Definitions of Intron Types
Phylogeny |
Loc |
All |
G1 |
I |
IA |
IA1 |
IA2 |
IA3 |
IB |
IB1 |
IB2 |
IB3 |
IB4 |
IC |
IC1 |
IC2 |
IC3 |
ID |
IE |
G2 |
II |
IIA |
IIB |
TBD |
Unknown |
cellular organisms |
N |
2760 |
2311 |
775 |
- |
1 |
2 |
1 |
1 |
1 |
- |
- |
11 |
2 |
1099 |
- |
93 |
- |
325 |
8 |
- |
6 |
2 |
- |
441 |
C |
1044 |
393 |
6 |
- |
26 |
2 |
46 |
2 |
- |
- |
- |
54 |
- |
- |
- |
257 |
- |
- |
651 |
- |
121 |
530 |
- |
- |
M |
349 |
235 |
3 |
- |
54 |
1 |
18 |
29 |
38 |
17 |
6 |
20 |
- |
5 |
31 |
- |
13 |
- |
110 |
- |
66 |
44 |
- |
4 |
Archaea |
N |
108 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
108 |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Desulfurococcales |
N |
38 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
38 |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Thermoproteales |
N |
48 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
48 |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Bacteria |
N |
96 |
88 |
- |
- |
- |
2 |
1 |
1 |
- |
- |
- |
11 |
- |
- |
- |
73 |
- |
- |
8 |
- |
6 |
2 |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
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- |
M |
- |
- |
- |
- |
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- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Chlamydiales |
N |
1 |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
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- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Eukaryota |
N |
2556 |
2223 |
775 |
- |
1 |
- |
- |
- |
1 |
- |
- |
- |
2 |
1099 |
- |
20 |
- |
325 |
- |
- |
- |
- |
- |
333 |
C |
1044 |
393 |
6 |
- |
26 |
2 |
46 |
2 |
- |
- |
- |
54 |
- |
- |
- |
257 |
- |
- |
651 |
- |
121 |
530 |
- |
- |
M |
349 |
235 |
3 |
- |
54 |
1 |
18 |
29 |
38 |
17 |
6 |
20 |
- |
5 |
31 |
- |
13 |
- |
110 |
- |
66 |
44 |
- |
4 |
Dictyostelium |
N |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
1 |
1 |
- |
- |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Acanthamoebidae |
N |
17 |
17 |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
16 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
6 |
6 |
- |
- |
- |
- |
4 |
2 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Alveolata |
N |
15 |
15 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
15 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Fungi/Metazoa group |
N |
1828 |
1508 |
761 |
- |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
490 |
- |
- |
- |
256 |
- |
- |
- |
- |
- |
320 |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
196 |
156 |
3 |
- |
46 |
- |
1 |
22 |
6 |
16 |
6 |
9 |
- |
5 |
31 |
- |
11 |
- |
36 |
- |
15 |
21 |
- |
4 |
Fungi |
N |
1828 |
1508 |
761 |
- |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
490 |
- |
- |
- |
256 |
- |
- |
- |
- |
- |
320 |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
186 |
148 |
3 |
- |
46 |
- |
1 |
22 |
2 |
13 |
6 |
9 |
- |
5 |
30 |
- |
11 |
- |
34 |
- |
15 |
19 |
- |
4 |
Metazoa |
N |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
2 |
2 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
1 |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Rhodophyta |
N |
187 |
187 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
186 |
- |
- |
- |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
2 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
2 |
- |
- |
2 |
- |
- |
stramenopiles |
N |
15 |
2 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
1 |
- |
- |
- |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
13 |
C |
4 |
4 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
4 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
10 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
10 |
- |
2 |
8 |
- |
- |
Viridiplantae |
N |
425 |
425 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
350 |
- |
12 |
- |
63 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
1040 |
389 |
6 |
- |
26 |
2 |
46 |
2 |
- |
- |
- |
54 |
- |
- |
- |
253 |
- |
- |
651 |
- |
121 |
530 |
- |
- |
M |
132 |
72 |
- |
- |
7 |
1 |
13 |
5 |
32 |
1 |
- |
11 |
- |
- |
- |
- |
2 |
- |
60 |
- |
47 |
13 |
- |
- |
Chlorophyta |
N |
301 |
301 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
242 |
- |
- |
- |
59 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
133 |
129 |
6 |
- |
26 |
2 |
43 |
2 |
- |
- |
- |
48 |
- |
- |
- |
2 |
- |
- |
4 |
- |
- |
4 |
- |
- |
M |
30 |
24 |
- |
- |
7 |
1 |
4 |
3 |
1 |
1 |
- |
5 |
- |
- |
- |
- |
2 |
- |
6 |
- |
- |
6 |
- |
- |
Streptophyta |
N |
124 |
124 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
108 |
- |
12 |
- |
4 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
907 |
260 |
- |
- |
- |
- |
3 |
- |
- |
- |
- |
6 |
- |
- |
- |
251 |
- |
- |
647 |
- |
121 |
526 |
- |
- |
M |
102 |
48 |
- |
- |
- |
- |
9 |
2 |
31 |
- |
- |
6 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
54 |
- |
47 |
7 |
- |
- |
Foraminifera |
N |
1 |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Acrasida |
N |
3 |
3 |
3 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Heterolobosea |
N |
29 |
29 |
4 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
23 |
- |
- |
- |
2 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Schizopyrenida |
N |
24 |
24 |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
21 |
- |
- |
- |
2 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Physarida |
N |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
Plasmodiophoridae |
N |
3 |
3 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
2 |
- |
- |
- |
1 |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
C |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
M |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |
- |