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Table 1D: Sorted by Intron Position for 16S rRNA [Expanded View]

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EX	IP	# IIP	RC	# IRC	RISL	L	# PG	Phylogeny	Org [TaxID]	Acc	Structure	Comment
16S	TBD	15	I	3	219 - 220	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Cetraria ericetorum subsp. ericetorum [92079]	AF139033		IP 1516? (possibly 1521)
Cetraria ericetorum subsp. reticulata [92080]									AF139034		IP 1516? (possibly 1521)
Cetraria islandica [78064]									AF139035		IP 1516? (possibly 1521)
IC1			5	329 - 464	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Raffaelea tritirachium [45345]	U81484
								Graphiola phoenicis [5276]	AB000963
									AB000961
								Paecilomyces variotii [45996]	Z69593
								Exophiala prototropha [86340]	X91900		synonym Pullularia prototropha
IE			7	321 - 1423	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Graphiola phoenicis [5276]	AB000962
									D63930		IP possible 516
								Neonectria galligena [56674]	Y16422		synonym Nectria galligena
									Y16423		3' end uncertain; synonym Nectria galligena
									Y16424		synonym Nectria galligena
								Exophiala prototropha [86340]	X91899		synonym Pullularia prototropha
									X91901		synonym Pullularia prototropha
40	3	IC1	3	412 - 450	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Pseudodidymocystis planctonica [113526]	AB037087
								Dictyochloris fragrans [179863]	AF367860
								Dictyochloris pulchra [179864]	AF367862
114	14	I	14	188 - 274	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Lecanora dispersa [39935]	L37734	a.I1
								Rhizoplaca chrysoleuca [112062]	AY530888
								Phaeophyscia orbicularis [116805]	AJ549804
								Cetradonia linearis [83788]	AY648095
								Physcia caesia [116813]	AY648098
								Symbiotaphrina buchneri [40220]	DQ248313
								Stegobium paniceum yeast-like symbiont [48274]	D49657	a.I1
								Rhizoplaca huashanensis [239500]	AY530885
								Physcia aipolia [50936]	AY648097
									AY648096
								Physcia undulata [221732]	AJ549806
								Gymnoderma coccocarpum [206419]	AF523362
								Rinodina oxydata [205642]	AJ506971
								Buellia aethalea [205603]	AJ549801
156	8	IC1	8	378 - 433	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Chlorella sp. MBIC10744 [284943]	AB183634
								'Chlorella' saccharophila [3082]	AB058310	b.I1
								Chlorella trebouxioides [63676]	AB006048
								Amphikrikos cf. nanus Hegewald 1995-26 [120763]	AF228690		synonym Amphikrikos sp. Hegewald 1995-26
								Chlorella sp. MDL4-3 [226315]	AY197631
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Selenastrum capricornutum [118073]	AF169628
								Scenedesmus arcuatus var. platydiscus [119582]	AY170312
								Kirchneriella aperta [117505]	AJ271859
162	2	U	2	182 - 184	N	1	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon » ... »	uncultured archaeon [115547]	AB109884		Archaeal
									AB109879		Archaeal
170	1	IC1	1	355	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Selenastrum capricornutum [118073]	AF169628
263	1	U	1	31	N	1	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon SAGMA-B » ... »	uncultured archaeon SAGMA-B [140246]	AB050206		Archaeal
265	7	U	7	53 - 239	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Hyperphyscia adglutinata [116796]	AJ549803		spliceosomal
								Parmotrema tinctorum [235862]	AY584659		spliceosomal
								Hymenelia lacustris [196135]	AY640992		spliceosomal
								Arthrorhaphis citrinella [146290]	AF279375		spliceosomal
								Bacidia schweinitzii [161808]	DQ782884		spliceosomal
								Hymenelia epulotica [146300]	AF279393		spliceosomal
								Agonimia sp. AFTOL 684 [395001]	DQ782885		spliceosomal
287	14	I	14	191 - 261	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Lecanora dispersa [39935]	L37734	a.I1
								Phaeophyscia orbicularis [116805]	AJ549804
								Phaeophyscia hispidula [244694]	AY648103
								Rhizoplaca huashanensis [239500]	AY530885
								Rhizoplaca chrysoleuca [112062]	AY530888
								Diplotomma alboatrum [205613]	AJ549802
								Scoliciosporum umbrinum [93123]	AY641006
								Diplotomma epipolium [501307]	AJ506969
								Symbiotaphrina buchneri [40220]	DQ248313
								Stegobium paniceum yeast-like symbiont [48274]	D49657	a.I1
								Letharia columbiana [112416]	AF221063
								Rinodina gennarii [221737]	AJ549808
								Hyperphyscia adglutinata [116796]	AJ549803
								Bacidia schweinitzii [161808]	DQ782884
296	2	IC1	2	347	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	leotiomycete sp. G21-24-A204 [220857]	AY190275		tentative subclass assignment
								leotiomycete sp. G21-24-PU162 [220859]	AY190277		tentative subclass assignment
297	7	I	1	218	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Tryblidiopsis pinastri [66520]	DQ471035		unannotated
		U	6	54 - 57	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Calicium adspersum [57086]	AF242261		spliceosomal
								Physconia detersa [114785]	AJ240485		spliceosomal
								Physconia enteroxantha [114787]	AJ240486		spliceosomal
								Physconia distorta [114786]	AJ240484		spliceosomal
								Letrouitia domingensis [157776]	AY584672		spliceosomal
								Biatoridium monasteriense [286569]	AY640988		spliceosomal
298	4	I	1	615	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Ostropa barbara [271838]	AY584666
		U	3	54 - 56	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Physconia elegantula [114788]	AJ240487		spliceosomal
								Physconia perisidiosa [114789]	AJ240488		spliceosomal
								Teloschistes exilis [271840]	AY584671		spliceosomal
299	19	I	1	245	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Phaeophyscia orbicularis [116805]	AJ549804
		U	18	51 - 70	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Glomerobolus gelineus [75749]	DQ247811		spliceosomal
								Parmotrema tinctorum [235862]	AY584659		spliceosomal
								Rhynchostoma minutum [152654]	AF254663		spliceosomal
									AF242269		spliceosomal
								Lopezaria versicolor [271828]	AY584675		spliceosomal
								Physcia undulata [221732]	AJ549806		spliceosomal
								Psoroma hypnorum [191118]	AY424261		spliceosomal
								Bacidia schweinitzii [161808]	DQ782884		spliceosomal
								Roccella boergesenii [279123]	AY548807		spliceosomal
								Roccella canariensis [72318]	AF110344		spliceosomal
									AF110345		spliceosomal
									AF110343		spliceosomal
									AF110342		spliceosomal
								Roccella tuberculata [91947]	AF110348		spliceosomal
									AF110350		spliceosomal
									AF110347		spliceosomal
									AF110346		spliceosomal
									AF110351		spliceosomal
300	4	I	2	195 - 199	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Diplotomma epipolium [501307]	AJ506969
								Diplotomma alboatrum [205613]	AJ549802
		U	2	52 - 55	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Hyperphyscia adglutinata [116796]	AJ549803		spliceosomal
								Rhynchostoma minutum [152654]	AF242268		spliceosomal
322	1	U	1	72	N	1	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon SAGMA-17 » ... »	uncultured archaeon SAGMA-17 [140287]	AB050247		Archaeal
323	4	IC1	4	406 - 465	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Choricystis minor [41300]	AY762605
								Chlorella sorokiniana [3076]	X73993	a.I1
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Neodesmus danubialis [113524]	AB037086
								Scenedesmus pupukensis [42698]	X91267		was Kermatia pupukensis
330	31	U	31	51 - 106	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Letrouitia domingensis [157776]	AY584672		spliceosomal
								Petractis luetkemuelleri [185330]	AF465461		spliceosomal
								Glomerobolus gelineus [75749]	DQ247811		spliceosomal
								Berlesiella nigerrima [86046]	AY541478		spliceosomal
								Stachybotrys subsimplex [80384]	AY489679		spliceosomal
								Bacidia schweinitzii [161808]	DQ782884		spliceosomal
								Ochrolechia frigida [146302]	AF279402		spliceosomal
								Teloschistes exilis [271840]	AY584671		spliceosomal
								Physcia aipolia [50936]	U64686		spliceosomal
								Ochrolechia parella [129506]	AF274109		spliceosomal
								Cladonia portentosa [50943]	U64684		spliceosomal; synonym Cladina portentosa
								Ochrolechia juvenalis [286418]	AY640997		spliceosomal
								Rhamphoria delicatula [152657]	AF242267		spliceosomal
								Cladonia caroliniana [174049]	AY584664		spliceosomal
								Cladonia diversa [50926]	U64683		spliceosomal
								Cladonia bellidiflora [48919]	U64682		spliceosomal
								Stereocaulon tomentosum [50939]	U64688		spliceosomal
								Stereocaulon paschale [50940]	AF279412		spliceosomal
								Stereocaulon taeniarum [80760]	U64687		spliceosomal
								Roccella canariensis [72318]	AF110343		spliceosomal
									AF110342		spliceosomal
									AF110345		spliceosomal
									AF110344		spliceosomal
								Roccella tuberculata [91947]	AF110351		spliceosomal
									AF110347		spliceosomal
									AF110350		spliceosomal
									AF110346		spliceosomal
									AF110348		spliceosomal
								Roccella boergesenii [279123]	AY548807		spliceosomal
								Pertusaria trachythallina [50933]	U64685		spliceosomal
								Lecanora hybocarpa [394998]	DQ782883
331	9	U	9	52 - 62	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Physconia elegantula [114788]	AJ240489		spliceosomal
								Physconia perisidiosa [114789]	AJ240490		spliceosomal
								Physconia distorta [114786]	AJ240491		spliceosomal
								Physconia detersa [114785]	AJ240492		spliceosomal
								Hymenelia lacustris [196135]	AY640992		spliceosomal
								Phaeophyscia orbicularis [116805]	AJ549804		spliceosomal
								Natantispora lotica [168374]	AF352079		synonym Halosarpheia lotica; unannotated; spliceosomal
									AF352080		synonym Halosarpheia lotica; unannotated; spliceosomal
									AF352081		synonym Halosarpheia lotica; unannotated; spliceosomal
332	1	U	1	57	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Pyrenula cruenta [146309]	AF279406		spliceosomal
333	1	U	1	67	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Pertusaria amara [129507]	AF274104		spliceosomal
337	1	U	1	51	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Graphis scripta [71600]	AF038878		spliceosomal
357	2	U	2	87 - 88	N	1	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » environmental samples » ... »	uncultured stramenopile [152704]	AF372748		spliceosomal
									AF372749		spliceosomal
374	3	U	3	39 - 713	N	2	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon » ... »	uncultured archaeon [115547]	DQ490015		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Thermoproteales » ... »	Pyrobaculum aerophilum [13773]	AE009843		Archaeal
									L07510		Archaeal
390	5	U	5	50 - 144	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Dermatocarpon bachmannii [172322]	AF492354
								Dermatocarpon miniatum [172328]	AF412409
									AY584668		spliceosomal
								Staurothele frustulenta [396381]	DQ823105		spliceosomal
								Dermatocarpon americanum [146294]	AF279383		spliceosomal
392	1	I	1	276	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Calicium tricolor [39939]	L37733
393	19	U	19	50 - 199	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Physcia undulata [221732]	AJ549806		spliceosomal
								Glomerobolus gelineus [75749]	DQ247811		spliceosomal
								Rhynchostoma minutum [152654]	AF242268		spliceosomal
									AF242269		spliceosomal
									AF254663		spliceosomal
								Pyrenula cruenta [146309]	AF279406		spliceosomal
								Hymenelia epulotica [146300]	AF279393		spliceosomal
								Pyrenula pseudobufonia [271832]	AY641001		spliceosomal
								Biatoridium monasteriense [286569]	AY640988		spliceosomal
								Lobaria pulmonaria [86794]	AF183935		spliceosomal
								Teloschistes exilis [271840]	AY584671		spliceosomal
								Fuscidea lygaea [286414]	AY640990		spliceosomal
								Roccella fuciformis [269074]	AY584678		spliceosomal
								Roccella montagnei [91946]	AF110340		spliceosomal
									AF110341		spliceosomal
								Nephroma arcticum [48859]	AY424262		spliceosomal
								Roccella canariensis [72318]	AF110343		spliceosomal
									AF110342		spliceosomal
								Roccella tuberculata [91947]	AF110351		spliceosomal
395	1	U	1	57	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Brachyconidiella monilispora [243521]	AY342015		spliceosomal
400	1	U	1	76	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Halosarpheia fibrosa [45828]	AF352078		unannotated; spliceosomal
401	2	U	2	153	N	1	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » unclassified diatoms » ... »	Heterostegina depressa diatom endosymbiont [375031]	AM233869		spliceosomal
									AM233868		spliceosomal
497	10	I	10	183 - 291	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Lobaria pulmonaria [86794]	AF183935		in variable region near E. coli position 497
								Glomerobolus gelineus [75749]	DQ247811		intron in variable region ca. E. coli position 497
								Cetradonia linearis [83788]	AY648095
								Diplotomma alboatrum [205613]	AJ549802		intron in variable region ca E.coli position 497
								Parmotrema tinctorum [235862]	AY584659		intron in variable region ca. E. coli position 497
								Psoroma hypnorum [191118]	AY424261		intron in variable region ca E.coli position 497
								Gymnoderma coccocarpum [206419]	AF523362		intron in variable region ca. E. coli position 497
								Bacidia schweinitzii [161808]	DQ782884		intron in variable region ca. E. coli position 497
								Hymenelia epulotica [146300]	AF279393		in variable region near E. coli position 497
								Rinodina oxydata [205642]	AJ506971
508	3	IA3	3	612 - 1411	C	3	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Closteriopsis acicularis [82138]	Y17632		was Chlorella acicularis
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Ulvophyceae » ... »	Caulerpa sertularioides [76315]	AY389514
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Lobochlamys segnis [52035]	L39865		synonym Chlamydomonas pallidostigmatica
510	2	U	2	87 - 147	N	2	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » Bacillariophyceae » ... »	Amphora coffeaeformis [265554]	AY485498		spliceosomal
							cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » Fragilariophyceae » ... »	Nanofrustulum shiloi [210602]	AY485505		spliceosomal
514	1	U	1	77	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Porpidia crustulata [40597]	L37735		spliceosomal
516	272	I	35	NSEQ - 544	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Heterolobosea » Schizopyrenida » Vahlkampfiidae » ... »	Naegleria australiensis [51634]			LIT: Nuc. Acids Res. 22(22):4553-4559 (1994).
							cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Tryblidiopsis pinastri [66520]	DQ471035		unannotated
								Ostropa barbara [271838]	AY584666
								Hyperphyscia adglutinata [116796]	AJ549803
								Physcia aipolia [50936]	DQ782876
									AY648101
									AY648096
									AY648097
								Thelocarpella gordensis [286411]	AY641014
								Nephroma parile [203387]	AY584680
								Cetradonia linearis [83788]	AY648095
								Parmotrema tinctorum [235862]	AY584659
								Polysporina simplex [286400]	AY641000
								Lecanora dispersa [39935]	L37734	a.I1
								Acarospora complanata [168909]	AF356653
								Acarospora laqueata [286393]	AY640984
								Acarospora schleicheri [88748]	AY640986
								Acarospora hilaris [286392]	AY640983
								Physcia undulata [221732]	AJ549806
								Glypholecia scabra [286398]	AY640991
								Physcia stellaris [116821]	AY648102
								Physcia dimidiata [116814]	AJ506970
								Pyrenula pseudobufonia [271832]	AY641001
								Diplotomma epipolium [501307]	AJ506969
								Diplotomma alboatrum [205613]	AJ549802
								Physcia caesia [116813]	AY648098
									AY648100
								Scoliciosporum umbrinum [93123]	AY641006
								Rhizoplaca peltata [112045]	AY530887
								Acarospora clauzadeana [286396]	AY640987
								Bacidia schweinitzii [161808]	DQ782884
								Rinodina oxydata [205642]	AJ506971
								Gymnoderma coccocarpum [206419]	AF523362
								Rhizoplaca huashanensis [239500]	AY530885
								Exophiala dermatitidis [5970]	DQ823107
		IC1	123	334 - 1789	N	8	cellular organisms » Eukaryota » Rhodophyta » Bangiophyceae » Bangiales » ... »	Porphyra tenera [2785]	AB029882		P2 P2.1 missing some part
									AB100958
									AB100959
									AB101442
									AB029883		P2 P2.1 missing some part
									AB029884		P2 P2.1 missing some part
									AB000964
									D86237		intron not annotated
									D86236		intron not annotated
									AB029880
									AB029879
									AB013175
									AB013176
									AB029881
								Bangia fuscopurpurea [101920]	AF172557	b.I1	Australia/AU; exon sequence from AF175531
									AF172556		France: Nice; exon sequence from AF175535
									AF172555		New Jersey/NJ; exon sequence from AF169335
									AF172558		Greece/GR; exon sequence from AF175533
									AF172559		North Carolina/NC; exon sequence from AF043363
									AF172570		Newfoundland/NF; exon sequence from AF043357
									AF172569		Ireland/IR; exon sequence from AF175534
									AB053488
									AB053489
									AF172571		Nova Scotia/NS; exon sequence from AF169337
									AF172572	b.I1	Oregon/OR; exon sequence from AF043358
									AF172567		Victoria/BC2; exon sequence from AF043359
									AF172568		California/CA; exon sequence from AF043356
									AF342745	b.I1
									AF172560		Germany: Helgoland/HL; exon sequence from AF175532
AF172561									Massachusetts/MA; exon sequence from AF043362
Porphyra suborbiculata [76158]	AB015796
	AF378649								synonym Porphyra lilliputiana
	AF378654								synonym Porphyra carolinensis
	AF378653								synonym Porphyra carolinensis
	AF378658								synonym Porphyra lilliputiana
	AF378662								synonym Porphyra lilliputiana
	AF378659								synonym Porphyra lilliputiana
	AF378660								synonym Porphyra lilliputiana
	AF378661								synonym Porphyra lilliputiana
	AF136424								synonym Porphyra lilliputiana
	AF133792								synonym Porphyra carolinensis
	AF378656
	AF378663								synonym Porphyra lilliputiana
	AF378657
	AF378664								synonym Porphyra lilliputiana
	AF378665								synonym Porphyra lilliputiana
	AF378655
	AF378650								synonym Porphyra lilliputiana
	AF378651								synonym Porphyra lilliputiana
	AB013180
	AF378652
Porphyra sp. Baleia [298901]	AY766358
Bangia sp. strain BGA458 [224387]	AY184341
Bangia sp. [76713]	AF172578							b.I1	Virgin Islands/VIS7; exon sequence from AF043364
Bangia atropurpurea [31347]	D88387							b.I1
	AF172565								England River Thames/BI12; exon sequence from AF043365
	AB053491
	AF172562								Netherlands/NL: Ysselmeer; exon sequence from AF169341
	AF172563								Ireland/IR; exon sequence from AF043365
	AF172566								Great Lakes/GL; exon sequence from AF043365
	AF172564								Italy/IT; exon sequence from AF043365
Porphyra yezoensis [2788]	AY131005
	D79976							a.I1
	AB013178
	AB013177
Bangia sp. strain BNS727 [224391]	AY184345
Porphyra umbilicalis [2786]	AF172573		New Jersey/NJ; exon from AF175553
Porphyra purpurea [2787]	AF172575		exon sequence from AF175551
Porphyra sp. Wales SW1 [144555]	AF172574		exon from AF175554
Porphyra rakiura [199481]	AF136425
	AY139682
	AY139684
Porphyra onoi [78445]	AB015794
Bangia sp. strain BDS725 [224384]	AY184337
Porphyra torta [139733]	AF172579		exon sequence from AF175552
Porphyra sp. strain GRB488 [224396]	AY184350
Bangia sp. strain BWP662 [224394]	AY184348
Porphyra sp. [2790]	AF136420
	AB013182
Porphyra leucosticta [35146]	AF172576		exon sequence from AF175557
	AF342746	b.I1
Porphyra sp. strain GRB145 [224395]	AY184349
Porphyra haitanensis [76159]	AB015795
Porphyra pseudolinearis [81939]	AB013185
Porphyra lucasii [209571]	AY139685		synonym: Porphyra sp. WELT A23051
Porphyra katadae [76161]	AB013184
Porphyra nereocystis [139730]	AF172577		exon sequence from AF175542
Porphyra dentata [76160]	AB013183
Porphyra cinnamomea [199484]	AF136418 AF136419
Porphyra capensis [298899]	AY766361
Porphyra kanakaensis [139729]	AF172580		exon sequence from AF175556
Porphyra tenuipedalis [78446]	AB015797
cellular organisms » Eukaryota » Heterolobosea » Schizopyrenida » Vahlkampfiidae » ... »	Naegleria sp. [37103]	X79071
		X79070
		X79069
		AJ001399
		Y10190
	Naegleria andersoni [5764]	Z16417
				LIT: J. Eukaryot. Microbiol. 40(2):179-187 (1993).
		X78280
	Naegleria clarki [36333]	AF338420
		AF338422
		X78281
		AF338419
		AF338418
		AF338417
	Naegleria jamiesoni [36335]	X78279
	Naegleria gruberi [5762]	X78278
	Naegleria italica [36334]	X78277
cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Pelagophyceae » Aureoumbra » ... »	Aureoumbra lagunensis [44058]	U40258	b.I1	annotated as insertion
cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Mycetozoa » Myxogastria » ... »	Badhamia gracilis [227449]	AJ555451
	Physarum flavicomum [35220]	AJ555453 AJ555454
	Fuligo septica [159720]	AJ555452
		AJ584697
cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Chytridiomycota » ... »	Spizellomyces punctatus [109760]	AY546684
cellular organisms » Eukaryota » Euglenozoa » Euglenida » Heteronematales » ... »	Ploeotia costata [211463]	AF525486
cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Centramoebida » Acanthamoebidae » ... »	Acanthamoeba griffini [29195]	S81337	b.I1
		U02540 U07412	b.I1
	Acanthamoeba sp. KA/E4 [156883]	AF349045
	Acanthamoeba sp. KA/MSS6 [215575]	AY173014
	Acanthamoeba sp. KA/MSS7 [215576]	AY173015
	Acanthamoeba sp. KA/MSS2 [215574]	AY173013
cellular organisms » Eukaryota » Rhodophyta » Rhodellophyceae » Rhodellales » ... »	Rhodella sp. MBIC10593 [284791]	AB183619
IE	109	190 - 622	N	5	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Coelastrella multistriata [75801]	AB012846		missing 3' end of intron -- only 50% complete
						Coelastrum pseudomicroporum [183313]	AF388381
						Pseudomuriella aurantiaca [42696]	X91268		misspelling Muriella aurantica
							AB005748		misspelling Muriella aurantica
						Hariotina reticulata [183314]	AF388382		synonym Coelastrum reticulatum
						Pseudodidymocystis planctonica [113526]	AB037087
						Bracteacoccus sp. BC2-1 [209073]	AF516676
						Radiococcus polycoccus [170400]	AY044650		synonym Coenochloris polycocca
							AY044649		synonym Coenochloris polycocca
						Tetraedron minimum [302393]	AY663042
						Monoraphidium contortum [307511]	AY846375
						Quadrigula closterioides [82291]	Y17924
						Kirchneriella aperta [117505]	AJ271859
						Monoraphidium terrestre [82352]	Y17817
						Podohedriella falcata [52960]	X97352		synonym Ankistrodesmus falcatus
						Botryococcus sp. UTEX 2629 [244724]	AJ581914
						Scenedesmus sp. CCMP 1625 [155396]	AF339735
						Coelastrella multistriata var. corcontica [113518]	AB037082
						Mychonastes sp. 5C5 [178348]	AF357153
					cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Coenogonium luteum [146297]	AF279386		synonym Dimerella lutea
						Mycoarachis inversa [29864]	AB013735		str. ATCC 22107
							AB012953		str. IAM 14639
						Rhizoscyphus ericae [5183]	AF462168		synonym Hymenoscyphus ericae
							AY762620
						Capronia pilosella [45095]	AY316152
						Psoroma hypnorum [191118]	AY424261		misannotated
						Delitschia didyma [152651]	AF242264
						Bulbithecium hyalosporum [95318]	AF096172
						Daldinia sp. F16 [246476]	AY315425
						Massalongia carnosa [161978]	AY424265		misannotated
						Hirsutella rhossiliensis [111463]	AB109760
						Tilletiopsis flava [58914]	D82819
							AB045703
						Xylaria sp. F23 [246502]	AY315427
						Nephroma arcticum [48859]	AY424262		misannotated
						leotiomycete sp. G21-24-A201 [220856]	AY190274
						Entyloma calendulae [84748]	DQ663688
						leotiomycete sp. G21-24-A14 [220855]	AY190279
						leotiomycete sp. G21-24-A204 [220857]	AY190275
						leotiomycete sp. G21-24-KI129 [220858]	AY190276
						leotiomycete sp. G21-24-PU162 [220859]	AY190277
						leotiomycete sp. G21-24-RU19 [220860]	AY190278
						Cordyceps sp. 97003 [94217]	AB027329
						Entyloma holwayi [63376]	DQ234562
						Acrospermum compressum [152639]	AF242257
						Rhexocercosporidium sp. DSE48.1b [301706]	AJ864396
						Leptodontidium quercuum [75376]	AF056375
						Lobaria pulmonaria [86794]	AF183935
						Peltula umbilicata [169193]	AF356688		unannotated
							DQ782887		misannotated
						Caliciopsis pinea [152644]	AF242260
						Hymenelia epulotica [146300]	AF279393
						Sagenomella diversispora [89792]	AB024589
							AB024588
						Geosmithia viridis [106120]	AB033527
						Roccella canariensis [72318]	AF110344
							AF110345
							AF110342
							AF110343
						Roccella tuberculata [91947]	AF110350
							AF110351
						Roccella boergesenii [279123]	AY548807
						Exobasidium gracile [190086]	DQ785786
						Cordyceps prolifica [94209]	AB027324
Cordyceps ramosopulvinata [94211]	AB027326
Barrmaelia oxyacanthae [101485]	AF064048
Cordyceps kanzashiana [94210]	AB027325
Arthonia dispersa [242232]	AY571379
Byssochlamys zollerniae [89138]	AY526485
Colacogloea peniophorae [5233]	DQ234564
Mycocalicium albonigrum [39942]	L37736
Geoglossum nigritum [107442]	AY544694
Penicillium oblatum [106126]	AB033529
Cintractia axicola [63370]	DQ631907
Sakaguchia dacryoidea [106023]	D13459		was Rhodosporidium dacryoidum
Penicillium argillaceum [103783]	AB033533
	AB033532
	AB033531
Ustilentyloma fluitans [63397]	AY124481
Trichocoma paradoxa [76771]	AB003943
	AB003944
Xylariales sp. F15 [246511]	AY315424
Pannaria conoplea [191109]	AY424260
Xylariales sp. F17 [246512]	AY315426
Lecanactis abietina [40113]	AY548805
Exophiala dermatitidis [5970]	Z75303
Roccella fimbriata [91945]	AF110339
cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Trebouxia arboricola [53268]	Z68705
	Chlorella sp. 2A3 [178344]	AF357146
	'Chlorella' luteoviridis [31301]	X73998		synonym Chlorella luteoviridis
		X73997		synonym Chlorella luteoviridis
	Actinastrum hantzschii [55402]	AF288365
	Koliella spiculiformis [154509]	AF278744
	'Chlorella' saccharophila [3082]	X73991		synonym Chlorella saccharophila
		AB058310
	Chlorella sp. BC4-VF9 [209072]	AF516675
	Chlorella pyrenoidosa [3078]	AB240151
	Chlorella sp. MBIC10744 [284943]	AB183634
	Stichococcus sp. MBIC10457 [284983]	AB183599
	Coccomyxa pringsheimii [312852]	AY762603
	Neochloris aquatica [3099]	UNP00779		Louise Lewis. J.Phycol. 28:375 (1992).
