Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 22

 
Base Pair (22 : 428)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.31 2.00 0.13 0.00 0.66 82
B 0 0 0 0.00 0.04 0.00 0.04 0.17 0.64 1.54 0.19 0.03 0.58 72
C 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.65 1.87 -0.27 0.04 0.55 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 1.00 1.08 0.40 0.08 0.21 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.40 0.80 -0.29 0.16 0.63 0.26 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.03 2.00 0.66 0.02 0.74 46
U 0 0 0 0.00 0.20 0.00 0.20 0.44 0.44 0.00 0.22 0.02 0.39 41
 
Base Pair (23 : 427)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.14 0.00 0.14 0.17 0.26 0.60 0.20 0.00 0.66 82
B 0 0 0 0.00 0.32 0.53 0.86 0.13 0.29 0.24 0.15 0.03 0.62 72
C 0 0 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.28 0.33 0.90 -0.25 0.04 0.55 305
Z 0 0 0 0.00 0.25 0.89 1.14 0.04 0.07 0.65 0.10 0.08 0.22 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.00 0.00 -0.73 0.35 0.63 0.26 19
E 0 0 0 0.00 0.14 0.00 0.14 0.41 0.41 1.32 0.27 0.02 0.74 46
U 0 0 0 0.00 0.27 0.53 0.80 0.47 0.47 0.44 0.03 0.02 0.41 41
 
Base Pair (24 : 426)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.16 0.00 0.16 0.20 0.27 0.86 0.24 0.00 0.67 82
B 0 0 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.30 0.44 0.21 0.04 0.01 0.64 72
C 0 0 0 0.00 0.22 0.40 0.62 0.18 0.32 0.39 -0.15 0.04 0.55 305
Z 0 0 0 0.00 0.33 0.86 1.19 0.11 0.11 0.75 0.23 0.08 0.22 125
D 0 0 0 0.00 0.67 0.80 1.47 0.20 0.20 -0.73 0.46 0.63 0.26 19
E 0 0 0 0.00 0.20 0.00 0.20 0.08 0.11 1.24 0.19 0.02 0.78 46
U 0 0 0 0.00 0.33 0.58 0.91 0.16 0.32 0.17 -0.00 0.02 0.46 41
 
Base Pair (25 : 425)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.20 0.00 0.20 0.14 0.20 0.32 0.33 0.06 0.61 82
B 0 0 0 0.00 0.23 0.34 0.57 0.24 0.39 -0.55 0.38 0.15 0.57 72
C 0 0 0 0.00 0.11 0.00 0.11 0.23 0.50 -0.05 0.45 0.04 0.56 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.10 0.25 0.90 0.01 125
D 0 0 0 0.00 0.33 0.60 0.93 0.60 0.60 -0.69 0.83 0.63 0.26 19
E 0 0 0 0.00 0.61 0.75 1.36 0.03 0.08 0.45 0.09 0.02 0.78 46
U 0 0 0 0.00 0.29 0.47 0.76 0.47 0.58 0.22 -0.10 0.02 0.46 41
 
Base Pair (26 : 424)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.29 0.56 0.85 0.32 0.35 -0.56 0.21 0.29 0.41 82
B 0 0 0 0.00 0.29 0.47 0.76 0.16 0.42 -0.56 0.11 0.26 0.53 72
C 0 0 0 0.00 0.64 0.73 1.38 0.58 0.70 -0.33 -0.11 0.05 0.54 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.10 -0.20 0.90 0.01 125
D 0 0 0 0.00 0.25 0.40 0.65 0.40 0.60 -0.73 0.07 0.63 0.26 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.78 0.78 2.00 0.84 0.02 0.80 46
U 0 0 0 0.00 0.43 0.68 1.11 0.12 0.56 -0.37 0.43 0.10 0.61 41
 
Base Pair (27 : 423)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.38 0.50 0.88 0.50 0.60 -0.60 0.69 0.82 0.12 82
B 0 0 0 0.00 0.26 0.41 0.68 0.28 0.38 -0.90 0.06 0.44 0.40 72
C 0 0 0 0.00 0.42 0.70 1.13 0.18 0.24 -0.80 0.01 0.54 0.29 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.39 0.92 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.33 0.60 0.93 0.40 0.40 -0.50 0.43 0.63 0.26 19
E 0 0 0 0.00 0.22 0.51 0.73 0.00 0.00 -0.01 0.89 0.02 0.80 46
U 0 0 0 0.00 0.30 0.65 0.95 0.20 0.35 -0.25 0.15 0.22 0.49 41

Last generated: Mon Sep 20 12:28:08 1999