HEI Base Pair Aln GC CG UA AU GU UG AA AC AG CA CC CU GA GG UC UU gap Seq
51 51:52 T -- 0.3 4.6 0.2 -- 2.1* 61.4* 1.0 0.5 14.1 8.0* -- 3.8 -- 2.3 1.8 -- 611
B -- 0.3 6.6 0.3 -- 4.3* 51.3* 1.7 1.0 8.9 16.6* -- -- -- 4.6 4.3 -- 302
A -- 2.2* 13.3 -- -- -- 75.6* 2.2 -- 6.7 -- -- -- -- -- -- -- 45
E -- -- 1.3 0.3 -- -- 69.7 -- -- 20.9 -- -- 7.7 -- -- -- -- 297
69 69:112 T 9.2* 78.1* 5.1* 1.6* -- 0.5 1.1 -- -- 0.2 -- -- -- -- 0.3 3.9 -- 611
B 9.6* 84.1* 3.3* 1.3* -- 0.3 -- -- 0.3 0.3 -- -- -- -- 0.3 -- 0.3 302
A -- 2.2* 24.4 -- -- -- 17.8* -- -- -- -- -- -- -- 2.2 53.3* -- 45
E 9.4* 84.5* 3.4* 2.0* -- 0.7 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 297
70:111 T 8.9* 66.6* 9.7* 3.1* 1.0 8.2 -- -- 0.2 -- -- 0.2 -- -- -- 2.3 -- 610
B -- 85.8* 3.0* 1.0* -- 9.3 -- -- -- 0.3 -- -- -- -- -- 0.3 0.3 302
A 4.4* 2.2* 28.9* 11.1* -- 20.0 -- -- 2.2 -- -- 2.2 -- -- -- 28.9 -- 45
E 17.9* 56.4* 13.5* 3.7* 2.0 6.4 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 296
71:110 T 7.7 14.9* 15.5 10.0* 1.1 4.7 7.4 0.3 -- 0.5 0.8 -- 34.9* -- 0.5* 1.1 0.5 611
B 0.3 -- 1.0 1.3* 0.3 -- 15.3 0.7 -- 0.7 1.3* -- 76.7* -- 1.0 -- 1.3 301
A 26.7* 33.3* 13.3* 8.9* 2.2 -- -- -- -- 2.2 -- -- -- -- -- 13.3 -- 45
E 12.1* 27.2* 30.2* 18.5* 1.7 9.7 -- -- -- -- 0.3 -- -- -- -- 0.3 -- 298
72:109 T 30.9* 5.7* 3.6* 57.0* 0.8 1.5 -- 0.2 -- -- -- -- 0.2 -- -- -- 0.2 611
B 0.3* -- 1.3* 95.7* 0.3 1.0 0.3 0.3 -- -- -- -- 0.3 -- -- -- 0.3 302
A 15.6* 42.2* 26.7* 2.2* -- 11.1 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 2.2 45
E 63.0* 5.7* 2.0* 26.9* 2.0 0.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 297
73:108 T 36.9* 2.8 1.1 2.9 0.8 37.4* 3.3* 9.2 0.2 3.1 -- 0.5* 0.2 0.3 0.3 1.0 -- 612
B -- 0.3 0.7 1.0 -- 80.5* 7.3* 1.3 0.7 6.3 -- -- 0.3 0.7 0.7 -- 0.3 302
A 35.6* 17.8* 11.1* 15.6* 6.7 2.2 -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- 8.9 -- 45
E 72.5* 4.0* 0.3* 3.0* 0.7 0.3 -- 17.4 -- -- -- 1.0 -- -- -- 0.7 -- 298
74:107 T 1.3 -- 1.6 27.3* -- 1.3* 3.9 11.4 11.1 -- 0.2* -- 40.8* 0.2 0.5 0.2 0.2 612
B -- -- 2.6 0.3 -- -- 3.0 0.3 5.0* -- 0.3* -- 88.1* 0.3 -- -- -- 302
A 53.3* 6.7* 17.8* 4.4* 2.2 2.2 -- -- -- -- -- -- -- -- 8.9 4.4 -- 45
E -- -- -- 57.7 -- -- 2.7 20.8 18.8 -- -- -- -- -- -- -- -- 298
75:106 T 1.1 -- -- -- 0.2 -- 13.7 0.2 0.2* 0.2 -- -- 52.5* 32.0 -- -- -- 612
B -- -- -- -- 0.3 -- 29.8* 0.3 0.7 0.3 -- -- 1.0 67.5* -- -- -- 302
A 33.3* 11.1* 11.1* 20.0* 4.4 6.7 -- -- -- 2.2 -- -- -- -- 2.2 8.9 -- 45
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.7 0.3 -- -- -- 298
76:105 T -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- 99.8 612
B -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 302
A -- -- -- -- -- 15.6* -- 15.6* 2.2 15.6 11.1 -- 20.0* 2.2 2.2 2.2 13.3 45
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 298
77:104 T -- -- -- -- -- -- 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 99.8 612
B -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 302
