Last modified on 14 July 2000.

Cyan background: new E Loop proposal.
%: percentages greater than 1%. #: pairing greater than 2%.
Motif ID Position A % C G U Position A C G U Pairing # Unpaired
5S:xx 98 - - 100 - 78 100 - - - GA  
99 100 - - - 77 - - - 100 AU  
          76 - - 100 -   G
100 100 - - - 75 100 - - - AA  
23S:S/R 2664 - - 100 - 2657 100 - - - GA  
2665 100 - - - 2656 - - - 100 AU  
          2655 - - 100 -   G
2666 100 - - - 2654 99 - - - AA  
16S:449/487 447 5 - 95 - 487 99 - - - GA, AA  
448 98 - 2 - 486 - - 2 96 AU  
          485 - - 76 23   G
449 53 25 20 3 484 6 - 89 4 AG, CG, GG, AU, AA, UA  
16S:909 907 100 - - - 892 100 - - - AA  
908 100 - - - 891 - - - 100 AU  
          890 - - 99 -   G
909 100 - - - 889 100 - - - AA  
16S:1349 1373 - - 100 - 1349 100 - - - GA  
1374 100 - - - 1348 - - - 100 AU  
          1347 - - 100 -   G
1375 100 - - - 1346 100 - - - AA  
23S:207 189 - - 100 - 207 99 - - - GA  
190 100 - - - 206 - - - 100 AU  
          205 - - 97 3   G
191 100 - - - 204 100 - - - AA  
23S:244/257 254 - - 99 - 244 100 - - - GA  
255 100 - - - 243 - - - 100 AU  
          242 - - 100 -   G
256 99 - - - 241 88 - - 12 AA, AU  
23S:374 400 - - 100 - 374 100 - - - GA  
401 100 - - - 373 - - - 100 AU  
          372 - - 100 -   G
402 100 - - - 371 100 - - - AA  
23S:460 469 - - 99 - 460 99 - - - GA  
470 100 - - - 459 - - - 100 AU  
          458 - - 100 -   G
471 100 - - - 457 100 - - - AA  
23S:1189 818 - - 100 - 1189 99 - - - GA  
819 100 - - - 1188 - - - 100 AU  
          1187 - - 100 -   G
820 92 - 5 3 1186 - - 99 - AG, GG, UG  
23S:861 916 - - 100 - 861 100 - - - GA  
917 100 - - - 860 - - - 100 AU  
          859 - - 100     G
918 100 - - - 858 - - 99 - AG  
23S:1268 2012 - - 100 - 1268 100 - - - GA  
2013 100 - - - 1267 - - - 100 AU  
          1266 - - 100 -   G
2014 100 - - - 1265 100 - - - AA