Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 2

 
Base Pair (2 : 21)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.71 0.88 1.59 0.88 0.97 0.12 0.16 0.00 0.89 82
B 0 0 0 0.00 0.61 0.75 1.36 0.75 0.95 -0.12 -0.05 0.01 0.88 72
C 0 0 0 0.00 0.73 0.82 1.55 0.82 0.94 0.12 -0.01 0.00 0.95 305
Z 0 0 0 0.00 0.23 0.90 1.13 0.90 1.00 0.25 0.88 0.06 0.78 125
D 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.33 0.67 0.17 -0.60 0.74 0.16 19
E 0 0 0 0.00 0.84 0.91 1.75 0.51 1.00 0.28 0.59 0.02 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.62 0.75 1.37 0.65 1.00 -0.80 -0.73 0.05 0.49 41
 
Base Pair (3 : 20)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.67 0.91 1.58 0.91 0.98 -0.49 -0.47 0.01 0.56 82
B 0 0 0 0.00 0.61 0.80 1.41 0.80 0.94 -0.78 -0.80 0.03 0.49 72
C 0 0 0 0.00 0.80 0.93 1.74 0.93 0.96 -0.69 -0.65 0.00 0.44 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.16 0.37 0.06 0.74 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.67 0.67 0.76 -0.32 0.74 0.16 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.75 1.00 -0.32 -0.25 0.00 0.09 46
U 0 0 0 0.00 0.33 0.54 0.87 0.54 0.85 -0.81 -0.49 0.05 0.32 41
 
Base Pair (4 : 19)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.33 -0.30 0.01 0.06 82
B 0 0 0 0.00 0.75 0.86 1.61 0.86 1.00 -0.75 -0.62 0.04 0.19 72
C 0 0 0 0.00 0.22 0.65 0.86 0.64 0.83 -0.77 -0.57 0.01 0.33 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.08 0.16 0.00 0.58 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.23 -0.20 0.68 0.05 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.90 -0.39 0.05 0.10 41

Last generated: Mon Sep 20 12:28:08 1999