A 11.1* -- 33.3* -- -- -- 33.3 -- 11.1* -- -- -- 8.9 -- 2.2 -- -- 45
E -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 298
79:103 T -- 1.0* 98.7* -- -- 0.2 0.2 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 612
B -- -- 98.7 -- -- 0.3 0.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.7 302
A -- 13.3* 86.7* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E -- -- 99.7 -- -- 0.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 298
80:102 T -- -- 0.3 0.5 -- -- 5.2 0.3 92.3* 0.7* -- -- 0.2 0.3 -- -- 0.2 612
B -- -- 0.3 1.3 -- -- 10.6 0.7 85.8* -- -- -- 0.3* 0.7 -- -- 0.3 302
A -- -- 2.2 -- -- -- 2.2 -- 86.7* 8.9* -- -- -- -- -- -- -- 45
E -- -- -- -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- 298
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B 15.9 48.2* 1.3* 1.0 33.2* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 0.3 -- 301
A 13.3* 86.7* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 16.1* 80.9* 2.7* -- -- -- -- 0.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- 298
82:100 T 0.3* 8.5 0.2 -- 0.2 89.2* -- -- -- -- -- 0.2* -- 0.2 0.2 1.1 -- 612
B 0.3* 3.6 0.3 -- -- 94.7* -- -- -- -- -- -- -- 0.7 -- 0.3 -- 302
A -- -- -- -- -- 100.0 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 0.7* 14.8 -- -- 0.3 80.9* -- -- -- -- -- 0.3* -- -- 0.3 2.7 -- 298
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A 35.6 -- -- 11.1 53.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
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84:98 T 34.8* 27.4* 22.5* 9.5* 1.1 1.6 -- -- 0.3 -- 0.2 0.2 0.2 -- 1.3 0.2 0.7 609
B 19.0* 35.3* 32.7* 4.0* 0.7 2.7 -- -- 0.3 -- 0.3 0.3 0.3 -- 2.7 0.3 1.3 300
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E 47.1* 21.5* 15.2* 12.5* 2.4 0.7 -- -- 0.3 -- 0.3 -- -- -- -- -- -- 297
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A 13.3* 13.3* 4.4* 55.6* 13.3 -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 45
E 86.6* 5.0* 0.3* 6.0* 1.0 -- -- -- -- -- 0.3 -- -- 0.3 -- -- 0.3 298
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B 43.0* 14.2* 10.3* 10.3* 1.3 7.3 0.7 0.3 -- 0.3 -- -- 0.3 -- 0.3 1.0 10.6 302
A 68.9* 4.4* 6.7* 2.2* -- 2.2 -- -- 2.2 -- -- -- -- -- -- -- 13.3 45
E -- 0.3 1.3 10.1 0.7 -- 0.7 1.7 29.9* -- -- 0.3* 51.0* 4.0 -- -- -- 298
88:95 T 64.7* 17.8* 0.3* 2.1* 2.9 2.3 -- 1.3 -- 0.2 -- -- -- -- 0.8 0.2 7.4 612
B 42.7* 27.5* 0.3* 1.7* 3.6 3.3 -- 2.6 -- 0.3 -- -- -- -- 1.3 0.3 16.2 302
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E 94.0* 1.0* -- 5.0* -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- -- 298
90:93 T 0.3 -- 7.7 2.1* -- 0.3 1.1 0.7 1.0 0.3 1.0 0.3 58.2* 5.1 1.6* 1.5 18.8 612
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A -- -- -- 11.1* -- 2.2* -- 2.2 -- -- -- -- 73.3* -- -- -- 11.1 45
E -- -- 0.3 -- -- -- 0.7 -- -- -- -- -- 99.0 -- -- -- -- 298

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