HEI | Base Pair | Aln | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
51 | 51:52 | T | -- | 0.3 | 4.6 | 0.2 | -- | 2.1* | 61.4* | 1.0 | 0.5 | 14.1 | 8.0* | -- | 3.8 | -- | 2.3 | 1.8 | -- | 611 |
B | -- | 0.3 | 6.6 | 0.3 | -- | 4.3* | 51.3* | 1.7 | 1.0 | 8.9 | 16.6* | -- | -- | -- | 4.6 | 4.3 | -- | 302 | ||
A | -- | 2.2* | 13.3 | -- | -- | -- | 75.6* | 2.2 | -- | 6.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 | ||
E | -- | -- | 1.3 | 0.3 | -- | -- | 69.7 | -- | -- | 20.9 | -- | -- | 7.7 | -- | -- | -- | -- | 297 | ||
69 | 69:112 | T | 9.2* | 78.1* | 5.1* | 1.6* | -- | 0.5 | 1.1 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 3.9 | -- | 611 |
B | 9.6* | 84.1* | 3.3* | 1.3* | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 302 | ||
A | -- | 2.2* | 24.4 | -- | -- | -- | 17.8* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 53.3* | -- | 45 | ||
E | 9.4* | 84.5* | 3.4* | 2.0* | -- | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 297 | ||
70:111 | T | 8.9* | 66.6* | 9.7* | 3.1* | 1.0 | 8.2 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 2.3 | -- | 610 | |
B | -- | 85.8* | 3.0* | 1.0* | -- | 9.3 | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 0.3 | 302 | ||
A | 4.4* | 2.2* | 28.9* | 11.1* | -- | 20.0 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 28.9 | -- | 45 | ||
E | 17.9* | 56.4* | 13.5* | 3.7* | 2.0 | 6.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 296 | ||
71:110 | T | 7.7 | 14.9* | 15.5 | 10.0* | 1.1 | 4.7 | 7.4 | 0.3 | -- | 0.5 | 0.8 | -- | 34.9* | -- | 0.5* | 1.1 | 0.5 | 611 | |
B | 0.3 | -- | 1.0 | 1.3* | 0.3 | -- | 15.3 | 0.7 | -- | 0.7 | 1.3* | -- | 76.7* | -- | 1.0 | -- | 1.3 | 301 | ||
A | 26.7* | 33.3* | 13.3* | 8.9* | 2.2 | -- | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | 13.3 | -- | 45 | ||
E | 12.1* | 27.2* | 30.2* | 18.5* | 1.7 | 9.7 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 298 | ||
72:109 | T | 30.9* | 5.7* | 3.6* | 57.0* | 0.8 | 1.5 | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 0.2 | 611 | |
B | 0.3* | -- | 1.3* | 95.7* | 0.3 | 1.0 | 0.3 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.3 | 302 | ||
A | 15.6* | 42.2* | 26.7* | 2.2* | -- | 11.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 45 | ||
E | 63.0* | 5.7* | 2.0* | 26.9* | 2.0 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 297 | ||
73:108 | T | 36.9* | 2.8 | 1.1 | 2.9 | 0.8 | 37.4* | 3.3* | 9.2 | 0.2 | 3.1 | -- | 0.5* | 0.2 | 0.3 | 0.3 | 1.0 | -- | 612 | |
B | -- | 0.3 | 0.7 | 1.0 | -- | 80.5* | 7.3* | 1.3 | 0.7 | 6.3 | -- | -- | 0.3 | 0.7 | 0.7 | -- | 0.3 | 302 | ||
A | 35.6* | 17.8* | 11.1* | 15.6* | 6.7 | 2.2 | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.9 | -- | 45 | ||
E | 72.5* | 4.0* | 0.3* | 3.0* | 0.7 | 0.3 | -- | 17.4 | -- | -- | -- | 1.0 | -- | -- | -- | 0.7 | -- | 298 | ||
74:107 | T | 1.3 | -- | 1.6 | 27.3* | -- | 1.3* | 3.9 | 11.4 | 11.1 | -- | 0.2* | -- | 40.8* | 0.2 | 0.5 | 0.2 | 0.2 | 612 | |
B | -- | -- | 2.6 | 0.3 | -- | -- | 3.0 | 0.3 | 5.0* | -- | 0.3* | -- | 88.1* | 0.3 | -- | -- | -- | 302 | ||
A | 53.3* | 6.7* | 17.8* | 4.4* | 2.2 | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.9 | 4.4 | -- | 45 | ||
