query: SELECT phylo,cell_loc,from_gene,rna_class,accession,structure,tax_id,organism,comment,site_pos,seq_size,seq_nbr,gr_id FROM subint WHERE phylo LIKE '%Rinodina%' AND cell_loc LIKE '%Nucleus%' AND (from_gene = '16S' OR from_gene = '23S') AND available = 'Y' AND ready = 'Y' AND ( percentage > 89 OR percentage = -1 OR seq_size = -1 ) ORDER BY phylo,cell_loc,from_gene,site_pos,rna_class,seq_nbr,organism
Phylogeny | Genus | L | EX | RC | Org | Acc | IP | Struct. | Comment | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Eukaryota | Fungi/Metazoa group | Fungi | Rinodina | N | 23S | I | Rinodina atrocinerea | AY773923 |
779 | ||
1094 | |||||||||||
AY773932 |
1921 | ||||||||||
2069 | |||||||||||
Rinodina capensis | AY773924 |
779 | |||||||||
1025 | |||||||||||
AY773938 |
2449 | ||||||||||
Rinodina milvina | AY773922 |
779 | |||||||||
1025 | |||||||||||
1094 | |||||||||||
Rinodina tunicata | AF457568 |
800 | |||||||||
AY773920 |
800 | ||||||||||
1025 | |||||||||||
1094 | |||||||||||
AF457569 |
1094 | ||||||||||
AY773939 |
2449 | ||||||||||
IE | Rinodina capensis | AY773938 |
2563 | ||||||||
Rinodina tunicata | AY773939 |
2563 | |||||||||
U | Rinodina tunicata | AF457568 |
777 | spliceosomal | |||||||
AY773920 |
777 | spliceosomal | |||||||||
1054 | spliceosomal; misannotated | ||||||||||
AF457569 |
1054 | spliceosomal | |||||||||
16S | I | Rinodina gennarii | AJ549808 |
287 | |||||||
943 | |||||||||||
1516 | |||||||||||
Rinodina oxydata | AJ506971 |
114 | |||||||||
497 | |||||||||||
516 | |||||||||||
940 | |||||||||||
1199 | |||||||||||
1389 | |||||||||||
1516 |