	Amphikrikos cf. nanus Hegewald 1995-26 [120763]	AF228690		synonym Amphikrikos sp. Hegewald 1995-26
	Stichococcus bacillaris [37433]	AB055864
	Trebouxia usneae [53266]	Z68702
cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Streptophyta » Klebsormidiophyceae » ... »	Klebsormidium subtilissimum [184584]	AF408241		misannotated
	Klebsormidium flaccidum [3175]	X75520
	Klebsormidium nitens [105231]	AJ250112
		AF408242		misannotated
cellular organisms » Eukaryota » Rhizaria » Cercozoa » Plasmodiophorida » ... »	Plasmodiophora brassicae [37360]	U18981
U	5	NSEQ - 401	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sarcinomyces phaeomuriformis [66227]	X80710		LIT: Antonie Van Leeuwenhoek 68(1):19-33 (1995).
						Geosmithia argillacea [69808]	AB032112 AB032113
							AB032108 AB032109
							AB032116 AB032117
						Penicillium sabulosum [106127]	AB033530
529	1	I	1	423	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Heterolobosea » Acrasida » Acrasis » ... »	Acrasis rosea [43695]	AF011458
531	1	IA3	1	402	C	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Chlamydomonas moewusii [3054]	X15850
532	1	U	1	81	N	1	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon SAGMA-B » ... »	uncultured archaeon SAGMA-B [140246]	AB050206		Archaeal
548	1	U	1	627	N	1	cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Thermoproteales » ... »	Thermoproteus sp. IC-033 [70772]	AB009616		Archaeal
568	1	IE	1	231	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Scotiellopsis oocystiformis [75804]	AB012848		missing P8' to 3' end of int.
569	2	IC2	2	1323 - 1337	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Cordyceps sp. 97003 [94217]	AB027352
								Cordyceps kanzashiana [94210]	AB027347
570	1	IC2	1	1380	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sclerotinia sclerotiorum [5180]	U07553	a.I1
651	7	IC1	3	408 - 460	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Amphikrikos cf. nanus Hegewald 1995-26 [120763]	AF228690		intron in variable region near E. coli position 651; synonym Amphikrikos sp. Hegewald 1995-26
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Coelastrum pseudomicroporum [183313]	AF388381		intron in variable region near E. coli position 651
								Raphidocelis subcapitata [307507]	AY846381		intron in variable region near E. coli position 651
		IE	3	323 - 331	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	uncultured Chlorella [254346]	AB206547		intron in variable region near E. coli position 651
									AB206548		intron in variable region near E. coli position 651
								Chlorella sp. AN 1-3 [221618]	AY195964		intron in variable region near E. coli position 651
		U	1	106	N	1	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » unclassified diatoms » ... »	Heterostegina depressa diatom endosymbiont [375031]	AM233870		spliceosomal; in variable region ca. E. coli position 651
674	6	U	6	50 - 75	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Physconia detersa [114785]	AJ240495		spliceosomal
								Physconia distorta [114786]	AJ240494		spliceosomal
								Physconia kurokawae [114790]	AJ240496		spliceosomal
								Physcia undulata [221732]	AJ549806		spliceosomal
								Megalospora tuberculosa [271826]	AY584674		spliceosomal
								Mycoblastus sanguinarius [312200]	DQ782879		spliceosomal
675	1	U	1	52	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Teloschistes exilis [271840]	AY584671		spliceosomal
687	1	U	1	273	N	1	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon » ... »	uncultured archaeon [115547]	DQ490015		Archaeal
742	3	U	3	101 - 151	N	2	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » unclassified diatoms » ... »	Heterostegina depressa diatom endosymbiont [375031]	AM233870		spliceosomal
							cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » Coscinodiscophyceae » ... »	Cymatosira belgica [49246]	X85387		spliceosomal
								Extubocellulus spinifer [265572]	AY485504		spliceosomal
781	4	U	4	97 - 764	N	3	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon pHGPA13 » ... »	uncultured archaeon pHGPA13 [95173]	AB027540		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Thermoproteales » ... »	Thermoproteus sp. IC-033 [70772]	AB009616		Archaeal
								Thermoproteus sp. IC-061 [70773]	AB009617		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon pHGPA1 » ... »	uncultured archaeon pHGPA1 [95944]	AB027539		Archaeal
788	90	I	63	190 - 543	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Amandinea punctata [116786]	AJ549800
								Buellia aethalea [205603]	AJ549801
								Alatospora acuminata [222513]	AY357261
								Xanthoria elegans [88742]	AY641017
								Rhizoplaca chrysoleuca [112062]	AY530888
								Phaeophyscia hispidula [244694]	AY648103
								Coenogonium luteum [146297]	AF279386		synonym Dimerella lutea
								Diplotomma alboatrum [205613]	AJ549802
								Diplotomma epipolium [501307]	AJ506969
								Physcia stellaris [116821]	AY648102
								Physcia aipolia [50936]	AY648101
									AY648097
									AY648096
									AY648099
									DQ782876
								Physcia caesia [116813]	AY648100
									AY648098
								Tryblidiopsis pinastri [66520]	DQ471035		unannotated
								Phaeophyscia orbicularis [116805]	AJ549805
								Physcia dimidiata [116814]	AJ506970
								Physcia undulata [221732]	AJ549806
								Tornabea scutellifera [205647]	AJ549810
								Protoblastenia rupestris [258902]	AY548820
								Cladonia gracilis [111668]	AY575023
									AY575022
									AY575025
									AY575024
								Staurothele frustulenta [396381]	DQ823105
								Dermatocarpon miniatum [172328]	AF412409
									AY584668
								Acarospora macrospora subsp. macrospora [286395]	AY640985
								Pyrenula pseudobufonia [271832]	AY641001
								Polysporina simplex [286400]	AY641000
								Cladonia rangiferina [111670]	AY575026
									AY575027
								Acarospora cf. dissipata [168908]	AF356655
								Acarospora complanata [168909]	AF356653
								Acarospora canadensis [286390]	AY640981
								Gymnoderma coccocarpum [206419]	AF523362
								Acarospora hilaris [286392]	AY640983
								Echinoplaca strigulacea [394997]	DQ782878
								Petractis clausa [168918]	AF356661
								Strangospora pinicola [286408]	AY641011
									AY641010
								Rhynchostoma proteae [225611]	AY230152
								Flavoparmelia caperata [172615]	AY584663
								Rhynchostoma minutum [152654]	AF242268
									AF242269
									AF254663
									AF242270
								Dermatocarpon americanum [146294]	AF279383
								Pleopsidium chlorophanum [247144]	AY316151
								Thelocarpella gordensis [286411]	AY641014
								Pyrenula cruenta [146309]	AF279406
								Simonyella variegata [92844]	AY584669
								Baeomyces placophyllus [106415]	AF356657
								Protoblastenia calva [258893]	AY548821
									AY548822
								Acarospora cervina [286391]	AY640982
								Acarospora clauzadeana [286396]	AY640987
								Glypholecia scabra [286398]	AY640991
								Endocarpon pallidulum [396380]	DQ823104
							cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » environmental samples » ... »	uncultured fungus [175245]	AY168895
		IC1	22	282 - 551	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Phialocephala sphaeroides [271845]	AY524844
Myriosclerotinia curreyana [87228]	AJ226071
	AJ226070
Hyphodiscus hymeniophilus [353542]	DQ227258
Myriosclerotinia dennisii [38444]	AJ226072								strain: 453.2
Myriosclerotinia scirpicola [38443]	AJ226074
	AJ226075
	AJ226076
	AJ226073
Barrmaelia oxyacanthae [101485]	AF064048
Muscodor sp. A10-1 [172111]	AY049023
Geosmithia viridis [106120]	AB033527
Penicillium sabulosum [106127]	AB033530
Delitschia didyma [152651]	AF242264
Penicillium radicum [228353]	AY256855
Penicillium oblatum [106126]	AB033529
Ascolacicola austriaca [152650]	AF242263
Myriosclerotinia caricis-ampullaceae [87227]	AJ226069
Ceramothyrium carniolicum [134355]	AF346418
Rhizoscyphus ericae [5183]	AY762621
cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » environmental samples » ... »	uncultured fungus [175245]						AY168914
							AY168915
IIB	4	868 - 2182	M	2	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Lentaria byssiseda [104232]	AF185983
						Ganoderma lucidum [5315]	AF214475
						Cryphonectria parasitica [5116]	AF029891
					cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi/Metazoa incertae sedis » Ichthyosporea » ... »	Amoebidium parasiticum [4881]	AF538044
U	1	221	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sporobolomyces dimmenae [69977]	D66881
789	1	I	1	182	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Lecanora dispersa [39935]	L37734	a.I1
791	2	U	2	62 - 66	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Berlesiella nigerrima [86046]	AY541478		spliceosomal
								Melanopsamma pomiformis [80381]	AY489677		spliceosomal
793	9	IA3	9	228 - 1289	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Streptophyta » Streptophytina » ... »	Isoetes histrix [50297]	AF058669
								Takakia lepidozioides [37425]	AF058672
								Polytrichum commune [3213]	AF244564
								Chara sp. Qiu 96222 [81819]	AF191800		incorrect annotation
								Chara vulgaris [55564]	AY267353
								Sphagnum palustre [13805]	AF058671
					C	2	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Ulvophyceae » ... »	Caulerpa sertularioides [76315]	AY389514
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Stigeoclonium helveticum [55999]	DQ630521
								Lobochlamys segnis [52035]	L39865		synonym Chlamydomonas pallidostigmatica
801	1	U	1	123	N	1	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon » ... »	uncultured archaeon [115547]	DQ490015		Archaeal
813	2	U	2	98 - 105	N	1	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » unclassified diatoms » ... »	Heterostegina depressa diatom endosymbiont [375031]	AM233870		spliceosomal
									AM233871		spliceosomal
879	1	U	1	212	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sporobolomyces dimmenae [69977]	D66881
882	1	U	1	53	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Coenogonium luteum [146297]	AF279386		spliceosomal; synonym Dimerella lutea
883	8	U	8	49 - 59	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Diploschistes scruposus [146298]	AF279388		spliceosomal
								Physconia distorta [114786]	AJ240497		spliceosomal
								Lopezaria versicolor [271828]	AY584675		spliceosomal
								Letrouitia domingensis [157776]	AY584672		spliceosomal
								Physconia detersa [114785]	AJ240498		spliceosomal
								Physconia venusta [114784]	AJ240500		spliceosomal
								Physcia undulata [221732]	AJ549806		spliceosomal
								Physconia kurokawae [114790]	AJ240499		spliceosomal
884	1	U	1	55	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Capronia pilosella [45095]	DQ823106		spliceosomal
891	6	I	1	348	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Heterolobosea » Acrasida » Acrasis » ... »	Acrasis rosea [43695]	AF011458
		IC1	5	387 - 396	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Alveolata » Ciliophora » Intramacronucleata » ... »	Tokophrya lemnarum [168139]	AY332721
									AY332720
								Acineta sp. OSW-2003-1 [239361]	AY332717
								Acineta sp. OSW-2003-2 [239362]	AY332718
								Acineta sp. OSW-2003-3 [239363]	AY332719
894	4	U	4	92 - 158	N	1	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » unclassified diatoms » ... »	Heterostegina depressa diatom endosymbiont [375031]	AM233868		spliceosomal
									AM233870		spliceosomal
									AM233869		spliceosomal
									AM233871		spliceosomal
896	2	I	1	229	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Glomerobolus gelineus [75749]	DQ247811
		U	1	269	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sporobolomyces dimmenae [69977]	D66881
898	1	IC1	1	330	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Naohidea sebacea [112072]	AY123302
901	2	U	2	37 - 654	N	2	cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Thermoproteales » ... »	Caldivirga maquilingensis [76887]	AB013926		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon pHGPA13 » ... »	uncultured archaeon pHGPA13 [95173]	AB027540		Archaeal
908	13	U	13	24 - 699	N	4	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon SAGMA-B » ... »	uncultured archaeon SAGMA-B [140246]	AB050206		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Desulfurococcales » ... »	Aeropyrum pernix [56636]	AB078021		Archaeal
									AB078022		Archaeal
									AB019553		Archaeal; strain:TB1
									AB078017		Archaeal
									AB078020		Archaeal
									AB078018		Archaeal
									AB019554		Archaeal; strain:TB7
									AB078019		Archaeal
									AP000062		Archaeal; replaces AB008745; strain:K1
								Aeropyrum camini [229980]	AB109559		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Thermoproteales » ... »	Caldivirga maquilingensis [76887]	AB013926		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon pHGPA13 » ... »	uncultured archaeon pHGPA13 [95173]	AB027540		Archaeal
911	2	I	1	457	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Mycetozoa » Myxogastria » ... »	Fuligo septica [159720]	AJ584697
		IIA	1	1607	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Streptophyta » Streptophytina » ... »	Marchantia polymorpha [3197]	M68929	a.I2
915	1	U	1	2413	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Cryphonectria parasitica [5116]	AF029891
932	1	U	1	189	N	1	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon » ... »	uncultured archaeon [115547]	AB109878		Archaeal
934	8	I	8	196 - 382	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » environmental samples » ... »	uncultured fungus [175245]	AY168894
							cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Biatoridium monasteriense [286569]	AY640988
								Acarospora canadensis [286390]	AY640981
								Acarospora cf. dissipata [168908]	AF356655
								Polysporina simplex [286400]	AY641000
								Acarospora hilaris [286392]	AY640983
								Sarcogyne regularis var. regularis [286403]	AY641003
								Acarospora macrospora subsp. macrospora [286395]	AY640985
935	2	I	2	249	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Strangospora pinicola [286408]	AY641010
									AY641011
939	16	U	16	49 - 244	N	5	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Coenogonium luteum [146297]	AF279386		spliceosomal; synonym Dimerella lutea
								Physconia elegantula [114788]	AJ240501		spliceosomal
								Physconia kurokawae [114790]	AJ240505		spliceosomal
								Brachyconidiella monilispora [243521]	AY342015		spliceosomal
								Physconia distorta [114786]	AJ240502		spliceosomal
								Physconia grisea [114791]	AJ240503		spliceosomal
								Physconia venusta [114784]	AJ240506		spliceosomal
								Physcia undulata [221732]	AJ549806		spliceosomal
								Physconia detersa [114785]	AJ240504		spliceosomal
							cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » Bacillariophyceae » ... »	Amphora coffeaeformis [265554]	AY485498		spliceosomal
								Amphiprora paludosa [265537]	AY485468		spliceosomal
							cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » unclassified diatoms » ... »	Heterostegina depressa diatom endosymbiont [375031]	AM233870		spliceosomal
							cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » environmental samples » ... »	uncultured stramenopile [152704]	AY179992		spliceosomal
									AY179991		spliceosomal
							cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » Coscinodiscophyceae » ... »	Cymatosira belgica [49246]	X85387		spliceosomal
								Extubocellulus spinifer [265572]	AY485504		spliceosomal
940	28	I	28	209 - 473	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Umbilicaria yunnana [284238]	AY648118
								Rhizoplaca chrysoleuca [112062]	AY530882
									AY530888
									AY530880
									AY530879
									AY530881
								Diplotomma alboatrum [205613]	AJ549802
								Diplotomma epipolium [501307]	AJ506969
								Cetraria islandica [78064]			LIT: Curr. Genet. 35(5):536-541 (1999).
