Last modified on 11 May 2000.


U-Turn Pattern B A C E
16S:1315-1322 [B (Hairpin)] UGCAACUC 83.1 31.9 80.5 --
UGAAACUC -- 19.3 11.2 --
UGUAACUC 0.2 27.1 -- --
UGAAACCC 0.7 10.1 -- --
UGUAACCC 0.0 5.8 -- --
UGCAAUUA -- -- -- 42.2
UGCAAUUU -- -- 4.1 19.7
UGCAAUUG -- -- -- 12.2
UGUAAUUA -- -- -- 6.4
gap 4.3 0.5 0.6 7.1
Other 11.7 5.3 3.6 12.4
N 29 12 8 23
Seq 4670 207 169 1027
23S:306-311 [B (Hairpin)] UGGAAA 69.8 8.3 -- 22.7
UGGGAA 15.1 -- -- 4.5
UGGAAU 1.4 41.7 5.0 0.5
UGGAAC 2.9 41.7 1.0 --
UGAAAU -- 5.6 -- --
CGGAAG -- -- -- 19.1
UUGAUG -- -- -- 10.9
AGGAAU -- -- -- 7.3
UUUCUU -- -- -- 5.0
gap 1.8 -- 92.0 4.1
Other 9.0 2.7 2.0 25.9
N 12 5 4 42
Seq 278 36 100 220
23S:745-752 [B (Hairpin)] GUUGAAAA 78.7 -- 88.0 --
CGUGCAAU -- 27.0 -- --
UCCUACAA -- 16.2 -- --
CGUGCAAA -- 13.5 -- 96.6
GUCGUGCA -- 8.1 -- --
ACCGCGAA -- 5.4 -- --
UGUGCAAA -- 5.4 -- --
GAUGUGAA -- 5.4 -- --
CGUGCAAC -- 5.4 -- 0.5
GUUGAAGA -- -- 8.0 --
gap -- -- -- --
Other 21.3 13.6 4.0 2.9
N 17 13 5 7
Seq 282 37 100 205
23S:780-784 [B (Hairpin)] GAAAG 65.9 59.5 -- 98.5
GAAAU 30.1 -- 100.0 --
AAAAG -- 27.0 -- --
GAAAA 3.2 5.4 -- --
CAAAA -- 5.4 -- --
gap 0.4 -- -- 0.5
Other 0.4 2.7 -- 1.0
N 4 5 1 3
Seq 279 37 100 205