Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 369


 
Base Pair (369 : 402)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.64 0.73 1.37 0.73 1.00 -0.83 -0.64 0.09 0.18 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.51 -0.19 0.06 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.39 0.59 0.99 0.42 0.75 -0.77 -0.85 0.02 0.50 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.23 0.58 0.81 0.58 1.00 1.17 0.48 0.04 0.89 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (370 : 401)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.70 0.80 1.50 0.67 1.00 -0.81 -0.67 0.09 0.18 82
B 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.37 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.82 0.88 1.70 0.88 0.98 -0.89 -0.91 0.02 0.51 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.89 0.95 1.84 0.95 0.98 0.33 0.12 0.04 0.89 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (371 : 400)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.73 0.80 1.53 0.80 0.87 -0.80 -0.64 0.09 0.18 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.33 -0.42 -0.19 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.62 0.74 1.36 0.63 0.97 -0.84 -0.91 0.01 0.51 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.85 0.90 1.76 0.90 0.95 0.06 -0.22 0.04 0.91 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (372 : 399)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.67 0.85 1.51 0.85 1.00 -0.73 -0.52 0.09 0.16 82
B 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.33 0.33 -0.42 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.78 0.89 1.67 0.89 0.97 -0.81 -0.80 0.02 0.52 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.69 0.77 1.46 0.77 0.92 -0.47 -0.49 0.02 0.85 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (373 : 398)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.79 -0.61 0.09 0.16 82
B 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.00 0.00 -0.34 -0.24 0.03 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.80 0.87 1.66 0.87 0.92 -0.93 -0.92 0.00 0.47 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.58 0.67 1.24 0.67 0.79 -0.79 -0.81 0.02 0.72 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (374 : 397)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.67 -0.57 0.09 0.16 82
B 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.33 0.67 -0.42 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.26 0.50 0.75 0.34 0.43 -0.89 -0.93 0.04 0.37 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.68 0.75 1.43 0.75 0.75 -0.96 -0.98 0.02 0.52 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (375 : 396)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.77 -0.55 0.09 0.15 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.34 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.47 0.60 1.07 0.60 0.69 -0.79 -0.85 0.10 0.22 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.54 0.70 1.24 0.70 0.85 -0.95 -0.85 0.00 0.44 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (376 : 395)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.75 -0.39 -0.26 0.06 0.05 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 1.00 -0.37 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.36 0.50 0.86 0.48 0.75 -0.75 -0.75 0.04 0.18 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.60 0.73 1.33 0.73 0.73 -0.93 -0.94 0.04 0.33 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (377 : 394) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.67 -0.33 -0.19 0.05 0.04 82
B 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.33 0.67 -0.47 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.30 0.45 0.75 0.48 0.52 -0.50 -0.61 0.03 0.09 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.30 0.46 0.76 0.38 0.85 -0.91 -0.77 0.02 0.28 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (378 : 393)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.67 -0.30 -0.15 0.04 0.04 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.67 -0.40 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.47 0.60 1.07 0.30 0.50 -0.41 -0.41 0.01 0.07 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.88 -0.62 -0.69 0.00 0.17 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (379 : 392)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.33 -0.35 -0.15 0.04 0.04 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.33 -0.42 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.50 0.65 1.15 0.65 0.76 -0.38 -0.51 0.06 0.06 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.67 0.83 1.50 0.83 0.83 -0.65 -0.55 0.00 0.13 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (380 : 391)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.22 -0.07 0.04 0.01 82
B 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.42 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.23 0.70 0.93 0.21 0.27 -0.54 -0.36 0.02 0.11 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.67 0.67 -0.49 -0.32 0.02 0.06 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (381 : 390)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.27 -0.07 0.05 0.01 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.67 -0.34 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.42 0.78 1.20 0.22 0.22 -0.52 -0.42 0.02 0.10 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.75 0.75 -0.38 -0.32 0.02 0.09 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (382 : 389)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.27 -0.07 0.05 0.01 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 -0.38 -0.24 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.50 0.78 1.28 0.78 0.89 -0.43 -0.19 0.08 0.03 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.32 -0.11 0.04 0.02 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (383 : 388)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.25 -0.07 0.05 0.01 82
B 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.00 0.00 -0.47 -0.27 0.04 0.04 72
C 0 0 0 0.00 0.50 0.75 1.25 0.50 0.50 -0.20 -0.14 0.01 0.01 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 -0.22 -0.11 0.02 0.02 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 41


Last generated: Mon Sep 20 12:28:09 1999