								Hypogymnia physodes [87259]			LIT: Curr. Genet. 35(5):536-541 (1999).
								Rinodina oxydata [205642]	AJ506971
								Cladonia gracilis [111668]	AY575029
									AY575028
									AY575030
									AY575031
								Hyperphyscia adglutinata [116796]	AJ549803
								Lecanora allophana [108934]			LIT: Curr. Genet. 35(5):536-541 (1999).
								Vulpicida juniperina [87264]			LIT: Curr. Genet. 35(5):536-541 (1999).
								Usnea filipendula [192176]			LIT: Curr. Genet. 35(5):536-541 (1999).
								Usnea rigida [192178]			LIT: Curr. Genet. 35(5):536-541 (1999).
								Usnea subfloridana [143891]			LIT: Curr. Genet. 35(5):536-541 (1999).
								Parmelia saxatilis [87261]			LIT: Curr. Genet. 35(5):536-541 (1999).
								Usnea hirta [192177]			LIT: Curr. Genet. 35(5):536-541 (1999).
								Cladonia rangiferina [111670]	AY575034
									AY575033
									AY575032
								Mycoblastus sanguinarius [312200]	DQ782879
								Rhizoplaca peltata [112045]	AY530887
943	335	I	28	NSEQ - 684	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Spathularia flavida [33158]			LIT: Mol. Biol. Evol. 12(2):208-218.
								Acarospora hilaris [286392]	AY640983
								Acarospora complanata [168909]	AF356653
								Dermatocarpon miniatum [172328]	AY584668
								Acarospora laqueata [286393]	AY640984
								Ostropa barbara [271838]	AY584666
								Rinodina gennarii [221737]	AJ549808
								Phaeophyscia orbicularis [116805]	AJ549805
								Physcia caesia [116813]	AY648100
								Endocarpon pallidulum [396380]	DQ823104
								Teloschistes exilis [271840]	AY584671
								Caloplaca xanthostigmoidea [216830]	AJ535286
								Echinoplaca strigulacea [394997]	DQ782878
								Flavoparmelia caperata [172615]	AY584663
								Acarospora bullata [286389]	AY640980
								Acarospora macrospora subsp. macrospora [286395]	AY640985
								Parmotrema tinctorum [235862]	AY584659
								Polysporina simplex [286400]	AY641000
								Acarospora cervina [286391]	AY640982
								Fulgensia bracteata [157765]	AJ535288
								Staurothele frustulenta [396381]	DQ823105
								Acarospora clauzadeana [286396]	AY640987
								Physcia aipolia [50936]	AY648097
									AY648096
									AY648101
								Glypholecia scabra [286398]	AY640991
								Agonimia sp. AFTOL 684 [395001]	DQ782885
								Tornabea scutellifera [205647]	AJ549810
		IC1	301	231 - 1866	N	12	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Coccomyces dentatus [265080]	AY544701
								Rhexocercosporidium sp. DSE48.1b [301706]	AJ864396
								Phialocephala fortinii [62722]	AY524846
								Phialocephala sphaeroides [271845]	AY524844
								Lachnum sclerotii [47825]	AY120860
								Sclerotinia trifoliorum [28548]	AY187069
									AY187072
									AY187075
									AY187077
								Sporobolomyces magnisporus [234794]	AB112078		misannotated as two introns
								Pseudocyphellaria crocata [161975]	AY424253		misannotated as two introns
								Sporobolomyces sasicola [5444]	AB021688
								leotiomycete sp. G21-24-A201 [220856]	AY190274
								Sporobolomyces diospyroris [251414]	AB126047
								leotiomycete sp. G21-24-KI129 [220858]	AY190276
								leotiomycete sp. G21-24-A204 [220857]	AY190275
								leotiomycete sp. G21-24-RU19 [220860]	AY190278
								Bourdotia sp. GEL5065 [282314]	DQ234544		missing 3' end of intron
								leotiomycete sp. G21-24-A14 [220855]	AY190279
								Sporobolomyces ruber [4986]	AB021686
								Neocudoniella radicella [271844]	AY524843
								Lachnum hyalopus [199676]	AY120858
								Bensingtonia ciliata [4989]	D38233	a.I1
								Protomyces inouyei [27332]	AY548295
									D11377	a.I1
								Protomyces macrosporus [48147]	D85143	a.I1
								Chlorociboria aeruginosa [54693]	AF292087
								Connersia rilstonii [95320]	AF096174
								Protomyces pachydermus [48148]	D85142	a.I1
								Entyloma calendulae [84748]	DQ663688		missing 3' end of intron
								Natantispora retorquens [85911]	AF352087		unannotated; sequence is missing 5' end; synonym Halosarpheia retorquens
								Xanthoria andina [216827]	AJ535290
								Xylaria polymorpha [77046]	AB014043
								Xylariaceae sp. F9 [246510]	AY315419
								Entyloma holwayi [63376]	DQ234562
								Exobasidium gracile [190086]	DQ785786
Geosmithia viridis [106120]	AB033527
Melanopsamma pomiformis [80381]	AY489677
Graphium penicillioides [67620]	AB007681
Peltula umbilicata [169193]	DQ782887
Phaeosphaeria avenaria [55068]	AY544725
Cordyceps bassiana [176275]	AF398397								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF464939								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF398400								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF398398								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF479737								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AB079609								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF398396								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF398399								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AB079125								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF464942								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF280633								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF464941								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF464940								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF479738								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF398395								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AF479736								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AB237657
	AB079608								GenBank anamorph Beauveria bassiana
Byssochlamys zollerniae [89138]	AY526485
	AB023940
Penicillium sabulosum [106127]	AB033530
Bionectria ochroleuca [29856]	AB012952								synonym Nectria ochroleuca
	AB013010								synonyms Nectria aureofulva, Bionectria aureofulva
	AB003950 AB013739		synonym Nectria ochroleuca
leotiomycete sp. G2-5 R322 [248020]	AY382647
Mycoarachis inversa [29864]	AB012953		str. IAM 14639
	AB013736		str. ATCC 22107
Exobasidium rhododendri [63378]	DQ667152
Kirschsteiniothelia aethiops [147564]	AY016344
Coniochaeta malacotricha [177198]	AJ496243
Paecilomyces variotii [45996]	AB023946
Paecilomyces pascua [106128]	AB033528
Penicillium oblatum [106126]	AB033529
Cintractia sorghi-vulgaris [293803]	DQ234548
Byssochlamys fulva [89137]	AB023941
	AY526482
Graphium basitruncatum [118975]	AB038421
Penicilliopsis clavariiformis [70111]	AB003945	a.I1
Sagenomella griseoviridis [89793]	AB024590
Delitschia didyma [152651]	AF242264
Halosarpheia marina [173433]	AF352082		unannotated
Penicillium argillaceum [103783]	AB033532
	AB033531
	AB033533
Panellus stypticus [5636]	U59090
Halosarpheia fibrosa [45828]	AF352078		unannotated; sequence is missing 5' end
Pleurostoma ootheca [308474]	AY761074
Arthrobotrys cylindrospora [47240]	AF106538		synonym Dactylella cylindrospora
Paecilomyces cicadae [181121]	AB086631
	AB085888
	AB085887
	AB085886
	AB086630
Cordyceps pruinosa [129524]	AB044629
Bensingtonia thailandica [119489]	AB040115
	AB040116
	AB040117
	AB040114
Cordyceps militaris [73501]	AB070373
	AF327392
	AB027333
	AB084156
	AB070375
	AB070374
	AB255603		unannotated
	AB233336
Coniochaeta ligniaria [177197]	AY198389
	AJ496242
Nigrosabulum globosum [95328]	AF096180
Graphium putredinis [67633]	AB007683
Pseudallescheria boydii [5597]	U43914
	U43915
Graphium eumorphum [67635]	AB007684
Isaria japonica [72233]	AB016607
Gibellula formosana [219212]	AB100360
Simocybe serrulata [110245]	DQ465343
Mycena aff. pura PBM 2665 [378278]	DQ457646
Cordyceps sp. 97005 [130799]	AB044630
Hyphodiscus hymeniophilus [353542]	DQ227258
Schizophyllum sp. MI 01 [365517]	AB245444
Schizophyllum sp. MI 15 [365518]	AB245445
Rosellinia necatrix [77044]	AB014044
Galerina atkinsoniana [157598]	DQ440634
Tubaria sp. E8069 [341725]	DQ462517
Cordyceps tuberculata [72229]	AF327401
Torrubiella flava [219582]	AB100609
Phaeocollybia festiva [260914]	DQ462516
Cordyceps cardinalis [224370]	AB237660		unannotated
Cordyceps sp. 97009 [94216]	AB027332
Geomyces pannorum var. pannorum [79859]	AB015785
Lentinellus flabelliformis [233006]	AY298782
Lentinellus montanus [5355]	U59077
	U59076
	AY298778
Neofabraea malicorticis [108569]	AY544706
Mycena plumbea [378280]	DQ457697
Dactylella oviparasitica [219654]	AY185772
uncultured rhizosphere basidiomycete [204868]	AY099406
	AY099407
	AY099408
	AY773741
Pyxidiophora arvernensis [45041]	U43339
Clitocybula atroalba [346642]	DQ437682
Cordyceps brongniartii [118266]	AB237658		unannotated
	AB027335
	AY282746
	AF398401
	AF398402
	AF479735
	AB106649
	AB258368
Lentinellus micheneri [233007]	AY298779
Ajellomyces capsulatus [5037]	Z67752
	U57103	a.I1	G186B
	U57102	a.I1	G184B
	Z75305	a.I1	CBS213.53
	U57101	a.I1	FLs1
Dothidea ribesia [147563]	AY016343
Artomyces austropiperatus [182278]	AY298775
Cordyceps kyushuensis [259534]	AY465958
Hygrocybe miniata f. longipes [378287]	DQ444859
Hymenelia epulotica [146300]	AF279393
Fusarium phaseoli [120645]	AF150482		GenBank synonym Fusarium solani f. sp. phaseoli
	AF150481		GenBank synonym Fusarium solani f. sp. phaseoli
Cordyceps sp. 97003 [94217]	AB027329
Hypocrea citrina [173943]	AY544693
Ustilago maydis [5270]	X62396	a.I1
Artomyces pyxidatus [48021]	AY298784
	AY298774
	U59066		GenBank synonym Clavicorona pyxidata
	AY298773
	AY298771
	AY298772
	AY298770
Roccella boergesenii [279123]	AY548807
Lentinellus omphalodes [5356]	U59078
Leucostoma cinctum [105485]	AF191167
Lentinellus subaustralis [182292]	AY298777
Ochronectria calami [110588]	AY489685
Monacrosporium arcuatum [97335]	AF106527
Monilinia fructicola [38448]	AF257088
	AF257089
	AY544724
	AF257094
	AF257093
	AF257092
	AF257091
	AF257090
	AF010505
	Y14211	a.I1
Descolea maculata [171508]	DQ440633
Fusarium solani f. sp. piperis [89880]	AF150487
Xylaria acuta [114808]	AY544719
Exophiala dermatitidis [5970]	Z75304	a.I1
	DQ823107
	X78481
Auriscalpium villipes [182291]	AY298776
Chondrostereum purpureum [58369]	AF082851
Monodictys castaneae [71663]	Y11715
Lentinellus cochleatus [194905]	AY298783
Paecilomyces inflatus [218615]	AB099943
Apioplagiostoma aceriferum [148325]	AF281664
Geosmithia argillacea [69808]	AB013733		str. IFO 31128
	AB012951		str. IAM14726
Barrmaelia oxyacanthae [101485]	AF064048
Bensingtonia yamatoana [4996]	AF101826
	D38239	a.I1
Lentinellus castoreus [194904]	AY298781
	AY298780
Metarhizium anisopliae [5530]	AF487276
Ustilaginoidea virens [124427]	AB105954
	AB162148
	AB116645
Exophiala calicioides [135514]	AB007685		was Graphium calicioides
	AB007686		was Graphium calicioides
Cephalotheca sulfurea [95345]	AF096173
Verticillium dahliae var. longisporum [100787]	AF153421		synonym Verticillium longisporum
Pseudohalonectria lignicola [42149]	U31812
Rhizoscyphus ericae [5183]	AY762620
	AY762621
	AY228753		synonym Hymenoscyphus ericae
Cintractia axicola [63370]	DQ631907		partial; terminates after P7'
Pleopsidium chlorophanum [247144]	AY316151
Cordyceps pseudomilitaris [153663]	AF327394
Capronia pilosella [45095]	AY316152
cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » environmental samples » ... »	uncultured soil fungus [167647]	AY382422
		AY382403
		AY382408
	uncultured fungus [175245]	AY168905
		AY168906
cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Chytridiomycota » ... »	Oedogoniomyces sp. CR84 [252682]	AY635839
cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Kirchneriella aperta [117505]	AJ271859
	Dunaliella parva [3048]	M62998	a.I1
	Selenastrum capricornutum [118073]	AF169628
	Monoraphidium minutum [39955]	AY846380
	Monoraphidium contortum [307511]	AY846375
	Raphidocelis subcapitata [307507]	AY846381
	Coelastrum astroideum [183310]	AF388380
	Dunaliella salina [3046]	M84320	a.I1
		UNP00875
		DQ447648
	Ankistrodesmus sp. NDem 9/21 T-6w [307508]	AY846374
	Quadrigula closterioides [82291]	Y17924
