Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 318

 
Base Pair (318 : 331)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.70 0.96 1.66 0.96 0.99 1.32 1.24 0.02 0.98 82
B 0 0 0 0.00 0.88 0.93 1.80 0.93 0.98 0.03 -0.30 0.06 0.79 72
C 0 0 0 0.00 0.52 0.92 1.44 0.92 0.98 1.04 0.91 0.02 0.96 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.96 0.00 0.98 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.62 0.00 0.89 0.00 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.44 1.10 0.04 0.96 46
U 0 0 0 0.00 0.50 0.93 1.43 0.93 1.00 0.47 0.66 0.00 0.66 41
 
Base Pair (319 : 330)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.98 0.99 1.96 0.99 0.99 0.36 0.18 0.02 0.98 82
B 0 0 0 0.00 0.81 0.88 1.69 0.88 0.95 -0.01 -0.14 0.06 0.79 72
C 0 0 0 0.00 0.53 0.66 1.19 0.66 0.75 0.05 -0.56 0.20 0.78 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.87 0.00 0.98 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.34 0.00 0.89 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.90 0.96 1.86 0.96 1.00 0.42 0.47 0.02 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.50 0.78 1.28 0.78 1.00 -0.21 0.12 0.00 0.66 41
 
Base Pair (320 : 329)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.79 0.89 1.68 0.89 0.99 0.26 0.11 0.02 0.98 82
B 0 0 0 0.00 0.73 0.81 1.53 0.81 0.96 -0.09 -0.22 0.06 0.79 72
C 0 0 0 0.00 0.83 0.94 1.78 0.94 0.99 0.47 0.45 0.02 0.96 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.25 0.00 0.98 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.52 0.00 0.89 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.96 0.98 1.94 0.98 0.98 0.17 0.21 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.67 0.89 1.56 0.89 0.96 -0.07 0.16 0.00 0.66 41
 
Base Pair (321 : 328)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.79 0.85 1.64 0.85 0.93 0.36 -0.88 0.67 0.33 82
B 0 0 0 0.00 0.74 0.83 1.58 0.83 0.98 -0.19 -0.26 0.07 0.75 72
C 0 0 0 0.00 0.87 0.93 1.79 0.93 0.95 0.14 0.04 0.02 0.95 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.84 0.00 0.97 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 0.89 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.97 0.98 1.95 0.98 1.00 0.09 0.12 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.45 0.58 1.03 0.58 0.77 -0.52 -0.50 0.00 0.63 41
 
Base Pair (322 : 327)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.14 0.00 0.14 0.50 0.56 0.41 0.34 0.02 0.98 82
B 0 0 0 0.00 0.70 0.80 1.50 0.80 0.89 -0.22 -0.33 0.06 0.76 72
C 0 0 0 0.00 0.77 0.88 1.65 0.88 0.93 -0.10 -0.19 0.02 0.93 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 0.00 0.95 0.00 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.84 0.00 19
E 0 0 0 0.00 0.96 0.98 1.94 0.98 1.00 0.42 0.72 0.02 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.71 0.85 1.56 0.85 0.88 -0.43 -0.13 0.00 0.63 41

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