Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 31

 
Base Pair (31 : 56)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.91 0.94 1.86 0.94 0.99 -0.17 -0.21 0.01 0.87 82
B 0 0 0 0.00 0.76 0.85 1.62 0.85 1.00 -0.94 -0.93 0.00 0.47 72
C 0 0 0 0.00 0.93 0.97 1.90 0.97 0.99 0.14 0.07 0.02 0.90 305
Z 0 0 0 0.00 0.50 0.94 1.44 0.93 0.95 1.30 1.47 0.00 0.98 125
D 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.33 0.67 -0.50 -0.48 0.10 0.16 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.78 0.88 1.65 0.88 0.94 -0.75 -0.31 0.27 0.39 41
 
Base Pair (32 : 55)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.89 0.93 1.82 0.93 0.99 -0.24 -0.30 0.01 0.88 82
B 0 0 0 0.00 0.94 0.97 1.91 0.97 1.00 -0.86 -0.85 0.00 0.47 72
C 0 0 0 0.00 0.74 0.94 1.67 0.84 0.98 0.55 0.42 0.02 0.90 305
Z 0 0 0 0.00 0.40 0.98 1.38 0.98 0.99 1.88 1.73 0.00 0.98 125
D 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.00 0.33 -0.85 -0.48 0.10 0.16 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.96 0.96 2.00 1.70 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.56 0.74 1.30 0.74 0.93 -0.52 -0.19 0.00 0.66 41
 
Base Pair (33 : 54)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.71 0.85 1.56 0.85 0.92 -0.10 -0.17 0.01 0.88 82
B 0 0 0 0.00 0.80 0.88 1.68 0.88 0.97 -0.93 -0.90 0.00 0.47 72
C 0 0 0 0.00 0.35 0.82 1.17 0.78 0.94 0.38 0.57 0.04 0.87 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.61 1.61 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.33 0.67 -0.57 -0.48 0.10 0.16 19
E 0 0 0 0.00 0.07 0.00 0.07 0.30 1.00 1.00 1.32 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.33 0.54 0.87 0.50 0.62 -0.35 -0.47 0.05 0.63 41
 
Base Pair (34 : 53)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.72 0.87 1.59 0.87 0.89 -0.07 -0.20 0.01 0.85 82
B 0 0 0 0.00 0.80 0.88 1.67 0.88 0.91 -0.82 -0.82 0.00 0.44 72
C 0 0 0 0.00 0.65 0.77 1.42 0.77 0.87 -0.66 -0.85 0.10 0.65 305
Z 0 0 0 0.00 0.14 0.00 0.14 0.35 0.99 1.20 0.93 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.33 -0.73 -0.32 0.10 0.16 19
E 0 0 0 0.00 0.58 0.76 1.34 0.76 0.98 0.25 0.63 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.54 0.67 1.21 0.67 0.78 -0.45 -0.90 0.22 0.44 41
 
Base Pair (35 : 52)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.74 0.88 1.62 0.88 0.94 -0.28 -0.26 0.01 0.83 82
B 0 0 0 0.00 0.65 0.78 1.43 0.78 0.94 -0.80 -0.77 0.00 0.44 72
C 0 0 0 0.00 0.42 0.56 0.98 0.56 0.71 -0.91 -0.89 0.04 0.30 305
Z 0 0 0 0.00 0.69 0.93 1.62 0.93 0.98 1.11 1.06 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 -0.57 -0.48 0.10 0.16 19
E 0 0 0 0.00 0.78 0.95 1.73 0.95 0.98 0.86 0.86 0.00 0.96 46
U 0 0 0 0.00 0.44 0.64 1.09 0.50 0.57 -0.89 -0.89 0.07 0.34 41
 
Base Pair (36 : 51)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.59 0.79 1.38 0.79 0.91 -0.20 -0.44 0.01 0.82 82
B 0 0 0 0.00 0.62 0.74 1.36 0.74 0.84 -0.85 -0.89 0.00 0.43 72
C 0 0 0 0.00 0.61 0.76 1.37 0.76 0.87 -0.87 -0.76 0.04 0.23 305
Z 0 0 0 0.00 0.19 0.00 0.19 0.73 0.90 1.33 0.58 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.00 0.00 -0.73 -0.48 0.10 0.16 19
E 0 0 0 0.00 0.75 0.94 1.69 0.94 0.94 -0.17 -0.33 0.00 0.70 46
U 0 0 0 0.00 0.44 0.62 1.06 0.69 0.85 -0.96 -0.93 0.02 0.32 41
 
Base Pair (37 : 50)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.69 0.83 1.52 0.83 0.87 -0.54 -0.60 0.01 0.66 82
B 0 0 0 0.00 0.78 0.86 1.63 0.86 0.89 -0.88 -0.90 0.00 0.39 72
C 0 0 0 0.00 0.84 0.92 1.76 0.92 1.00 -0.82 -0.68 0.09 0.21 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.17 -0.05 0.02 0.01 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.33 0.33 -0.50 -0.60 0.10 0.16 19
E 0 0 0 0.00 0.50 0.80 1.30 0.20 0.20 -0.61 -0.66 0.04 0.33 46
U 0 0 0 0.00 0.43 0.64 1.07 0.64 0.64 -0.87 -0.81 0.02 0.27 41
 
Base Pair (38 : 49)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.55 0.77 1.31 0.77 0.81 -0.59 -0.76 0.00 0.52 82
B 0 0 0 0.00 0.78 0.89 1.67 0.89 0.89 -0.75 -0.67 0.00 0.25 72
C 0 0 0 0.00 0.77 0.84 1.61 0.84 0.95 -0.80 -0.72 0.05 0.21 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.05 -0.05 0.00 0.01 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.00 0.00 -0.67 -0.48 0.05 0.10 19
E 0 0 0 0.00 0.33 0.50 0.83 0.42 0.58 -0.78 -0.70 0.00 0.26 46
U 0 0 0 0.00 0.57 0.67 1.24 0.33 0.44 -0.96 -0.80 0.05 0.22 41
 
Base Pair (39 : 48)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.18 0.00 0.18 0.33 0.40 -0.68 -0.52 0.01 0.18 82
B 0 0 0 0.00 0.40 0.70 1.10 0.70 0.80 -0.45 -0.56 0.00 0.14 72
C 0 0 0 0.00 0.78 0.85 1.63 0.69 1.00 -0.73 -0.67 0.04 0.17 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 1.11 -0.05 0.98 0.01 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.50 -0.32 -0.48 0.05 0.10 19
E 0 0 0 0.00 0.40 0.57 0.97 0.57 0.57 -0.71 -0.56 0.02 0.15 46
U 0 0 0 0.00 0.75 0.86 1.61 0.86 0.86 -0.68 -0.65 0.02 0.17 41
 
Base Pair (40 : 47)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.33 0.50 0.83 0.50 0.88 -0.46 -0.58 0.04 0.10 82
B 0 0 0 0.00 0.17 0.00 0.17 0.38 0.50 -0.49 -0.45 0.00 0.11 72
C 0 0 0 0.00 0.62 0.80 1.42 0.80 0.93 -0.37 -0.33 0.01 0.05 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.99 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.50 -0.67 -0.48 0.05 0.10 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.57 -0.44 -0.40 0.00 0.15 46
U 0 0 0 0.00 0.50 0.67 1.17 0.17 0.50 -0.62 -0.69 0.00 0.15 41

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