	Dunaliella bardawil [3045]	AF150905
	Scenedesmus pupukensis [42698]	X91267		was Kermatia pupukensis
	Pseudodidymocystis planctonica [113526]	AB037087
	Scenedesmus producto-capitatus [42693]	X91266
	Dictyochloris fragrans [179863]	AF367860
		AF367861
	Coelastrella multistriata [75801]	AB012846		missing 3'end of intron
	Scotiellopsis terrestris [75803]	AB012847
	Dictyochloris pulchra [179864]	AF367862
	Schroederia setigera [132188]	AF277650
	Desmodesmus pirkollei [165818]	AF348496
	Schroederiella apiculata [113536]	AB037098
	Tetradesmus wisconsinensis [91193]	AB037097		synonym Scenedesmus wisconsinensis
	Coelastrella multistriata var. corcontica [113518]	AB037082
	Scenedesmus sp. CCMP 1625 [155396]	AF339735
	Monoraphidium saxatile [307517]	AY846384
	Ankistrodesmus gracilis [81816]	AY846371
	coccoid green alga JL 4-10 [221655]	AY195982
	Tetraedron minimum [302393]	AY663042
	Monoraphidium terrestre [82352]	Y17817
cellular organisms » Eukaryota » Rhizaria » Cercozoa » Plasmodiophorida » ... »	Plasmodiophora brassicae [37360]	U18981
cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Chlorella sp. MBIC10043 [284942]	AB183579
	Chlorella sp. MBIC10747 [284944]	AB183635
	'Chlorella' saccharophila [3082]	AB058300
		AB183575
		AB183576
		AB183577
		AB058301
		AB183578
	Koliella spiculiformis [154509]	AF278744
	Choricystis minor [41300]	AY762605
	Stichococcus bacillaris [37433]	AB055864
		AB055865
	Stichococcus sp. BCP-SRS2-14 [256022]	AY377441
	Stichococcus sp. MBIC10457 [284983]	AB183599
	Choricystis sp. 1A1 [178341]	AF357147
	Oocystis heteromucosa [120747]	AF228689
cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Ulvophyceae » ... »	Gloeotilopsis paucicellularis [43260]	Z47997		synonym Pleurastrum paucicellulare
	Gloeotilopsis planctonica [34157]	Z28970	a.I1
	Protoderma sarcinoidea [53263]	Z47998	a.I1
	Urospora wormskioldii [264720]	AY476819
		AY476814
		AY476817
	Urospora neglecta [264721]	AY476823
		AY476824
		AY476826
	Urospora sp. U122 [264719]	AY476820
cellular organisms » Eukaryota » Rhizaria » Cercozoa » unclassified Cercozoa » ... »	Nuclearia-like filose amoeba N-Por [135516]	AF289081
cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » Coscinodiscophyceae » ... »	Leptocylindrus danicus [163516]	AY485501
cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Centramoebida » Acanthamoebidae » ... »	Acanthamoeba lenticulata [29196]	U94737
		U94736
		U94735
		U94738
		U02539		ATCC 30841
		U94741
cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Tubulinea » Euamoebida » ... »	Hartmannella vermiformis [5778]	DQ123623
cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Fungi incertae sedis » ... »	Coemansia mojavensis [4864]	AB053169
IE	2	327	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Chlorella sp. MRBG1 [335040]	AB219527
						uncultured Chlorella [254346]	AB206546
U	4	NSEQ	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sarcinomyces phaeomuriformis [66227]	X80710		LIT: Antonie Van Leeuwenhoek 68(1):19-33 (1995).
						Geosmithia argillacea [69808]	AB032117 AB032118
							AB032109 AB032110
							AB032113 AB032114
952	4	IIB	4	1761 - 2068	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Cordyceps ramosopulvinata [94211]	AB027348
								Paracoccidioides brasiliensis [121759]	AY955840
								Cordyceps sp. 97009 [94216]	AB027356
								Cryphonectria parasitica [5116]	AF029891	a.I2
956	10	I	6	217 - 1436	N	3	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sporobolomyces dimmenae [69977]	D66881
							cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Mycetozoa » Myxogastria » ... »	Fuligo septica [159720]	AJ584697
								Didymium iridis [5793]	AJ938154
									X71792
									AJ938153
							cellular organisms » Eukaryota » Heterolobosea » Acrasida » Acrasis » ... »	Acrasis rosea [43695]	AF011458
		IC1	3	639 - 699	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Centramoebida » Acanthamoebidae » ... »	Acanthamoeba sp. TUMSJ-341 [167752]	AF352391
								Acanthamoeba lenticulata [29196]	U94740
									U94739
		IE	1	375	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Chytridiomycota » ... »	Spizellomyces kniepii [109892]	AF164238		no 5' exon; missing 5' end of intron
966	1	I	1	209	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sporobolomyces dimmenae [69977]	D66881
967	3	IIB	3	848	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Scenedesmus obliquus [3088]	X17375
									AF204057
									AJ277428
989	31	I	11	205 - 759	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Glomerobolus gelineus [75749]	DQ247811
								Staurothele frustulenta [396381]	DQ823105
								Hyphozyma lignicola [177195]	AJ496239
								Petractis clausa [168918]	AF356661
								Rhynchostoma minutum [152654]	AF254663
									AF242269
								Endocarpon pallidulum [396380]	DQ823104
								Baeomyces placophyllus [106415]	AF356657
								Dermatocarpon luridum [172326]	AY640989
								Cladia retipora [50930]	U64681
								Cetradonia linearis [83788]	AY648095
		IE	20	334 - 460	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Exobasidium gracile [190086]	DQ785786
								Acrospermum compressum [152639]	AF242257
								Conotrema populorum [56759]	U86582
								leotiomycete sp. G21-24-KI129 [220858]	AY190276
								leotiomycete sp. G21-24-PU162 [220859]	AY190277
								Rhexocercosporidium sp. DSE48.1b [301706]	AJ864396
								Trichoglossum hirsutum [265104]	AY544697
								Thyridium vestitum [265083]	AY544715
								Paecilomyces sp. 97014 [130800]	AB044633
								Cordyceps ramosopulvinata [94211]	AB027326
								Rosellinia necatrix [77044]	AB014044
								Cordyceps kanzashiana [94210]	AB027325
								Exophiala nigra [52866]	X80707		was Nadsoniella nigra
									X91897	b.I1	was Nadsoniella nigra
								Cordyceps sp. 97003 [94217]	AB027329
								Cryptendoxyla hypophloia [64883]	AF015912	b.I1
								Cordyceps prolifica [94209]	AB027324
								Xylaria polymorpha [77046]	AB014043
								Melanopsamma pomiformis [80381]	AY489677
							cellular organisms » Eukaryota » Rhodophyta » Florideophyceae » Hildenbrandiales » ... »	Hildenbrandia rubra [31481]	AY571893
990	1	U	1	61	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Simonyella variegata [92844]	AY584669		spliceosomal; intron in variable region ca. E. coli position 990
1046	25	I	5	216 - 231	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Parmotrema tinctorum [235862]	AY584659
								Cladonia merochlorophaea [5200]	Z14025	a.I1	Formerly Cladonia merochlorophaea Asah
								Cladonia grayi [27339]	Z14026	a.I1
								Gymnoderma coccocarpum [206419]	AF523362
								Lecanora dispersa [39935]	L37734	a.I1
		IC1	20	333 - 495	N	3	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Selenastrum capricornutum [118073]	AF169628
								Raphidocelis subcapitata [307507]	AY846381
								Ankistrodesmus stipitatus [3109]	X56100	a.I1
								Kirchneriella aperta [117505]	AJ271859
								Coelastrum pseudomicroporum [183313]	AF388381
								Neodesmus danubialis [113524]	AB037086
								Monoraphidium minutum [39955]	AY846380
								Radiococcus polycoccus [170400]	AY044650		synonym Coenochloris polycocca
								Monoraphidium terrestre [82352]	Y17817
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Choricystis minor [41300]	X89012		was Nannochloris coccoides
									AB109544
									AY762605
								Choricystis sp. SAG 251-2 [72002]	X81965
								Chlorella sorokiniana [3076]	X73993	b.I1
								Choricystis sp. 4A3 [178343]	AF357149
								Choricystis sp. 1A1 [178341]	AF357147
								Choricystis sp. MDL5-9 [225408]	AY220082
								Botryococcus braunii [38881]	AJ581913
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Ulvophyceae » ... »	Gloeotilopsis paucicellularis [43260]	Z47997		synonym Pleurastrum paucicellulare
								Trichosarcina polymorpha [348768]	AM087962
1049	7	I	7	211 - 233	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Physcia aipolia [50936]	AY648099
								Physcia stellaris [116821]	AY648102
								Coccomyces dentatus [265080]	AY544701
								Physcia caesia [116813]	AY648100
								Amandinea punctata [116786]	AJ549800
								Hyperphyscia adglutinata [116796]	AJ549803
								Petractis luetkemuelleri [185330]	AF465461
1050	1	U	1	79	N	1	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » environmental samples » ... »	uncultured stramenopile [152704]	AY179998		spliceosomal
1052	6	I	5	210 - 245	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Symbiotaphrina buchneri [40220]	DQ248313
								Stegobium paniceum yeast-like symbiont [48274]	D49657	a.I1
								Staurothele frustulenta [396381]	DQ823105
								Umbilicaria flocculosa [164624]	AY648111
								Umbilicaria yunnana [284238]	AY648118
		IC1	1	424	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	'Chlorella' luteoviridis [31301]	X73998	a.I1	synonym Chlorella luteoviridis
1057	1	U	1	62	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Graphina poitiaei [185316]	AF465459		spliceosomal
1062	2	IC1	2	419 - 443	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Mycetozoa » Myxogastria » ... »	Fuligo septica [159720]	AJ584697		noted as 1065 in GB annotation
							cellular organisms » Eukaryota » Heterolobosea » unclassified Heterolobosea » Macropharyngomonas » ... »	Macropharyngomonas halophila [63601]	AF011465
1068	9	U	9	122 - 141	N	1	cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Desulfurococcales » ... »	Aeropyrum pernix [56636]	AB078019		Archaeal
									AB078018		Archaeal
									AB078020		Archaeal
									AB078021		Archaeal
									AB078022		Archaeal
									AB019553		Archaeal; strain:TB1
									AB019554		Archaeal; strain:TB7
									AB078017		Archaeal
								Aeropyrum camini [229980]	AB109559		Archaeal
1071	5	U	5	51 - 72	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Brachyconidiella monilispora [243521]	AY342015		spliceosomal
								Capronia pilosella [45095]	DQ823106		spliceosomal; misannotated
								Lopezaria versicolor [271828]	AY584675		spliceosomal
								Rhynchostoma minutum [152654]	AF242268		spliceosomal
								Chaetosphaeria curvispora [260530]	AY502933		spliceosomal
1078	1	I	1	1086	C	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Ulvophyceae » ... »	Caulerpa sertularioides [76315]	AY389514
1082	1	U	1	106	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Simonyella variegata [92844]	AY584669		spliceosomal
1083	2	U	2	64 - 292	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Paecilomyces inflatus [218615]	AB099943
								Rhamphoria delicatula [152657]	AF242267		spliceosomal
1092	1	U	1	636	N	1	cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Thermoproteales » ... »	Thermoproteus sp. IC-033 [70772]	AB009616		Archaeal
1101	2	U	2	518 - 519	N	1	cellular organisms » Archaea » Euryarchaeota » environmental samples » ... »	uncultured euryarchaeote [114243]	AY652726		Archaeal
									DQ848677
1139	4	IC1	4	391 - 448	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Ankistrodesmus sp. NDem 9/21 T-6w [307508]	AY846374		intron in variable region near E. coli position 1139
								Pseudodidymocystis planctonica [113526]	AB037087		intron in variable region near E. coli position 1139
								Selenastrum capricornutum [118073]	AF169628		intron in variable region near E. coli position 1139
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Amphikrikos cf. nanus Hegewald 1995-26 [120763]	AF228690		intron in variable region near E. coli position 1139; synonym Amphikrikos sp. Hegewald 1995-26
1197	9	U	9	74 - 150	N	4	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Anguillospora crassa [213319]	AY204574		spliceosomal
								Alatospora acuminata [222513]	AY204583		spliceosomal
									AY204584		spliceosomal
									AY204585		spliceosomal
							cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » environmental samples » ... »	uncultured stramenopile [152704]	AY179993		spliceosomal
							cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » Bacillariophyta » Coscinodiscophyceae » ... »	Cymatosira belgica [49246]	X85387		spliceosomal
								Extubocellulus spinifer [265572]	AY485504		spliceosomal
							cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » environmental samples » ... »	uncultured fungus [175245]	AY168913		spliceosomal
									AY168911		spliceosomal
1199	121	I	17	NSEQ - 592	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Physcia dimidiata [116814]	AJ506970 AJ507615		implicit from annotations
								Endocarpon pallidulum [396380]	DQ823104
								Acarosporina microspora [271836]	AY584667
								Rinodina oxydata [205642]	AJ506971
								Diplotomma epipolium [501307]	AJ506969
								Diplotomma alboatrum [205613]	AJ549802
								Phaeophyscia hispidula [244694]	AY648103
								Phaeophyscia orbicularis [116805]	AJ549805
								Tornabea scutellifera [205647]	AJ549810
								Protoblastenia siebenhaariana [258892]	AY425627
								Physcia aipolia [50936]	AY648099
								Mycoblastus sanguinarius [312200]	DQ782879		misannotated
								Mycocalicium albonigrum [39942]	L37736
								Staurothele frustulenta [396381]	DQ823105
								Ostropa barbara [271838]	AY584666
								Gymnoderma coccocarpum [206419]	AF523362
								Cetradonia linearis [83788]	AY648095
		IC1	1	420	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Heterolobosea » unclassified Heterolobosea » Macropharyngomonas » ... »	Macropharyngomonas halophila [63601]	AF011465
		IE	103	228 - 653	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Cladonia merochlorophaea [5200]	Z14025		Formerly Cladonia merochlorophaea Asah
								Papulosa amerospora [101488]	AF064050
								Apioplagiostoma aceriferum [148325]	AF281665
								Sporobolomyces taupoensis [69980]	D66886
								Tilletiopsis oryzicola [132575]	AB045705
								Leucostoma cinctum [105485]	AF191168
								Exobasidium gracile [190086]	DQ785786
								Tilletiopsis flava [58914]	AB045703
									D82819
								leotiomycete sp. G21-24-RU19 [220860]	AY190278
								leotiomycete sp. G21-24-A201 [220856]	AY190274
								leotiomycete sp. G21-24-A204 [220857]	AY190275
								leotiomycete sp. G21-24-PU162 [220859]	AY190277
								Claviceps africana [83212]	AF281176
								Ochrolechia parella [129506]	AF274109
								Xylariales sp. F17 [246512]	AY315426
								Sclerotinia trifoliorum [28548]	AY187075
								Xylariales sp. F15 [246511]	AY315424
								Bensingtonia sakaguchii [109612]	AB001746
									AB001747
								Cordyceps cardinalis [224370]	AB237660		unannotated
								Cordyceps sp. 97009 [94216]	AB027332
								Paecilomyces cicadae [181121]	AB085886
									AB086631
									AB085887
									AB086630
									AB085888
								Cordyceps takaomontana [131074]	AB044631
								Exophiala calicioides [135514]	AB007685		was Graphium calicioides
									AB007686		was Graphium calicioides
								Penicillium radicum [228353]	AY256855
								Lewia infectoria [45303]	AY154690
									AY154688
									AY154692
								Penicillium sabulosum [106127]	AB033530
								Bionectria ochroleuca [29856]	AB013010		synonyms Nectria aureofulva, Bionectria aureofulva
									AB012952		synonym Nectria ochroleuca
								Penicillium oblatum [106126]	AB033529
								Menispora tortuosa [139972]	AY544723
								Cintractia sorghi-vulgaris [293803]	DQ234548
								Cordyceps militaris [73501]	AB070373
									AB027333
									AB084156
									AB070375
									AB070374
									AF327392
AB233336
Bulbithecium hyalosporum [95318]	AF281666
Paecilomyces pascua [106128]	AB033528
Cordyceps kyushuensis [259534]	AY465958
Cordyceps sp. BCMU CN03 [343855]	AB233335
Cordyceps bassiana [176275]	AB237657
	AB079609								GenBank anamorph Beauveria bassiana
	AB079125								GenBank anamorph Beauveria bassiana
Cordyceps pruinosa [129524]	AB044629
Cordyceps sp. 97005 [130799]	AB044630
Bensingtonia thailandica [119489]	AB040117
	AB040116
	AB040115
	AB040114
Cordyceps brongniartii [118266]	AB237658								unannotated
	AB258367
	AB258368
	AB106649
	AB027335
Verticillium fungicola var. flavidum [170723]	AB112030
Torrubiella flava [219582]	AB100609
Hydropisphaera erubescens [110568]	AY545722
Claviceps sorghicola [83213]	AF281177
Gondwanamyces proteae [5156]	AY271804
Chaetosphaeria curvispora [260530]	AY502933
Claviceps panicoidearum [379502]	AB255604		unannotated
	AB255605		unannotated
Fusarium solani f. xanthoxyli [121863]	AF150492
	AF150491
Graphium basitruncatum [118975]	AB038421
Neotyphodium uncinatum [5050]	AB102783
Hysteropatella clavispora [100029]	AY541483
Tolypocladium inflatum [29910]	AB255606		unannotated
	AB044634
	AY245674
Epichloe typhina [5113]	AB105952
	AB105953
Cordyceps prolifica [94209]	AB027324
Graphium penicillioides [67620]	AB007682
Cordyceps ramosopulvinata [94211]	AB027326
Cordyceps kanzashiana [94210]	AB027325
Fusarium phaseoli [120645]	AF150481		GenBank synonym Fusarium solani f. sp. phaseoli
	AF150483		GenBank synonym Fusarium solani f. sp. phaseoli
Fusarium solani f. robiniae [121877]	AF150489
	AF150490
Metarhizium flavoviride var. minus [92631]	AF280632
Fusarium solani f. batatas [121868]	AF150484
Roccella boergesenii [279123]	AY548807
Xylaria polymorpha [77046]	AB014043
Natantispora retorquens [85911]	AF352086		unannotated; synonym Halosarpheia retorquens
Microbotryum violaceum [5272]	DQ789983
Dendryphiopsis atra [85923]	AF053731
Cryphonectria parasitica [5116]	L42441	a.I1
Cryphonectria radicalis [40262]	L42442
Cryptendoxyla hypophloia [64883]	AF281670
cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Chytridiomycota » ... »	Oedogoniomyces sp. CR84 [252682]	AY635839
	Karlingiomyces sp. JEL93 [110075]	AF164278 AF164279 AF164280
1201	1	IE	1	366	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Geosmithia viridis [106120]	AB033527		aligns well with 1199 IE introns -- error in GenBank entry?
1205	7	U	7	32 - 34	N	3	cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Thermoproteales » ... »	Pyrobaculum oguniense [99007]	AB087402		Archaeal
								Thermoproteus sp. IC-061 [70773]	AB009617		Archaeal
									AB081846		Archaeal
								Thermoproteus sp. IC-033 [70772]	AB009616		Archaeal
								Thermoproteus neutrophilus [70771]	AB009618		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon pHGPA13 » ... »	uncultured archaeon pHGPA13 [95173]	AB027540		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon pHGPA1 » ... »	uncultured archaeon pHGPA1 [95944]	AB027539		Archaeal
1210	36	I	35	190 - 502	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Diplotomma epipolium [501307]	AJ506969
								Diplotomma alboatrum [205613]	AJ549802
								Physcia stellaris [116821]	AY648102
								Physcia aipolia [50936]	AY648099
								Phaeophyscia hispidula [244694]	AY648103
								Phaeophyscia orbicularis [116805]	AJ549805
								Physcia dimidiata [116814]	AJ507615
								Lecanora dispersa [39935]	L37734	a.I1
								Physcia caesia [116813]	AY648100
									AY648098
								Rhizoplaca chrysoleuca [112062]	AY530888
									AY530879
									AY530880
									AY530881
									AY530882
								Hyperphyscia adglutinata [116796]	AJ549803
								Protoblastenia lilacina [258894]	AY425629
								Cladonia merochlorophaea [5200]	Z14025	a.I1	Formerly Cladonia merochlorophaea Asah
								Sporobolomyces dimmenae [69977]	D66881
								Gymnoderma coccocarpum [206419]	AF523362
								Symbiotaphrina buchneri [40220]	DQ248313
								Stegobium paniceum yeast-like symbiont [48274]	D49657	a.I1
								Alatospora acuminata [222513]	AY357261
								Protoblastenia laeta [258901]	AY425651
									AY548818
									AY425653
									AY425650
									AY425652
								Bannoa hahajimensis [111969]	AB035896
									AB035895
									AB035897
									AB035894
								Piriformospora indica [65672]	AY293147
								Protoblastenia calvella [258900]	AY425647
									AY425646
		IC2	1	1335	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Cryphonectria parasitica [5116]	AF029891		ORF's 5' isn't correct
1213	7	U	7	661 - 688	N	3	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon pHGPA13 » ... »	uncultured archaeon pHGPA13 [95173]	AB027540		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Thermoproteales » ... »	Thermoproteus neutrophilus [70771]	AB009618		Archaeal
								Pyrobaculum oguniense [99007]	AB087402		Archaeal
								Thermoproteus sp. IC-033 [70772]	AB009616		Archaeal
								Thermoproteus sp. IC-061 [70773]	AB081846		Archaeal
									AB009617		Archaeal
							cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon pHGPA1 » ... »	uncultured archaeon pHGPA1 [95944]	AB027539		Archaeal
1214	2	U	2	59	N	1	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » environmental samples » ... »	uncultured stramenopile [152704]	AF372749		spliceosomal
									AF372748		spliceosomal
1221	1	U	1	72	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Simonyella variegata [92844]	AY584669		spliceosomal
1224	1	IC2	1	1380	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Agrocybe aegerita [5400]	U54637	a.I1
1226	2	U	2	59	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Rhynchostoma minutum [152654]	AF254663		spliceosomal
									AF242269		spliceosomal
1228	1	U	1	123	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Chlorociboria aeruginosa [54693]	AF292087		spliceosomal
1229	27	U	27	51 - 172	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Lopezaria versicolor [271828]	AY584675		spliceosomal
								Letrouitia domingensis [157776]	AY584672		spliceosomal
								Rhizoplaca chrysoleuca [112062]	AY530881		spliceosomal
									AY530879		spliceosomal
									AY530880		spliceosomal
									AY530882		spliceosomal
									AY530883		spliceosomal
									AY530884		spliceosomal
								Flavoparmelia caperata [172615]	AY584663		spliceosomal
								Physconia detersa [114785]	AJ240509		spliceosomal
								Physconia kurokawae [114790]	AJ240510		spliceosomal
								Physconia distorta [114786]	AJ240508		spliceosomal
								Physconia elegantula [114788]	AJ240507		spliceosomal
								Physconia perisidiosa [114789]	AJ240512		spliceosomal
								Physconia venusta [114784]	AJ240511		spliceosomal
								Paecilomyces inflatus [218615]	AB099943
								Psora crenata [258896]	AY425634		spliceosomal
								Xanthoparmelia conspersa [111622]	AY584665		spliceosomal
								Mycoblastus sanguinarius [312200]	DQ782879		spliceosomal
								Cordyceps prolifica [94209]	AB027324 AB027370		spliceosomal
								Punctelia hypoleucites [271830]	AY584670		spliceosomal
								Punctelia rudecta [271831]	AY584660		spliceosomal
								Protoblastenia siebenhaariana [258892]	AY425627		spliceosomal
								Togniniella acerosa [312314]	AY761072		spliceosomal
									AY761073		spliceosomal
								Crocynia pyxinoides [209117]	AY584677		spliceosomal
								Fulgensia bracteata [157765]	AJ535288		spliceosomal
1231	1	U	1	112	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Gymnoderma coccocarpum [206419]	AF523362		spliceosomal
1363	1	U	1	150	N	1	cellular organisms » Archaea » environmental samples » uncultured archaeon SAGMA-B » ... »	uncultured archaeon SAGMA-B [140246]	AB050206		Archaeal
1367	2	IC1	2	648	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Chlorella sp. MRBG1 [335040]	AB219527
								uncultured Chlorella [254346]	AB206546
1384	2	I	2	178 - 180	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Phaeophyscia orbicularis [116805]	AJ549805
								Phaeophyscia hispidula [244694]	AY648103
1389	20	I	10	210 - 721	N	3	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Cladonia merochlorophaea [5200]	Z14025	a.I1	Formerly Cladonia merochlorophaea Asah
								Mycoblastus sanguinarius [312200]	DQ782879
								Hyphozyma sanguinea [202759]	AJ496238
								Staurothele frustulenta [396381]	DQ823105