E | -- | -- | -- | 57.7 | -- | -- | 2.7 | 20.8 | 18.8 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 298 | ||
75:106 | T | 1.1 | -- | -- | -- | 0.2 | -- | 13.7 | 0.2 | 0.2* | 0.2 | -- | -- | 52.5* | 32.0 | -- | -- | -- | 612 | |
B | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 29.8* | 0.3 | 0.7 | 0.3 | -- | -- | 1.0 | 67.5* | -- | -- | -- | 302 | ||
A | 33.3* | 11.1* | 11.1* | 20.0* | 4.4 | 6.7 | -- | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | 2.2 | 8.9 | -- | 45 | ||
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.7 | 0.3 | -- | -- | -- | 298 | ||
76:105 | T | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | 99.8 | 612 | |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 302 | ||
A | -- | -- | -- | -- | -- | 15.6* | -- | 15.6* | 2.2 | 15.6 | 11.1 | -- | 20.0* | 2.2 | 2.2 | 2.2 | 13.3 | 45 | ||
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 298 | ||
77:104 | T | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 99.8 | 612 | |
B | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 302 | ||
A | 11.1* | -- | 33.3* | -- | -- | -- | 33.3 | -- | 11.1* | -- | -- | -- | 8.9 | -- | 2.2 | -- | -- | 45 | ||
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | 298 | ||
79:103 | T | -- | 1.0* | 98.7* | -- | -- | 0.2 | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 612 | |
B | -- | -- | 98.7 | -- | -- | 0.3 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.7 | 302 | ||
A | -- | 13.3* | 86.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 | ||
E | -- | -- | 99.7 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 298 | ||
80:102 | T | -- | -- | 0.3 | 0.5 | -- | -- | 5.2 | 0.3 | 92.3* | 0.7* | -- | -- | 0.2 | 0.3 | -- | -- | 0.2 | 612 | |
B | -- | -- | 0.3 | 1.3 | -- | -- | 10.6 | 0.7 | 85.8* | -- | -- | -- | 0.3* | 0.7 | -- | -- | 0.3 | 302 | ||
A | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | 2.2 | -- | 86.7* | 8.9* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 | ||
E | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 298 | ||
81:101 | T | 15.9* | 66.3* | 2.0* | 0.5* | 15.1 | -- | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | 611 | |
B | 15.9 | 48.2* | 1.3* | 1.0 | 33.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 301 | ||
A | 13.3* | 86.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 | ||
E | 16.1* | 80.9* | 2.7* | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 298 | ||
82:100 | T | 0.3* | 8.5 | 0.2 | -- | 0.2 | 89.2* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2* | -- | 0.2 | 0.2 | 1.1 | -- | 612 | |
B | 0.3* | 3.6 | 0.3 | -- | -- | 94.7* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.7 | -- | 0.3 | -- | 302 | ||
A | -- | -- | -- | -- | -- | 100.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 | ||
E | 0.7* | 14.8 | -- | -- | 0.3 | 80.9* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3* | -- | -- | 0.3 | 2.7 | -- | 298 | ||
83:99 | T | 17.3 | 2.0* | 3.9 | 17.7 | 28.8* | -- | -- | 2.9 | 0.3 | -- | 1.0 | 0.7 | -- | -- | 3.9* | 21.1 | 0.3 | 611 | |
B | 10.0 | 1.0* | 2.0 | 9.0 | 51.2* | 0.3 | -- | -- | 0.7 | -- | 2.0 | 1.3 | -- | -- | 8.6* | 13.0 | 1.0 | 301 | ||
