Last modified on 21 June 2002.
HEI | Base Pair | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
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HEI | Base Pair | GC | CG | UA | AU | GU | UG | AA | AC | AG | CA | CC | CU | GA | GG | UC | UU | gap | Seq |
Helix 1A | 58:73 | 2.2* | 50.5* | 3.5* | 1.6* | 1.6 | 20.5 | 0.3 | 0.3 | 1.6 | 2.8 | 0.6 | 1.9 | -- | 0.6 | 0.3 | 2.5 | 9.1 | 317 |
59:72 | 39.4* | 0.9 | 0.9 | 20.6* | 24.4 | 1.2* | -- | -- | -- | -- | 1.9 | 0.6 | 0.9 | 1.6 | 1.6 | 2.8 | 3.1 | 320 | |
60:71 | 29.3* | -- | 0.3* | 32.1* | 29.9 | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | 0.6 | 0.6 | 3.7 | 2.8 | 321 | |
61:70 | 1.2 | 0.3* | 1.9 | 9.9* | 0.6 | 0.6 | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | 3.4* | 3.7 | 77.6 | 322 | |
62:69 | 28.5 | 8.8* | 1.6* | 5.0 | 48.6* | -- | -- | 0.3* | -- | -- | -- | -- | -- | 0.6 | 0.3 | 2.2 | 4.0 | 319 | |
63:68 | -- | 76.3* | 0.9* | 2.8* | 0.6 | 9.7 | -- | -- | 0.3 | 0.6 | 0.3 | 1.9 | -- | 0.9 | -- | 2.2 | 3.4 | 321 | |
Helix 1B | 97:129 | -- | 65.6* | 13.4* | -- | -- | 12.5 | 0.3 | -- | -- | 2.2 | 0.6 | 0.3 | -- | 0.3 | 0.9 | 3.1 | 0.6 | 320 |
98:128 | 32.7* | -- | -- | 27.7* | 26.8 | 2.5* | 0.3 | 1.6 | -- | -- | 0.6 | 0.9 | 0.9 | -- | 0.3 | 4.7 | 1.0 | 321 | |
100:127 | -- | 3.1* | 60.1* | 1.2 | 7.2* | 18.7 | 0.6 | 0.3* | 0.6 | 2.2 | 0.3 | 0.6 | 0.9 | 0.6 | 0.3 | 3.1 | -- | 321 | |
101:126 | 1.2* | 43.0* | 9.3* | 0.3* | 0.3 | 31.5 | -- | -- | 0.9 | 0.3 | 0.6 | -- | 0.6 | 7.5 | 0.6 | 3.7 | -- | 321 | |
102:125 | -- | 44.7* | 8.1* | 3.1* | 0.9 | 21.9 | -- | -- | 1.2 | 2.2 | 0.3 | 8.1 | -- | 1.6 | 1.6 | 5.0 | 1.2 | 320 | |
103:124 | 5.3* | -- | 5.3* | 47.0* | 14.0 | 0.3 | 5.3 | 1.2 | 1.2 | 0.6 | 0.3 | 0.9 | 3.7 | 0.9 | 0.3 | 12.8 | 0.6 | 321 | |
104:123 | 0.6* | 7.8* | 35.1* | 7.1* | -- | 11.2 | 3.7 | 4.3 | 4.0 | 0.9 | 2.2 | 1.2 | -- | -- | 15.5 | 5.9 | 0.3 | 322 | |
105:122 | 62.5* | 1.6* | 0.3 | 2.2 | 10.3 | 2.8 | 0.3* | 0.9 | 0.6 | 0.3 | -- | 2.2 | 6.6 | 0.3 | 3.1 | 5.6* | 0.3 | 320 | |
106:121 | 12.1* | 0.3 | 0.3 | 1.2* | 3.4 | -- | -- | 1.2 | 0.3 | 1.6* | 0.3 | -- | 5.3 | 1.6 | -- | 0.6 | 71.7 | 322 | |
108:120 | 1.3 | 5.0 | 4.7* | 1.9* | 0.9 | 3.4 | -- | 0.6 | -- | 15.4 | 27.9* | 4.4 | 1.3 | 4.4* | 11.3 | 3.8 | 13.7 | 319 | |
109:119 | 1.3 | 6.0 | 1.9 | 2.2 | 0.3 | 16.9* | 0.6 | 1.9* | 0.3 | 5.0 | 18.8 | 25.7* | 0.6* | -- | 11.3 | 4.1 | 3.1 | 319 | |
110:118 | 0.6* | 31.4* | 5.0* | 0.6* | 0.3 | 13.4 | -- | 0.3 | 6.2 | 9.0 | 3.1 | 6.2 | 0.3 | 1.9 | 0.9 | 0.6 | 20.2 | 322 | |
111:117 | 0.3 | 14.6 | 1.2 | 0.3 | -- | 29.5* | 1.9 | -- | 3.7 | 0.3 | 0.9 | 1.9* | 1.9* | 3.1 | -- | 1.9 | 38.5 | 322 | |
112:116 | -- | 10.7 | 3.1 | 2.8* | 1.3 | 48.3* | 0.6 | 0.3 | 5.3 | 4.7* | 0.6 | -- | 0.6 | 1.9 | 0.9 | 6.6 | 12.2 | 319 | |
Helix 1C | 156:170 | 96.6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.9 | -- | -- | 2.2 | 321 |
157:169 | 89.7 | -- | -- | -- | 1.9 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 8.4 | 321 | |
158:168 | -- | 97.8 | -- | -- | -- | 0.6 | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | 1.2 | 321 | |
159:167 | -- | -- | -- | 99.4 | 0.3 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | 322 | |
160:166 | -- | 99.1 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | -- | -- | 0.3 | 322 |