Group I Intron RNA Base Pair Collective Scoring Data for Helical Element 96

 
Base Pair (96 : 278)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.90 0.97 1.87 0.97 0.98 -0.10 -0.16 0.00 0.78 82
B 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 72
C 0 0 0 0.00 0.85 0.97 1.82 0.97 0.99 1.05 1.12 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 -0.05 -0.05 0.00 0.01 125
D 0 0 0 0.00 0.12 0.00 0.12 0.53 0.88 0.78 1.36 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.00 1.00 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.14 0.00 0.02 0.00 41
 
Base Pair (97 : 277)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.77 0.92 1.69 0.92 0.99 0.22 0.07 0.00 0.88 82
B 0 0 0 0.00 0.82 0.91 1.73 0.91 0.94 -0.03 -0.08 0.01 0.89 72
C 0 0 0 0.00 0.85 0.96 1.81 0.82 1.00 0.93 1.06 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.12 0.00 0.12 0.25 0.25 1.04 1.61 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.86 0.94 1.80 0.94 0.94 0.55 0.78 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.50 1.50 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.71 0.85 1.57 0.85 0.89 0.24 0.28 0.02 0.66 41
 
Base Pair (98 : 276)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.86 0.95 1.81 0.95 1.00 0.66 0.57 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.90 0.93 1.83 0.93 0.99 0.04 0.04 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.73 0.90 1.64 0.90 0.98 1.02 1.03 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.12 0.00 0.12 0.65 1.00 0.92 1.66 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.43 0.75 1.18 0.75 1.00 1.05 0.16 0.05 0.84 19
E 0 0 0 0.00 0.83 0.96 1.79 0.96 0.96 1.10 1.20 0.00 0.98 46
U 0 0 0 0.00 0.67 0.78 1.44 0.56 0.67 -0.29 -0.00 0.02 0.66 41
 
Base Pair (99 : 275)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.89 0.96 1.85 0.96 0.98 0.61 0.63 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.81 0.93 1.74 0.93 0.97 0.57 0.46 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.90 0.96 1.87 0.96 0.99 0.59 0.61 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.81 1.81 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.06 1.06 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 0.21 0.21 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.18 0.00 0.18 0.48 0.56 0.12 0.48 0.02 0.66 41
 
Base Pair (100 : 274)   Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.67 0.93 1.59 0.93 0.96 1.03 1.02 0.00 1.00 82
B 0 0 0 0.00 0.92 0.96 1.87 0.96 0.97 0.24 0.22 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.74 0.82 1.56 0.82 0.99 -0.04 0.17 0.01 0.98 305
Z 0 0 0 0.00 0.96 0.99 1.96 0.99 1.00 1.13 1.05 0.01 0.98 125
D 0 0 0 0.00 0.80 0.94 1.74 0.94 1.00 0.98 0.84 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.09 1.09 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.55 0.67 1.22 0.67 0.93 -0.13 -0.36 0.02 0.66 41
 
Base Pair (101 : 273) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.29 0.73 1.02 0.30 0.94 0.81 0.55 0.01 0.99 82
B 0 0 0 0.00 0.92 0.96 1.87 0.96 0.99 0.65 0.65 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.02 0.00 0.02 0.31 0.93 1.15 1.29 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.19 1.00 1.36 1.84 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.94 0.94 2.00 1.68 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 1.00 2.00 2.00 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.75 0.89 1.64 0.89 0.93 0.43 0.23 0.02 0.66 41
 
Base Pair (102 : 272) (Tertiary) Get: Frequencies
Aln Xch Ych PE PES Cov1 Cov3 C1+C3 WC WCGU XCons YCons DfDel Seq
A 0 0 0 0.00 0.42 0.63 1.05 0.63 0.90 0.38 0.14 0.01 0.99 82
B 0 0 0 0.00 0.57 0.96 1.53 0.96 0.96 1.57 1.57 0.00 0.96 72
C 0 0 0 0.00 0.54 0.91 1.45 0.81 0.91 1.05 1.23 0.00 0.99 305
Z 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.88 1.88 0.00 0.99 125
D 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 1.00 1.00 1.68 1.68 0.00 0.89 19
E 0 0 0 0.00 1.00 1.00 2.00 0.98 1.00 1.85 1.85 0.00 1.00 46
U 0 0 0 0.00 0.25 0.89 1.14 0.89 0.96 0.56 1.01 0.02 0.66 41

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