A | 35.6 | -- | -- | 11.1 | 53.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 | ||
E | 22.1* | 3.0* | 6.4 | 26.8 | 4.4 | -- | -- | 6.0 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 31.2* | -- | 298 | ||
84:98 | T | 34.8* | 27.4* | 22.5* | 9.5* | 1.1 | 1.6 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.2 | 0.2 | 0.2 | -- | 1.3 | 0.2 | 0.7 | 609 | |
B | 19.0* | 35.3* | 32.7* | 4.0* | 0.7 | 2.7 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 0.3 | 0.3 | -- | 2.7 | 0.3 | 1.3 | 300 | ||
A | 42.2* | 28.9* | 6.7* | 22.2* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 | ||
E | 47.1* | 21.5* | 15.2* | 12.5* | 2.4 | 0.7 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 297 | ||
85:97 | T | 71.4* | 5.2* | 1.0* | 15.7* | 2.5 | -- | -- | -- | 0.2 | 0.7 | 0.2 | -- | 0.5 | 0.2 | 0.2 | 0.3 | 2.2 | 612 | |
B | 64.2* | 4.3* | 1.7* | 18.5* | 2.3 | 0.3 | -- | -- | 0.3 | 1.7 | -- | -- | 1.0 | -- | 0.3 | 0.7 | 4.6 | 302 | ||
A | 13.3* | 13.3* | 4.4* | 55.6* | 13.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 45 | ||
E | 86.6* | 5.0* | 0.3* | 6.0* | 1.0 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | 298 | ||
86:96 | T | 24.7* | 7.5 | 6.2* | 9.8 | 0.8 | 3.1 | 0.5 | 1.0 | 14.5* | 0.2 | -- | 0.2* | 23.9 | 2.0 | 0.2 | 0.5 | 5.1 | 612 | |
B | 43.0* | 14.2* | 10.3* | 10.3* | 1.3 | 7.3 | 0.7 | 0.3 | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | -- | 0.3 | 1.0 | 10.6 | 302 | ||
A | 68.9* | 4.4* | 6.7* | 2.2* | -- | 2.2 | -- | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 13.3 | 45 | ||
E | -- | 0.3 | 1.3 | 10.1 | 0.7 | -- | 0.7 | 1.7 | 29.9* | -- | -- | 0.3* | 51.0* | 4.0 | -- | -- | -- | 298 | ||
88:95 | T | 64.7* | 17.8* | 0.3* | 2.1* | 2.9 | 2.3 | -- | 1.3 | -- | 0.2 | -- | -- | -- | -- | 0.8 | 0.2 | 7.4 | 612 | |
B | 42.7* | 27.5* | 0.3* | 1.7* | 3.6 | 3.3 | -- | 2.6 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 1.3 | 0.3 | 16.2 | 302 | ||
A | 37.8* | 24.4* | -- | 11.1* | 2.2 | 8.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 15.5 | 45 | ||
E | 88.9* | 6.4* | 0.7* | 1.0* | 2.0 | 0.3 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 298 | ||
89:94 | T | 65.5* | 7.2* | 0.2* | 3.1* | 1.0 | 1.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.2 | -- | -- | 0.2 | 1.0 | 20.1 | 612 | |
B | 44.0* | 7.3* | -- | 0.7* | 2.0 | 1.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | 0.7 | 43.3 | 302 | ||
A | 11.1* | 42.2* | 2.2 | 6.7 | -- | 13.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.9* | 15.6 | 45 | ||
E | 94.0* | 1.0* | -- | 5.0* | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 298 | ||
90:93 | T | 0.3 | -- | 7.7 | 2.1* | -- | 0.3 | 1.1 | 0.7 | 1.0 | 0.3 | 1.0 | 0.3 | 58.2* | 5.1 | 1.6* | 1.5 | 18.8 | 612 | |
B | 1.0 | -- | 16.6* | 3.0* | -- | 0.7 | 2.6 | 1.3 | 2.0 | 1.0 | 2.3* | 1.0 | 13.2 | 10.6* | 3.3 | 3.3 | 38.1 | 302 | ||
A | -- | -- | -- | 11.1* | -- | 2.2* | -- | 2.2 | -- | -- | -- | -- | 73.3* | -- | -- | -- | 11.1 | 45 | ||
E | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | 0.7 | -- | -- | -- | -- | -- | 99.0 | -- | -- | -- | -- | 298 |
Last generated on 26 December 2000.