HEI Base Pair Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
3 3:25 T -- -- 0.5* -- 0.7* -- 0.3 -- 0.2* -- -- 0.2 0.7 -- 0.5 0.2 96.8 609
B -- -- 10.0* -- 4.0* -- 4.0 -- -- 2.0 -- -- -- -- 6.0 2.0 72.0 50
A -- -- -- -- 4.4 -- -- -- 2.2* -- -- -- 8.9* -- 2.2* 2.2 80.0 45
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 296
4 4:119 T 47.9* 7.0* 33.1* 9.3* 1.0 0.7 0.2 0.3 -- -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.4 610
B 89.7* 1.3* 0.3* 4.7* 1.7 1.0 -- -- -- -- 0.3 0.3 -- -- -- -- 0.7 300
A 66.7* 15.6* -- 15.6* 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 4.1* 11.9* 69.0* 12.6* -- 0.3 0.3 0.7 -- -- -- -- -- -- 0.3 0.3 0.3 294
5:118 T 59.1* 1.3* 4.4* 33.9* 0.8 0.2 -- 0.2 -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- 611
B 89.4* -- 0.3* 7.6* 1.3 -- -- 0.3 -- -- -- -- -- -- 0.3 -- 0.7 301
A 73.3* 15.6* -- 8.9* 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 25.9* 0.3* 8.8* 63.9* -- -- -- -- -- 0.3 -- -- 0.3 -- -- -- 0.3 294
6:117 T 2.5* 70.1* 0.5* 0.7* 0.3 25.8 -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- 612
B 2.0* 39.5 1.3 1.3* -- 55.1* -- -- -- -- -- -- -- 0.3 -- -- 0.3 301
A -- 97.8 -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 3.4* 94.9* -- -- 0.3 0.7 -- -- -- -- 0.3 -- -- 0.3 -- -- -- 295
7:116 T 42.6 0.7* 0.3* 2.5 52.4* 0.2 -- 0.2* -- -- -- -- 0.5 -- -- -- 0.9 611
B 63.6* 0.7* 0.7* 3.6* 28.8 0.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 1.9 302
A 40.0 -- -- 2.2 57.8 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 24.1 0.7* 0.3* 1.0 72.1* -- -- 0.3* -- -- -- -- 1.0 -- 0.3 -- -- 294
8:115 T 51.1* 2.5* 5.6* 32.5* 5.2 0.3 0.7 1.1 0.2 0.2 -- -- -- -- 0.2 0.2 0.4 612
B 39.4* 4.3* 6.6* 43.7* 2.6 0.7 1.3 0.7 0.3 -- -- -- -- -- -- -- 0.3 302
A 93.3* -- -- 2.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 4.4 45
E 55.3* 1.0* 5.4* 26.8* 8.5 -- -- 2.0 -- 0.3 -- -- -- -- 0.3 0.3 -- 295
9:114 T 0.5* 55.9* 7.7* -- 0.2 16.8 0.2 -- -- 17.6 0.2 0.3 0.2 -- 0.3 0.2 -- 612
B 1.0* 26.8 13.9 -- 0.3 16.2* 1.0 -- -- 37.7* 0.3 0.7 0.3 -- 0.7 -- 1.0 302
A -- 62.2* 11.1* -- -- 26.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E -- 82.4* 1.7* -- -- 15.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 295
11 11:68 T -- 1.6 -- -- -- 3.6 0.2 -- 93.3* -- -- -- -- 0.8 -- 0.5* -- 612
B -- 3.6 -- -- -- 7.9 0.3 -- 85.4* -- -- -- -- 1.3 -- 1.0* 0.3 302
A -- -- -- -- -- -- -- -- 97.8 -- -- -- -- 2.2 -- -- -- 45
E -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- 295
14:67 T 57.6* 32.4* 7.9* 0.7* 0.7 0.7 -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 611
B 86.4* 3.3* 5.3* 1.0* 1.7 1.3 -- 0.3 -- -- 0.3 -- 0.3 -- -- -- -- 302
A 97.8* -- -- 2.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 22.8* 65.3* 11.9* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 294
15:66 T 9.0* 69.9* 7.7* 5.7* -- 3.1 0.2 -- -- 3.9 -- -- 0.2 0.3 -- -- -- 612
B 2.0* 75.5* 3.0* 5.3* -- 5.6 0.3 -- -- 6.6 -- -- -- -- -- -- 1.6 302
A 2.2* 82.2* 13.3* -- -- -- -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- 45
E 16.6* 61.0* 13.2* 6.8* -- 1.0 -- -- -- 0.7 -- -- -- 0.7 -- -- -- 295
16:64 T 36.1* 3.9* 5.4* 42.6* 9.6 0.2 0.5 0.8 -- 0.2 0.2 0.2 0.3 -- -- -- -- 612
B 54.6* 2.0* 4.0* 16.9* 20.2 -- 0.3 1.0 -- -- 0.3 0.3 0.3 -- -- -- -- 302
A 91.1* -- -- 4.4* 4.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 9.8* 7.1* 7.5* 73.2* 0.3 0.3 0.7 0.7 -- -- 0.3 -- -- -- -- -- -- 295
17:63 T 23.1* 30.2* 18.9* 23.0* 1.3 0.8 0.2 0.5 0.3 0.7 0.5 -- -- 0.3 0.2 0.2 -- 610
B 22.8* 14.9* 26.2* 31.1* 2.0 0.7 0.3 0.3 -- 0.3 -- -- 0.3 0.3 0.3 0.3 -- 302
A 77.8* 4.4 -- 8.9* -- 6.7* -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 15.0* 49.8* 14.7* 16.4* 1.0 -- -- 0.3 0.3 1.0 1.0 -- -- 0.3 -- -- -- 293