								Endocarpon pallidulum [396380]	DQ823104
								Physcia undulata [221732]	AJ549806
								Rinodina oxydata [205642]	AJ506971
							cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Mycetozoa » Myxogastria » ... »	Didymium iridis [5793]	AJ938151
									AJ938150
							cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Centramoebida » Acanthamoebidae » ... »	Acanthamoeba lenticulata [29196]	U94734		strain 407-3a
		IC1	10	297 - 1275	N	4	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sporobolomyces bischofiae [112013]	AB035721
								Bensingtonia thailandica [119489]	AB040115
									AB040116
									AB040117
									AB040114
								Sporobolomyces magnisporus [234794]	AB112078
								Exobasidium gracile [190086]	DQ785786
							cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Chytridiomycota » ... »	Spizellomyces punctatus [109760]	AY546684
							cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Fungi incertae sedis » ... »	Zoophagus insidians [78907]	AB016009
							cellular organisms » Eukaryota » Amoebozoa » Centramoebida » Acanthamoebidae » ... »	Acanthamoeba sp. KA/MSG23 [217564]	AY176047
1391	1	U	1	691	N	1	cellular organisms » Archaea » Crenarchaeota » Thermoprotei » Thermoproteales » ... »	Vulcanisaeta distributa [164451]	AB063639		Archaeal
1403	1	IB1	1	272	M	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi/Metazoa incertae sedis » Ichthyosporea » ... »	Amoebidium parasiticum [4881]	AF538044
1408	1	U	1	131	N	1	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » environmental samples » ... »	uncultured stramenopile [152704]	AY180009		spliceosomal
1502	2	U	2	525 - 527	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Bensingtonia sakaguchii [109612]	AB001746
									AB001747
1506	354	I	40	161 - 467	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Phaeophyscia orbicularis [116805]	AF224452
									AF224458
									AF224453
									AF224451
									AF224459
									AF224460
									AF224449
									AJ549805
								Phaeophyscia ciliata [116800]	AF224454
									AF224450
									AF224456
									AF224354
									AF224455
									AF224457
									AF224447
									AF224448
								Phaeophyscia hispidula [244694]	AY303138		5' end of intron missing from GB entry
								Phaeophyscia constipata [116801]	AF224374
								Naemacyclus niveus [64356]	AF013223		synonym Cyclaneusma niveum
								Phaeophyscia endophoenicea [116803]	AF224445
								Phaeophyscia endococcina [116802]	AF224444
								Phaeophyscia sciastra [116806]	AF224446
								Hyphozyma sanguinea [202759]	AJ496238
								Symbiotaphrina buchneri [40220]	DQ248313
								Stegobium paniceum yeast-like symbiont [48274]	D49657	a.I1
								Staurothele frustulenta [396381]	DQ826736
								Endocarpon pallidulum [396380]	DQ826735
								Teloschistes lacunosus [111579]	AJ421260
									AJ421259
									AF098406
									AF098405
								Teloschistes villosus [111577]	AJ421263
									AJ421261
									AF098407
									AJ421262
									AF098408
								Teloschistes contortuplicatus [180404]	AJ421258
								Physcia undulata [221732]	AJ549806
								Dendryphiopsis atra [85923]	AF053731
							cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » environmental samples » ... »	uncultured fungus [175245]	AM260902
		IC1	312	305 - 1546	N	12	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Cadophora gregata f. sp. adzukicola [86000]	AF056487		P5c missing; synonym Phialophora gregata f. sp. adzukicola
								glacial ice euascomycete GI307 [156710]	AF261659
								mitosporic fungus sp. JCM 8069 [118665]	AB038422		synonym anamorphic fungus sp. JCM 8069
								Rhizoscyphus ericae [5183]	AY394907		synonym Hymenoscyphus ericae
									U06868		synonym Hymenoscyphus ericae
								Cadophora finlandica [62723]	AY394885
									AJ534704		synonym Phialophora finlandia
									AF486119		synonym Phialophora finlandia; 5' end of intron not present
								Bensingtonia ciliata [4989]	D38233	a.I1
								Bisporella citrina [155150]	AF335454
								Sporobolomyces magnisporus [234794]	AB112077		misannotated
								Pneumocystis murina [263815]	AY532651
								Protomyces macrosporus [48147]	D85143	a.I1
								Sporobolomyces ogasawarensis [111310]	AB035713
									AB035712
									AB035714
									AB035715
									AB035716
									AB035717
									AB035718
									AB035719
								Pezicula cinnamomea [108560]	AF141184
									AF141185
								Monacrosporium leptosporum [97337]	AF106529
Venturia inaequalis [5025]	U63625								strain RACE 4
	U63626								strain TR141
	U63628								strain X94 01-2
	U63624								strain D94 07-1
	AF065831								str. 685BF
	U63627								strain TR50
Monacrosporium bembicodes [47272]	U51976
Bourdotia sp. GEL5065 [282314]	DQ234545
Connersia rilstonii [95320]	AF281667
Pneumocystis carinii [4754]	X12708 X13687							a.I1
Sporobolomyces bischofiae [112013]	AB035721
Drechslerella brochopaga [47238]	U51950							a.I1	synonym: Arthrobotrys brochopaga
Dactylella copepodii [47259]	U51964
Protomyces inouyei [27332]	D11377							a.I1
Arthrobotrys cladodes [47294]	U51945
	U51952
Arthrobotrys polycephala [47239]	U51951
Dactylella huisuniana [47260]	U51965
Dactylella gampsospora [47295]	U51960
Arthrobotrys conoides [74498]	AF106534
Anguillospora rosea [253294]	AY357265
Geniculifera cystosporia [47263]	U51966
Monacrosporium polybrochum [47261]	U51973								synonym Dactylella polybrocha
Elsinoe ampelina [302913]	AY826762								misannotated
	AY826763								misannotated
	AY826764								misannotated
Geomyces sp. C239/10G [242094]	AY345347
Geomyces sp. T489/9b [242096]	AY345348
Arthrobotrys cylindrospora [47240]	U51953
	AF106538								synonym Dactylella cylindrospora
Monacrosporium asthenopagum [47258]	U51962								synonym Dactylella asthenopaga
Leptosphaeria korrae [29836]	AF486626
Geosmithia viridis [106120]	AB033527
Arthrobotrys botryospora [47242]	U51955
Gnomoniella tubiformis [150558]	AF281671
Paecilomyces pascua [106128]	AB033528
Penicillium sabulosum [106127]	AB033530
Colacogloea peniophorae [5233]	DQ234565
Tilletiopsis flava [58914]	AB045703
	D82819
Penicillium argillaceum [103783]	AB033532
	AB033531
	AB033533
Sclerotinia trifoliorum [28548]	AY187069
	AY187076
	AY187072
Penicillium oblatum [106126]	AB033529
Bensingtonia yamatoana [4996]	D38239	a.I1
Bensingtonia thailandica [119489]	AB040117
	AB040115
	AB040116
	AB040114
Cenococcum geophilum [5570]	Z48525
	Z48534
	Z48526
	Z48536
	Z48533	a.I1
	Z11998
	Z48529
	Z48521
	Z48537
	Z48527
Rhabdocline parkeri [66504]	AF462428
	AF462427
	AF462426
Kabatina juniperi [123900]	AY183367
Kabatina thujae [64362]	AF462437
Exophiala calicioides [135514]	AB007685		was Graphium calicioides
	AB007686		was Graphium calicioides
Protomyces pachydermus [48148]	D85142	a.I1
Tilletiopsis oryzicola [132575]	AB045705
Arthrobotrys superba [47237]	U51949
cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » unclassified Fungi » ... »	mycorrhizal fungal sp. pkc15 [249038]	AY394887
cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Streptophyta » Zygnemophyceae » ... »	Cylindrocystis brebissonii [102167]	AF115439
	Genicularia spirotaenia [31316]	X74753	a.I1
	Gonatozygon aculeatum [45763]	X91346
	Sirogonium sticticum [102164]	AF115441
	Closterium spinosporum var. spinosporum [157566]	AF352224
	Closterium spinosporum var. malaysiense [157569]	AF352227
	Staurastrum punctulatum [102822]	AF115442		P5b cannot be aligned well
	Staurastrum sp. M753 [76048]	X77452	a.I1
	Mesotaenium caldariorum [31321]	X75763	a.I1
	Closterium spinosporum var. ryukyuense [157575]	AF352240
	Staurastrum sp. M752 [31318]	X74752	a.I1
	Closterium calosporum var. himalayense [157570]	AF352229
	Closterium littorale [102166]	AF115438		P3 dosn't match P3'
	Closterium spinosporum var. crassum [157576]	AF352241
	Sphaerozosma granulatum [35867]	X79496	a.I1
	Closterium gracile [157577]	AF352237
	Closterium ehrenbergii [102165]	AY148846
		AY148847
		AY148859
		AY148839
		AY148840
		AY148858
		AY148862
		AY148861
		AY148860
		AY148817
		AY148816
		AY148812
		AY148811
		AY148850
		AY148849
		AY148851
		AY148848
		AY148814
		AF352228
		AY148808
		AY148809
		AY148810
		AY148813
		AY148815
		AY148820
		AY148821
		AY148819
		AF115437
		AY148818
		AY148842
		AY148845
		AY148843
		AY148833
		AY148832
		AY148831
		AY148822
		AY148823
		AY148824
		AY148825
		AY148826
		AY148841
		AY148844
		AY148864
		AY148838
		AY148834
		AY148835
		AY148836
		AY148828
AY148827
AY148863
AY148830
AY148852
AY148829
AY148857
AY148856
AY148855
AY148854
AY148853
AY148837
Closterium calosporum var. galiciense [157574]	AF352239
Cosmocladium saxonicum [35865]	X79497	a.I1
Closterium incurvum [157578]	AF352231
Closterium selenastrum [157581]	AF352242
Closterium moniliferum var. moniliferum [157564]	AF352223
	AF352233
	AY148874
	AY148875
	AF352222
	AY148873
	AY148876
Closterium moniliferum var. submoniliferum [157563]	AY148866
	AY148867
	AY148869
	AY148870
	AY148872
	AY148871
	AF352221
	AY148865
	AY148868
Closterium navicula [157579]	AF352232
Closterium pleurodermatum [157580]	AF352238
Closterium acerosum [130971]	AF352230
Closterium wallichii [157583]	AF352243
Closterium pusillum var. maius [157573]	AF352235
Penium margaritaceum [102169]	AF115440
Closterium calosporum var. calosporum [157568]	AF352225
Closterium tumidum [157571]	AF352234
Closterium venus [157582]	AF352236
Cosmarium botrytis [33101]	X77453	a.I1
Closterium sp. NIES-52 [157561]	AF352226
Mougeotia scalaris [13158]	X70705	a.I1
Zygnema circumcarinatum [35869]	X79495	a.I1	synonym Zygnemopsis circumcarinata
cellular organisms » Eukaryota » environmental samples » uncultured eukaryote » ... »	uncultured eukaryote [100272]	AY082975
		AY082986
		AY082973
cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	Stichococcus sp. NB2VFF10 [202781]	AF513370		no 3' exon sequence
	Koliella sempervirens [154508]	AF278743
	Stichococcus sp. MBIC10465 [284984]	AB183601
	Stichococcus bacillaris [37433]	AB055866
		AB055864
		AB055865
	Stichococcus sp. MBIC10457 [284983]	AB183599
	'Chlorella' mirabilis [3083]	X74000	a.I1	synonym Chlorella mirabilis
cellular organisms » Eukaryota » Rhizaria » Cercozoa » Plasmodiophorida » ... »	Plasmodiophora brassicae [37360]	U18981
cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » environmental samples » ... »	uncultured fungus [175245]	AM260846
		AM260809
		AM260926
cellular organisms » Eukaryota » Rhodophyta » Florideophyceae » Hildenbrandiales » ... »	Hildenbrandia rubra [31481]	AY571896
		AY571894
		AY571895
		AY571899
		L19345	b.I1
		AY571898
		AF076995
		AY571897
cellular organisms » Eukaryota » Rhodophyta » Bangiophyceae » Bangiales » ... »	Porphyra sp. [2790]	AF136420
		AF136422
		AB013182
		AB017077
	Porphyra yezoensis [2788]	AB013178
		AB017081
		AB017078
		AB017083
		AB017075
		AB017076
	Bangia fuscopurpurea [101920]	AF172586		North Carolina/NC; exon sequence from AF043363
		AF172584		France: Nice; exon sequence from AF175535
		AF172585		Germany: Helgoland/HL; exon sequence from AF175532
		AF172587		Greece/GR; exon sequence from AF175533
		AF172583		New Jersey/NJ; exon sequence from AF169335
		AF172582		Mexico/MEX; exon sequence from AF169334
		AF342745
		AF172589		Oregon/OR; exon sequence from AF043358
		AF172592		Newfoundland/NF; exon sequence from AF043357
		AF172593		Ireland/IR; exon sequence from AF175534
		AF172590		California/CA; exon sequence from AF043356
		AF172591		Victoria/BC2; exon sequence from AF043359
		AF172594		Nova Scotia/NS; exon sequence from AF169337
	Porphyra suborbiculata [76158]	AF136424		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378664		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378658		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378653		synonym Porphyra carolinensis
		AF378654		synonym Porphyra carolinensis
