7 | -- | -- | -- | 1.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.7* | 94.8 | 58 |
| C | 5.1* | 27.7* | 13.4* | 2.4* | 2.1 | 2.1 | 0.7 | 0.3 | -- | -- | 0.3 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 45.5 | 292 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 10.9* | 21.7* | 17.4* | 15.2* | 4.3 | 8.7 | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 2.2 | -- | -- | 15.2 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (373 : 398) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 6.2* | 1.2* | 4.9* | 3.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 84.0 | 81 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.4* | 94.8 | 58 |
| C | 11.0* | 4.1* | 10.3* | 17.5* | 2.4 | 0.3 | 0.3 | 0.7 | -- | 0.3 | 0.3 | 0.3 | 0.3 | 0.7 | 0.3 | 0.3 | 50.7 | 292 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 15.2* | 10.9* | 6.5* | 15.2* | 2.2 | 6.5 | -- | -- | 2.2 | 2.2 | 2.2 | 2.2 | 2.2 | 2.2 | -- | 2.2 | 28.3 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (374 : 397) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 1.2* | 1.2* | 7.4* | 6.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 84.0 | 81 |
| B | -- | -- | -- | 1.7 | 1.7* | -- | 1.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 94.8 | 58 |
| C | 4.1* | 1.0 | 2.4 | 5.5 | 1.0 | 2.7* | -- | 1.7 | 0.3 | 3.4 | 3.1 | 12.3* | -- | -- | 0.3 | 0.7 | 61.3 | 292 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 11.1* | 6.7* | 11.1* | 11.1* | -- | -- | 2.2 | 2.2 | 4.4 | -- | 2.2 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 46.7 | 45 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (375 : 396) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | 8.6* | 2.5* | 2.5* | 1.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 85.2 | 81 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.7 | 3.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 94.8 | 58 |
| C | 5.5* | 5.1* | 2.1* | 1.0* | 2.1 | -- | 1.0 | -- | 3.8 | 0.3 | 0.7 | 0.3 | -- | 0.7 | 0.3 | -- | 77.1 | 292 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 4.3* | 8.7* | 2.2* | 15.2* | 2.2 | 4.3 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 2.2 | -- | 56.5 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (376 : 395) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | 2.5 | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | 95.1 | 81 |
| B | -- | -- | 3.4 | -- | -- | 1.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 94.8 | 58 |
| C | 1.7 | 2.7* | 1.7* | 3.1 | 4.1* | 1.0 | 0.3 | 1.0* | 0.7 | -- | 0.7 | 1.4 | -- | 0.7 | -- | -- | 80.8 | 292 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 10.9* | 6.5* | 4.3* | 2.2* | -- | -- | -- | 2.2 | -- | 4.3 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 67.4 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (377 : 394) (Tertiary) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 96.3 | 81 |
| B | -- | -- | -- | 1.7 | 1.7* | -- | 1.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 94.8 | 58 |
| C | 0.3* | 1.7* | 1.0 | 1.7 | 0.3 | -- | 2.0* | -- | -- | -- | 0.7 | 1.7 | -- | -- | -- | 0.3* | 90.1 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | 6.5* | -- | 4.3 | 6.5* | 6.5 | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 71.7 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (378 : 393) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | 2.5 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 96.3 | 81 |
| B | -- | -- | 1.7 | 1.7 | -- | -- | 1.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 94.8 | 58 |
| C | -- | 0.3 | 1.4* | 0.3 | 0.3 | 1.0 | 0.3 | -- | 1.7* | -- | -- | 1.0* | 0.3 | -- | -- | -- | 93.2 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 8.7 | -- | -- | -- | 6.5 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 82.6 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (379 : 392) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.5 | 96.3 | 81 |
| B | -- | -- | 1.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.4 | 94.8 | 58 |
| C | 0.3* | 1.4* | 0.3* | 1.7* | 0.7 | -- | -- | 0.7 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 94.2 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | 6.5* | 4.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | 87.0 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (380 : 391) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 98.8 | 81 |
| B | -- | -- | 1.7* | 3.4* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 94.8 | 58 |
| C | -- | -- | 0.3* | 2.0 | 0.7 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 6.8* | -- | 0.7* | -- | 0.3 | 88.7 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | -- | 4.3* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2* | -- | -- | 93.5 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (381 : 390) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 98.8 | 81 |
| B | -- | -- | 3.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.7 | 94.8 | 58 |
| C | 0.7* | 1.4 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 6.8* | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 1.0* | 89.1 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | 6.5* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2* | -- | -- | -- | 91.3 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (382 : 389) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 98.8 | 81 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | 1.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 3.4 | 94.8 | 58 |
| C | -- | 1.7* | 0.3* | 0.3* | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 96.9 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 97.8 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 31 |
| Base Pair (383 : 388) | Get: Collective Score | |||||||||||||||||
| Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
| A | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | -- | -- | -- | -- | 98.8 | 81 |
| B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 1.7* | -- | -- | -- | 1.7* | -- | -- | 1.7* | 94.8 | 58 |
| C | -- | 0.7* | -- | -- | -- | -- | 0.3* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 98.6 | 293 |
| Z | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 124 |
| D | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 17 |
| E | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 97.8 | 46 |
| U | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 30 |
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