18:62 T 36.1* 23.6* 15.1* 18.4* 3.0 0.7 -- 0.8 -- -- 0.2 -- -- -- 0.8 1.5 -- 610
B 30.1* 8.9* 23.8* 29.8* 3.3 0.7 -- -- -- -- -- -- -- -- 0.7 2.6 -- 302
A 17.8* 44.4* 8.9* 13.3* 8.9 4.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.2 -- 45
E 45.1* 34.8* 8.9* 7.2* 1.7 0.3 -- 1.7 -- -- -- -- -- -- 0.3 -- -- 293
19:61 T 37.3* 17.5* 19.0* 16.9* 2.6 3.6 -- 1.1 0.3 0.3 0.2 0.2 0.2 0.2 -- 0.7 -- 611
B 57.6* 4.3* 14.6* 15.9* 3.6 1.7 -- 0.3 0.3 -- -- -- 0.3 -- -- 1.3 -- 302
A 64.4* 11.1* 2.2* 17.8* 2.2 -- -- -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- 45
E 15.0* 32.3* 25.9* 17.3* 1.7 6.1 -- -- 0.3 0.7 -- 0.3 -- 0.3 -- -- -- 294
20:60 T 25.9* 10.1* 29.1* 16.2* 0.7 15.2 -- 0.2 0.3 -- 0.2 -- -- 1.6 0.2 0.3 -- 611
B 29.1* 5.3 11.6 22.5* 1.0 29.8* -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.7 -- 302
A 93.3* -- -- 4.4* 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
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21:59 T 79.5* 0.8* 0.2 1.1 1.6 0.5 -- 1.6 0.2 -- 0.3 1.0 2.1 0.5 8.9 1.5* 0.2 610
B 82.1* 1.7* -- 3.0* 0.3 0.3 -- 0.3 -- -- -- -- 4.3 1.0 4.7 2.0 0.3 301
A 66.7* -- 2.2 -- 15.6 2.2* -- 2.2 -- -- -- -- -- -- 11.1 -- -- 45
E 78.0* 0.3 -- 1.7* 0.7 0.3* -- 2.7 0.3 -- 0.7 0.3 0.3 -- 13.5 0.3 0.6 296
22 22:26 T 22.7* 2.0* 1.6 0.8 0.8 1.2 22.4* 0.8 20.6 0.5 0.5 -- 22.5 1.6 1.6 0.3* -- 608
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A 20.0 -- 8.9 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 68.9* -- 2.2* -- -- 45
E 0.7* 0.7 0.3 1.4 0.7 1.4* 44.6* 1.7 44.2 1.0 -- -- 2.4 -- -- -- 0.9 294
27 27:55 T 0.2 20.9 -- 2.3 0.5 0.7 -- 0.3 -- 0.3 2.8 62.3* -- 0.2* 7.7* 2.0 -- 612
B -- 46.0* -- 4.3* 0.3 -- -- -- -- -- 1.0 46.0 -- -- 1.3* 1.0 -- 302
A -- -- -- 2.2 -- 2.2 -- -- -- 2.2 -- 77.8* -- 2.2* -- 13.3 -- 45
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28:54 T 10.5* -- 6.0* 83.2* 0.2 -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 612
B 9.6* -- 0.3* 89.7* 0.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 302
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29:53 T 2.8* 94.9* 1.6* 0.2* -- 0.2 -- -- -- -- 0.2 -- -- 0.2 -- -- -- 612
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A -- 88.9* 11.1* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
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A -- 97.8 -- -- -- -- -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- 45
E 10.7* 81.5* 4.0* 0.7* 0.3 0.3 0.3 -- -- -- 0.3 1.7 -- -- -- -- -- 298
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32:48 T 70.8* 21.1* 2.3* 4.2* 0.2 1.1 -- -- -- -- -- -- -- 0.3 -- -- -- 612
B 81.1* 10.6* 0.7* 6.6* 0.3 0.3 -- -- -- -- -- -- -- 0.3 -- -- -- 302
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33:47 T 9.8* -- 33.0* 56.9* 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- 612
B 13.2* -- 32.8* 53.6* 0.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 302
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37:43 T -- 98.9 -- -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- -- 0.5 -- -- -- 612
B -- 98.0 -- -- -- 1.3 -- -- -- -- -- -- -- 0.7 -- -- -- 301
A -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
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B -- -- 4.3 -- 0.3* -- 93.4* 1.7 -- -- -- -- 0.3 -- -- -- -- 302
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39:44 T -- -- 93.1 -- -- -- 0.2 -- -- 0.3 -- -- 0.2 -- 6.2 -- -- 611
B -- -- 99.0 -- -- -- 0.3 -- -- 0.7 -- -- -- -- -- -- -- 302
A -- -- 100 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E -- -- 86.5 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.3 -- 13.1 -- -- 297

Last generated on 26 December 2000.