		AF378662		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378661		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378660		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378649		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378659		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378650		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378651		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378663		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378665		synonym Porphyra lilliputiana
		AF378652
	Porphyra cinnamomea [199484]	AF136419
	Porphyra haitanensis [76159]	AB013181
	Porphyra sp. Marseille [144552]	AF172597		exon sequence from AF175546
	Porphyra leucosticta [35146]	AF172598		exon sequence from AF175557
	Porphyra pseudolanceolata [139731]	AF172599		exon sequence from AF175543
	Porphyra sp. Baleia [298901]	AY766358
	Porphyra pseudolinearis [81939]	AB013185
	Porphyra katadae [76161]	AB013184
	Porphyra capensis [298899]	AY766361
	Porphyra sp. Brest [144553]	AF172601		exon sequence from AF175548
	Porphyra rediviva [139732]	AF172600		exon sequence from AF175544
	Porphyra rakiura [199481]	AF136425
	Porphyra tenera [2785]	AB029884
		AB029883
		AB101442
		AB100958
		AB029882
		AB029881
		AB029880
		AB013176
		AB029879
		AB100959
		AB013175
	Porphyra purpurea [2787]	AF172588		exon sequence from AF175551
	Bangia atropurpurea [31347]	D88387
		L36066
Porphyra umbilicalis [2786]	AY347902
	AY347908
	AY347903
	AY347909
	AY347904
	AY347905
	AY347906
	AY347910
	AF172602		Germany: Hallig Grode; exon sequence from AF175549
Porphyra spiralis [31350]	L26175	a.I1
	L26176	a.I1
	L26177	a.I1
Porphyra dentata [76160]	AB013183
Porphyra fucicola [144551]	AF172595
Porphyra virididentata [199482]	AF136421
Porphyra drewiana [298898]	AY766362
cellular organisms » Eukaryota » Alveolata » Ciliophora » Intramacronucleata » ... »	Tokophrya lemnarum [168139]	AY332721
		AY332720
cellular organisms » Eukaryota » Rhodophyta » Rhodellophyceae » Rhodellales » ... »	Rhodella sp. MBIC10593 [284791]	AB183619
cellular organisms » Eukaryota » Rhizaria » Cercozoa » Cercomonadida » ... »	Heteromita sp. PRA-74 [323453]	AY905499
U	2	NSEQ	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Geosmithia argillacea [69808]	AB032114 AB032115 AB032118 AB032119
							AB032110 AB032111
1507	10	IC1	10	267 - 337	N	2	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Phialocephala fortinii [62722]	AY078135		incomplete 5' end
									AY078139		incomplete 5' end
									AY524846
								Phialocephala sphaeroides [271845]	AY524844
								Meliniomyces variabilis [313359]	AY838789
									AY838785
							cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » environmental samples » ... »	uncultured fungus [175245]	AM260808
									AM260810
									AM260920
									AM260929
1508	1	U	1	239	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Sporobolomyces dimmenae [69977]	D66881
1510	1	U	1	79	N	1	cellular organisms » Eukaryota » stramenopiles » environmental samples » ... »	uncultured stramenopile [152704]	AY179992		spliceosomal
1511	5	IC1	5	410 - 457	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Talaromyces wortmannii [28567]	AY157634
								Penicillium pulvillorum [104261]	AF178517
									AF178526
									AF178527
								Penicillium ochrochloron [69780]	AF178516
1512	78	IC1	78	361 - 1550	N	4	cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Chlorophyceae » ... »	Selenastrum capricornutum [118073]	AF169628
								Coelastrum pseudomicroporum [183313]	AF388381
								Monoraphidium terrestre [82352]	Y17817
								Botryococcus sp. UTEX 2629 [244724]	AJ581914
								Dunaliella bardawil [3045]	AF150905
								Dictyochloris fragrans [179863]	AF367860
								Dictyochloris pulchra [179864]	AF367862
								Dunaliella parva [3048]	M62998	a.I1
								Lobochlamys segnis [52035]	AJ410456		synonym Chlamydomonas segnis
								Characium saccatum [3094]	M84319	a.I1
							cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Geosmithia argillacea [69808]	AB013734		str. IFO 31128
									AB012951		str. IAM14726
							cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Trebouxiophyceae » ... »	uncultured Trebouxia photobiont [285713]	AJ969514
									AJ969523
									AJ969513
									AJ969580
								Trebouxia arboricola [53268]	AJ969530
									AJ969526
									AJ969528
									AJ969520
									AJ969560
									AJ969609
									AJ969518
									AJ969519
									AJ969581
									Z68705
									AJ969512
									AJ969565
									Z68704
									AJ249482
									AJ249564
									AJ249481
									AJ969552
									AJ969509
								Coccomyxa pringsheimii [312852]	AY762603
								Trebouxia gelatinosa [53269]	AJ249568
									AJ249569
									Z68698		str. GRB108
								Trebouxia decolorans [300845]	AM159210
									AJ969572
									AJ969569
									AJ969539
									AJ969554
									AJ969556
									AJ969595
									AJ969599
									AJ969600
									AJ969603
									AJ970889
									AM159503		unannotated
								Trebouxia jamesii [53267]	Z68699
									Z68700
									AJ249571
								Trebouxia usneae [53266]	AJ249573
									Z68702
								Trebouxia corticola [103875]	AJ249566
								Trebouxia impressa [13788]	AJ249570
								Choricystis minor [41300]	X89012		was Nannochloris coccoides
									AB109544
								Trebouxia galapagensis [103876]	AJ249567
								Trebouxia sp. 98.003B2 [103872]	AJ249572
								Choricystis sp. 1A1 [178341]	AF357155
								Trebouxia higginsiae [103877]	AJ249574		3' end not clear
								Chlorella sp. MRBG1 [335040]	AB219527
uncultured Chlorella [254346]	AB206546
cellular organisms » Eukaryota » Viridiplantae » Chlorophyta » Ulvophyceae » ... »	Gloeotilopsis paucicellularis [43260]	Z47997		synonym Pleurastrum paucicellulare
	Protoderma sarcinoidea [53263]	Z47998
	Urospora neglecta [264721]	AY476821
		AY476822
	Urospora penicilliformis [138169]			LIT: Mol. Biol. Evol. 10(6):1317-1326 (1993).
	Urospora sp. U122 [264719]	AY476820
	Urospora wormskioldii [264720]	AY476815
		AY476816
		AY476817
		AY476818
		AY476819
	Urospora sp. AB58 [264717]	AY476812
	Urospora sp. UP52 [264718]	AY476813
1514	4	U	4	59 - 67	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Capronia pilosella [45095]	DQ826737		spliceosomal
								Arthonia lapidicola [600402]			LIT: Curr. Genet. 29(6):582-586 (1996).
								Capronia semiimmersa [5601]	X65199		spliceosomal; genbank anamorph Phialophora americana
								Exophiala mesophila [212818]	AF542377		spliceosomal
1516	222	I	222	141 - 245	N	1	cellular organisms » Eukaryota » Fungi/Metazoa group » Fungi » Dikarya » ... »	Biatora fallax [99245]	AJ247526
									AJ247527
									AJ247548
								Biatora toensbergii [99254]	AJ247519
								Biatora helvola [99246]	AJ247546
									AJ247547
									AJ247543
									AJ247550
									AJ247542
									AJ247549
									AJ247545
									AJ247544
									AJ247541
									AJ247517
									AJ247515
									AJ247557
									AJ247556
									AJ247514
									AJ247516
									AJ247518
								Biatora pseudohelvola [99250]	AJ247571
									AJ247572
									AJ247558
									AJ247570
								Biatora ocelliformis [99249]	AJ247521
									AJ247520
								Biatora sphaeroidiza [99251]	AJ247553
									AJ247551
									AJ247552
								Lophodermium seditiosum [128023]	AF462435
								Phaeophyscia ciliata [116800]	AF224454
									AF224457
									AF224354
									AF224447
									AF224448
									AF224450
									AF224456
									AF224455
								Phaeophyscia orbicularis [116805]	AF224453
									AF224449
									AF224451
									AF224452
									AJ549805
									AF224458
									AF224460
									AF224459
								Biatora efflorescens [99243]	AJ247554
								Lophodermium conigenum [187512]	AY183364
								Lophodermium sp. SL1 [368790]	AB247944
								Phaeophyscia hispidula [244694]	AY303138
								Phaeophyscia nigricans [116804]	AF224375
								Lophodermium pinastri [64358]	AF462434
								Rhizoplaca chrysoleuca [112062]	AY509793
									AY509794
									AY509792
									AY509795
									AY509796
								Physcia caesia [116813]	AY498690
									AF224436
									AF224386
									AF224438
									AF224435
									AY303131
									AF224384
AF224385
AY303134
AF224389
AF224379
AF224387
AF224388
AF224437
Ahtiana sphaerosporella [78062]	AF141859
Physcia aipolia [50936]	AF224431
	AY303135
	AF224432
	AF224393
	AF224396
	AY303136
	AF224397
	AF224394
	AF224392
	AF224398
	AF224390
	AF224391
	AF224395
	AY303133
	AY303132
	AF224383
Cavernularia lophyrea [94397]	AF141367		possibly IP 1521
	AF115757		possibly IP 1521
Xanthoparmelia semiviridis [172613]	AF451746		synonym Chondropsis semiviridis
Phaeophyscia constipata [116801]	AF224374
Lecanora dispersa [39935]	L37734	a.I1
Nephromopsis laureri [150892]	AF451786		genbank synonym: Tuckneraria laureri
Physcia dubia [116817]	AF224421
	AF224411
	AF224412
	AF224413
	AF224440
	AF224439
	AF224418
	AF224419
	AF224420
	AF224403
	AF224402
	AF224400
	AF224401
	AF224399
Hypogymnia physodes [87259]	AF141368		possibly IP 1521
	AF115761		possibly IP 1521
Physcia stellaris [116821]	AY498689
	AY303137
	AF224442
	AF224409
	AF224407
	AF224405
	AF224406
	AF224404
	AF224410
	AF224408
Rhizoplaca huashanensis [239500]	AY530885
Physcia alnophila [116811]	AF224434
	AF224381
	AF224380
	AF224382
Parmelia saxatilis [87261]	AF410836
	AF451772
	AF451771
	AF410835
	AF451770
	AF410837
	AF141370		possibly IP 1521
Physcia albinea [116810]	AF224433
Tornabea scutellifera [205647]	AJ549810
Rhizoplaca melanophthalma [112044]	AY509791
Arctocetraria nigricascens [124740]	AF254628
Cetraria ericetorum subsp. ericetorum [92079]	AF228290		possibly IP 1521
Cetraria nigricans [124737]	AF254629
	AF254630
Cetraria odontella [121111]	AF228304
	AF228285
	AF228303
Parmelia ernstiae [183580]	AF412310
	AF412309
Vulpicida pinastri [78078]	AF072239		possibly IP 1521
	AF139031		IP 1516? (possibly 1521)
Cetraria islandica [78064]	AF072225		possibly IP 1521
Cetraria islandica subsp. antarctica [121113]	AF254627
	AF228293
Cetraria islandica subsp. islandica [95628]	AF228297
	AF228299
	AF228298
	AF228296
Nephromopsis komarovii [180483]	AF451779
Bryoria fuscescens [172611]	AF451736
Cetraria arenaria [112441]	AF115758		possibly IP 1521
Cetraria islandica subsp. crispiformis [121112]	AF228294
	AF228295
Dactylina arctica [112443]	AF115760		possibly IP 1521
Asahinea chrysantha [180472]	AF451767
	AF451766
Physcia tenella var. marina [116823]	AF224426
	AF224424
Nephromopsis stracheyi [180486]	AF451785
Melanelia hepatizon [91758]	AF141369		possibly IP 1521
Physcia dimidiata var. dimidiata [116815]	AF224415
	AF224416
Cladonia mitis [195774]	AY170819
	AY170798
	AY170799
	AY170800
	AY170801
	AY170802
	AY170803
	AY170804
	AY170805
	AY170820
	AY170796
	AY170797
	AY170818
Pseudephebe pubescens [172637]	AF451738
Physcia adscendens [116809]	AF224422
	AF224430
	AF224423
Physcia dimidiata var. ornata [116816]	AF224414
Physcia leptalea [116818]	AF224441
	AF224428
	AF224429
Physcia phaea [116820]	AF224378
Rhizoplaca subdiscrepans [111843]	AY509804
	AY509805
	AY509789
Diplotomma epipolium [501307]	AJ506969
Physcia biziana [116812]	AF224417
Physcia tenella var. tenella [116824]	AF224427
	AF224425
Rinodina gennarii [221737]	AJ549808
Diplotomma alboatrum [205613]	AJ549802
Cladonia merochlorophaea [5200]	Z14025	a.I1	Formerly Cladonia merochlorophaea Asah
Physcia magnussonii [116819]	AF224376
	AF224377
Nephromopsis ahtii [170998]	AF404123		5' exon not present; genbank synonym: Tuckneraria ahtii
Physcia undulata [221732]	AJ549806
Cladonia grayi [27339]	Z14026	a.I1
Hyperphyscia adglutinata [116796]	AJ549803
Rinodina oxydata [205642]	AJ506971
Cladonia arbuscula [174044]	AY170806
	AY170810
	AY170811
	AY170812
	AY170815
	AY170816
	AY170795
	AY170794
	AY170793
	AY170807
	AY170808
	AY170809
	AY170813
	AY170814
	AY170817
Buellia aethalea [205603]	AJ549801