Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 215

 
Base Pair (215 : 258)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 1.00 1.90 1.31 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.28 0.74 1.02 0.74 0.96 1.30 0.96 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.71 0.98 1.68 0.06 0.98 1.57 1.69 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 1.00 1.84 2.00 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.75 0.94 1.69 0.94 1.00 0.98 1.17 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.08 0.00 0.08 0.74 1.00 1.85 1.14 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.69 0.86 1.55 0.43 0.96 0.32 0.14 0.00 0.68 41
 
Base Pair (216 : 257)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.21 1.21 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.71 0.94 1.66 0.94 0.97 1.11 1.11 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 1.27 1.27 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.50 0.99 1.49 0.99 1.00 1.87 1.93 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.17 1.00 1.19 1.19 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.83 0.96 1.80 0.96 1.00 0.49 0.39 0.00 0.68 41
 
 
Base Pair (220 : 253)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.97 0.99 1.96 0.99 0.99 0.22 0.25 0.00 0.98 82
B 0 0 0 0.00 0.76 0.88 1.63 0.88 0.95 -0.11 -0.10 0.00 0.90 72
C 0 0 0 0.00 0.66 0.87 1.53 0.76 0.96 0.52 0.53 0.01 0.98 305
Z 0 0 0 0.00 0.88 0.97 1.84 0.97 0.99 0.90 1.01 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.85 1.85 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.73 -0.73 0.00 0.22 41
 
Base Pair (221 : 252)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.90 0.98 1.88 0.98 1.00 0.56 0.55 0.00 0.96 82
B 0 0 0 0.00 0.89 0.94 1.83 0.94 0.97 0.01 -0.05 0.01 0.90 72
C 0 0 0 0.00 0.93 0.95 1.88 0.95 0.97 0.22 0.17 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.98 0.99 1.15 1.15 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.73 0.93 1.66 0.93 0.98 1.20 1.19 0.00 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.80 0.89 1.69 0.89 1.00 -0.69 -0.73 0.00 0.22 41
 
Base Pair (222 : 251)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.63 0.63 0.00 0.96 82
B 0 0 0 0.00 0.71 0.82 1.53 0.82 0.85 0.03 -0.21 0.03 0.83 72
C 0 0 0 0.00 0.67 0.92 1.59 0.92 0.95 0.87 0.88 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.74 0.96 1.70 0.96 0.98 1.15 1.11 0.00 0.98 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.91 0.96 1.87 0.96 0.98 0.42 0.50 0.00 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.60 0.78 1.38 0.67 0.78 -0.82 -0.68 0.00 0.22 41
 
Base Pair (223 : 250)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.83 0.94 1.76 0.94 0.97 0.09 0.18 0.00 0.94 82
B 0 0 0 0.00 0.83 0.89 1.72 0.89 0.96 -0.60 -0.57 0.01 0.75 72
C 0 0 0 0.00 0.56 0.94 1.49 0.94 0.97 0.17 0.31 0.00 0.76 305
Z 0 0 0 0.00 0.60 0.93 1.53 0.93 0.96 0.45 0.48 0.00 0.86 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.62 0.77 1.38 0.72 0.84 0.17 -0.04 0.04 0.94 46
U 0 0 0 0.00 0.75 0.89 1.64 0.78 0.89 -0.70 -0.64 0.00 0.22 41
 
 
Base Pair (227 : 247)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.50 0.75 1.25 0.25 1.00 -0.56 -0.26 0.11 0.05 82
B 0 0 0 0.00 0.67 0.82 1.49 0.82 1.00 -0.66 -0.60 0.06 0.15 72
C 0 0 0 0.00 0.54 0.71 1.25 0.51 0.87 -0.47 -0.44 0.02 0.82 305
Z 0 0 0 0.00 0.86 0.93 1.79 0.93 1.00 -0.55 -0.44 0.07 0.12 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.14 -0.14 0.00 0.02 41
 
Base Pair (228 : 246)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.53 -0.26 0.11 0.05 82
B 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.74 -0.62 0.06 0.15 72
C 0 0 0 0.00 0.83 0.91 1.74 0.91 0.97 -0.35 -0.49 0.02 0.83 305
Z 0 0 0 0.00 0.86 0.93 1.79 0.93 1.00 -0.51 -0.50 0.06 0.12 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.14 -0.14 0.02 0.02 41
 
Base Pair (229 : 245)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.57 -0.22 0.11 0.05 82
B 0 0 0 0.00 0.83 0.91 1.74 0.91 0.91 -0.62 -0.55 0.06 0.15 72
C 0 0 0 0.00 0.74 0.85 1.59 0.85 0.93 -0.55 -0.56 0.01 0.80 305
Z 0 0 0 0.00 0.80 0.92 1.72 0.92 1.00 -0.43 -0.52 0.06 0.10 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.14 -0.14 0.00 0.02 41
 
Base Pair (230 : 244)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.33 -0.50 -0.19 0.11 0.04 82
B 0 0 0 0.00 0.83 0.91 1.74 0.91 0.91 -0.72 -0.56 0.06 0.15 72
C 0 0 0 0.00 0.68 0.79 1.48 0.79 0.91 -0.61 -0.69 0.07 0.73 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 -0.09 -0.42 0.13 0.01 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.14 -0.14 0.00 0.02 41
 
Base Pair (231 : 243)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.60 -0.19 0.11 0.04 82
B 0 0 0 0.00 0.67 0.82 1.49 0.82 0.82 -0.65 -0.53 0.06 0.15 72
C 0 0 0 0.00 0.69 0.77 1.46 0.77 0.92 -0.95 -0.88 0.01 0.58 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.50 -0.14 -0.51 0.12 0.02 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (232 : 242)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.60 -0.19 0.11 0.04 82
B 0 0 0 0.00 0.50 0.78 1.28 0.78 0.89 -0.65 -0.47 0.06 0.12 72
C 0 0 0 0.00 0.67 0.77 1.44 0.77 0.88 -0.97 -0.96 0.03 0.50 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.20 0.20 -0.42 -0.40 0.03 0.04 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (233 : 241)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.58 -0.19 0.11 0.04 82
B 0 0 0 0.00 0.33 0.71 1.05 0.71 0.86 -0.52 -0.44 0.06 0.10 72
C 0 0 0 0.00 0.70 0.78 1.48 0.78 0.85 -0.94 -0.89 0.07 0.32 305
Z 0 0 0 0.00 0.67 0.80 1.47 0.20 0.20 -0.40 -0.20 0.14 0.04 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41
 
Base Pair (234 : 240)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.47 -0.19 0.10 0.04 82
B 0 0 0 0.00 0.60 0.71 1.31 0.71 0.71 -0.60 -0.46 0.06 0.10 72
C 0 0 0 0.00 0.54 0.66 1.20 0.66 0.80 -0.78 -0.75 0.07 0.21 305
Z 0 0 0 0.00 0.50 0.80 1.30 0.00 0.00 -0.59 -0.22 0.14 0.04 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41

Last generated: Mon Sep 20 12:28:08 1999